刘晓燕

作品数:40被引量:175H指数:7
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供职机构:哈尔滨工业大学更多>>
发文主题:高层结构知识发现智能选型高层建筑蛋白质相互作用更多>>
发文领域:自动化与计算机技术建筑科学生物学天文地球更多>>
发文期刊:《地震工程与工程振动》《智能计算机与应用》《中国科学:信息科学》《海洋通报》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金中央高校基本科研业务费专项资金黑龙江省自然科学基金更多>>
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结合注意力机制和本体的远程监督关系抽取被引量:2
《计算机科学与探索》2020年第9期1554-1562,共9页李艳娟 臧明哲 刘晓燕 刘扬 郭茂祖 
国家自然科学基金(No.61901103);黑龙江省自然科学基金(No.LH2019F002).
关系抽取是从非结构化的文本中抽取关系,并以结构化的形式输出。为了提高抽取准确性并降低对人工标注的依赖,提出了基于注意力机制和本体的远程监督关系抽取模型(APCNNs+OR)。该模型分为特征工程提取模块、分类器模块、本体约束层。在...
关键词:关系抽取 本体 远程监督 注意力机制 
基于XGBoost的质量性状基因互作检测方法被引量:1
《智能计算机与应用》2020年第3期202-208,共7页郭颖婕 李傲 刘晓燕 郭茂祖 
国家自然科学基金(61571163,61532014,61671189);国家重点研发计划项目(2016YFC0901902)。
在质量性状全基因组关联分析GWAS中,以基因作为研究单位的基因-基因相互作用检测方法,以其在统计效力与生物可解释性方面的优势备受关注。然而现有方法中多数对基因之间互作形式给出了强假设,降低了算法对互作关系的检测性能。针对已有...
关键词:XGBoost 基因相互作用 单核苷酸多态性位点 质量性状 全基因组关联分析 
基于显著图的弱监督实时目标检测被引量:4
《自动化学报》2020年第2期242-255,共14页李阳 王璞 刘扬 刘国军 王春宇 刘晓燕 郭茂祖 
国家重点基础研究发展计划(2016YFC0901902);国家自然科学基金(61671188,61571164,61976071,61871020)资助~~
深度卷积神经网络(Deep convolutional neural network,DCNN)在目标检测任务上使用目标的全标注来训练网络参数,其检测准确率也得到了大幅度的提升.然而,获取目标的边界框(Bounding-box)标注是一项耗时且代价高的工作.此外,目标检测的...
关键词:弱监督 实时目标检测 显著图 伪标注 深度卷积神经网络 
改进选择策略的烟花算法被引量:11
《控制与决策》2020年第2期389-395,共7页余冬华 郭茂祖 刘晓燕 刘国军 
国家自然科学基金项目(61571163,61532014,61671189,91735306);国家重点研发计划课题(2016YFC0901902).
烟花算法(FWA)中的选择策略直接影响其收敛效率、收敛精度、对初值敏感性以及能否跳出局部最优,对此,提出一种改进选择策略的烟花算法(ISSFWA).ISSFWA建立峰值火花和探索火花的概念,并提出基于N-1朵峰值火花和一朵探索火花充当下一代N...
关键词:群体智能 最优化 烟花算法 选择策略 峰值火花 
药物靶标作用关系预测结果评价及查询验证被引量:3
《计算机研究与发展》2019年第9期1881-1888,共8页余冬华 郭茂祖 刘晓燕 程爽 
国家自然科学基金项目(61871020,61571164,61671189);北京市教委科技计划重点项目(KZ201810016019);北京建筑大学市属高校基本科研业务费专项资金(X18197,X18198,X18203)~~
药物靶标作用关系预测是一种重要的辅助药物研发手段,而生物实验验证药物靶标作用关系耗钱耗时,因此,在数据库中查询验证预测的药物靶标作用关系是对预测方法的重要评价.基于KEGG,DrugBank,ChEMBL这3个数据库,利用爬虫获取信息的方式设...
关键词:药物靶标作用关系预测 查询验证 药物靶标数据集 AUC评价 TOP N评价 
基于Convolutional-LSTM的蛋白质亚细胞定位研究被引量:2
《计算机科学与探索》2019年第6期982-989,共8页王春宇 徐珊珊 郭茂祖 车凯 刘晓燕 
国家自然科学基金Nos.91735306,61671189,61571163,61532014;国家重点研发计划课题No.2016YFC0901902~~
蛋白质亚细胞位置预测研究是目前蛋白质组学和生物信息学研究的重点问题之一。蛋白质的亚细胞定位决定了它的生物学功能,故研究亚细胞定位对了解蛋白质功能非常重要。由于蛋白质结构的序列性,考虑使用序列模型来进行亚细胞定位研究。尝...
关键词:蛋白质亚细胞定位 卷积神经网络(CNN) 长短期记忆神经网络(LSTM) 分类 
一种预测miRNA与疾病关联关系的矩阵分解算法被引量:2
《智能系统学报》2018年第6期897-904,共8页刘晓燕 陈希 郭茂祖 车凯 王春宇 
国家自然科学基金项目(61671189;61571163;61532014;91735306);国家重点研发计划课题(2016YFC0901902)
越来越多的证据表明microRNAs(miRNAs)在生命进程中发挥着重要作用。近年来,预测miRNAs与疾病的关联关系成为一个研究热点。然而,现有的方法大多数是基于已知的miRNA-疾病关联,对没有任何关联信息的miRNA或疾病的效果是很不理想的。本...
关键词:MICRORNAS 疾病 关联预测 矩阵分解 迭代最小二乘 
水稻组织特异性蛋白质相互作用网络构建方法
《哈尔滨工业大学学报》2018年第11期1-9,共9页邢林林 郭茂祖 刘晓燕 李傲 
国家自然科学基金(61571163;61532014;61671189;91735306);国家重点研发计划课题(2016YFC0901902)
组织特异的基因表达和蛋白质相互作用是研究基因调控、蛋白质功能、细胞过程的重要部分.相较于其他模式生物在蛋白质相互作用研究方面的进展,高等模式植物水稻中组织特异性蛋白质相互作用的研究十分缺乏.因此,提出了一种用于水稻组织特...
关键词:组织特异基因 同源映射 蛋白质-蛋白质相互作用 组织特异的蛋白质相互作用 
基于U统计量和集成学习的基因互作检测方法被引量:1
《计算机研究与发展》2018年第8期1683-1693,共11页郭颖婕 刘晓燕 吴辰熙 郭茂祖 李傲 
国家自然科学基金项目(61571163;61532014;61671189);国家重点研发计划项目(2016YFC0901902)~~
在全基因组关联研究GWAS中,多数方法对疾病与单核苷酸多态性位点之间的互作关系形式给出了强假设,这降低了相关方法的挖掘能力.近几年,以基因作为研究单位的基因-基因相互作用检测方法,因其在统计效力与生物可解释性方面的优势受到重视...
关键词:U统计量 集成学习 基因相互作用 单核苷酸多态性位点 全基因组关联研究 
基于组合模型的转录调控网络构建算法研究被引量:2
《计算机科学与探索》2018年第7期1154-1161,共8页刘晓燕 张诚诚 郭茂祖 邢林林 
国家自然科学基金Nos.61571163;61532014;61671189;91735306;国家重点研发计划课题No.2016YFC0901902~~
转录调控网络一直是系统生物学和生物信息学领域的一个研究热点。构建转录调控网络为揭示细胞内的生化反应机制提供了重要的手段。目前该领域的研究存在生物数据利用不充分,基因转录调控网络构建精度低等问题,尤其是在比较大的数据集上...
关键词:转录调控网络 深度自编码器 XGBoost 逻辑回归 
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