药物靶标

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基于多模态栈式混合自编码器的药物靶标相互作用预测
《计算机工程与应用》2024年第19期334-342,共9页张星宇 陈卓 黄印 原雨婷 李颖 王彬 
国家自然科学基金(62176177,62403344);山西省自然科学基金(20210302123112,20210302123092);山西省留学基金(2021-039)。
针对药物-靶标相互作用(drug-target interactions,DTI)预测中存在的单模态特征不足、多模态数据利用不充分、数据噪声大等问题,提出了一种基于多模态栈式混合自编码器(stacked hybrid autoencoder,SHADTI)的药物靶标相互作用预测方法。...
关键词：药物-靶标相互作用 多模态 自编码器 深度学习 
基于距离编码-图神经网络的药物靶标作用关系预测被引量：1
《小型微型计算机系统》2023年第12期2663-2670,共8页翁兴娜 高创 李建华 
国家重点研发计划项目(2016YFA0502304)资助。
图神经网络方法在药物靶标相互作用的预测任务上效果较好,但在图数据上仍存在无法分辨相同结构拓扑图和图网络中节点特征表达能力受限的问题.本文提出一种基于距离编码-图神经网络(Distance Encoding-Graph Neural Network)的药物靶标...
关键词：图神经网络 药物靶标相互作用 距离编码 节点表示 网络结构 
基于多层网络的相似性分析方法在高血压研究中的应用
《电子元器件与信息技术》2023年第10期197-202,共6页徐琼 
本文将所要研究的药物及药物靶标抽象为网络节点的形式,按照它们之间的相互作用关系构成多层网络,利用复杂网络的相关特性分析不同网络间节点的相似性。然后对药物和疾病表型间的相关性系数得分进行预测,进而对正在试验中的药物进行分析...
关键词：多层网络 生物网络 相似性分析 药物靶标 高血压 
Bert-DTA:基于混合编码策略的药物靶标亲和力预测
《运城学院学报》2023年第3期17-23,共7页娄英丹 杨志辉 赵聪 
药物靶标亲和力预测是一种筛选药物的新型方法,可以直观地根据蛋白质序列特点筛选候选药物,该方法不仅可以为临床提供指导,而且可以有效节省资源和时间。现代研究利用不同的编码方式对蛋白质或药物序列进行编码,进而提出不同深度学习模...
关键词：药物靶标亲和力 蛋白质编码 Bert 预训练 深度学习 
DBEncRNA:细菌必需非编码RNA数据库
《电子科技大学学报》2022年第3期348-352,共5页叶远浓 梁定发 曾柱 
国家自然科学基金(61803112,32160151);贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2019]2811号)。
细菌非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是近年来在细菌基因组内新发现的一类基因表达调控因子,与必需基因概念类似,有一部分ncRNA是生物体生存所必不可少的,称之为“必需非编码RNA”。因此,细菌的必需ncRNA可以作为药物开发的潜在靶标,...
关键词：抗菌药物靶标 数据库 必需非编码RNA 最小基因组 致病菌 
基于图卷积神经网络的药物靶标作用关系预测方法被引量：4
《计算机科学》2021年第10期127-134,共8页高创 李建华 季秀怡 朱程龙 李诗良 李洪林 
国家重点研发计划项目(2016YFA0502304);国家重大新药创制项目(2018ZX09735002)。
药物-靶标作用关系预测在药物研发以及药物重定位中扮演着重要角色,但现有的机器学习方法在正负样本高度不平衡的数据上仍存在预测能力不足的问题。为此,提出一种基于图卷积神经网络的药物靶标作用关系预测方法。该方法首先构造一个结...
关键词：图卷积神经网络 药物-靶标作用关系 异质信息网络 机器学习 向量表征 
基于组织特异性和直接邻居相似度方法预测疾病–药物关系被引量：2
《中国科学：信息科学》2019年第9期1175-1185,共11页鱼亮 赵晋 
国家重点研发计划(批准号:2018YFC0910403);国家自然科学基金面上项目(批准号:61672406);中央高校基本科研业务费(批准号:JB180307)资助项目
复杂疾病的致病机理一直是人类健康领域面临的重大难题之一,通过传统的方法进行新药开发,需要大量的时间与金钱,已经满足不了人们的需求.近几年来寻找已知药物新的治疗效果,即药物重定位,已经成为治疗更多疾病的一个有效途径.目前组织...
关键词：药物重定位 组织特异性 药物靶标 致病基因 直接邻居度量 
药物靶标作用关系预测结果评价及查询验证被引量：3
《计算机研究与发展》2019年第9期1881-1888,共8页余冬华 郭茂祖 刘晓燕 程爽 
国家自然科学基金项目(61871020,61571164,61671189);北京市教委科技计划重点项目(KZ201810016019);北京建筑大学市属高校基本科研业务费专项资金(X18197,X18198,X18203)~~
药物靶标作用关系预测是一种重要的辅助药物研发手段,而生物实验验证药物靶标作用关系耗钱耗时,因此,在数据库中查询验证预测的药物靶标作用关系是对预测方法的重要评价.基于KEGG,DrugBank,ChEMBL这3个数据库,利用爬虫获取信息的方式设...
关键词：药物靶标作用关系预测 查询验证 药物靶标数据集 AUC评价 TOP N评价 
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