蛋白质结构预测

作品数：225被引量：488H指数：9
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蛋白质结构预测聚类算法的评估
《计算机工程》2011年第1期24-27,共4页黄旭 吕强 钱培德 
国家自然科学基金资助项目(60970055)
在7个数据集上对3种不同聚类算法与3种不同相似性度量标准的多种组合进行实验,以评估这些因素对聚类性能的影响。为便于确定聚类参数,提出一种针对蛋白质结构预测的聚类中心选择算法。实验结果表明,在3种相似性度量标准中,RMSD对于聚类...
关键词：蛋白质结构预测 候选结构 聚类算法 相似性度量 评估 
基于柔性神经树的蛋白质结构预测被引量：2
《计算机工程》2011年第1期159-160,163,共3页黄秀 陈月辉 曹毅 
国家自然科学基金资助项目(60573065);山东省自然科学基金资助项目(Y2007G33)
提出一种基于柔性神经树的蛋白质结构预测方法,将近似熵和蛋白质序列的疏水特性作为伪氨基酸组成的特征。对数据集中的每一条蛋白质进行特征提取。对于一个蛋白质样本,用一个27-D伪氨基酸组成作为其特征,伪氨基酸组成特征作为输入数据,...
关键词：蛋白质结构分类 伪氨基酸组成 近似熵 疏水性 柔性神经树 
基于能量的蛋白质结构聚类距离加权策略被引量：1
《计算机工程》2010年第21期173-174,177,共3页黄旭 吕强 吴进珍 钱培德 
国家自然科学基金资助项目(60970055)
在对蛋白质预测结构进行聚类的过程中,常用的均方根偏差、TM-score、GDT-TS等相似性度量方法仅反映了结构之间的距离关系而未考虑结构之间的能量关系。针对上述问题,对候选结构进行距离度量,计算两两之间的能量差异,并以此设置权重,对...
关键词：蛋白质结构预测 聚类算法 均方根偏差 相似性矩阵 
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