蛋白质进化

作品数:15被引量:12H指数:2
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草酸脱羧酶的进化和异源表达对罗伊氏乳杆菌草酸盐降解能力的影响
《济南大学学报(自然科学版)》2025年第2期306-312,共7页牛冬玉 孔令慧 刘向勇 秦加阳 
国家自然科学基金项目(32302050);山东省自然科学基金项目(ZR2022QC004)。
为了开发能够治疗或辅助治疗高草酸尿症的益生菌,采用基于深度学习的方法对枯草芽孢杆菌的草酸脱羧酶(OXDC)进行蛋白质进化,并在罗伊氏乳杆菌Limosilactobacillus reuteri Q35中异源表达野生型OXDC和2个预测催化常数更大的突变型OXDC-M5...
关键词:蛋白质进化 草酸盐降解 异源表达 罗伊氏乳杆菌 草酸脱羧酶 
基于AlphaFold数据库分析蛋白质进化中的统计规律被引量:1
《集成技术》2024年第2期74-88,共15页夏辰亮 唐乾元 
江苏省高等学校自然科学研究项目(22KJD14005);香港研究资助局杰出青年学者计划(22302723)。
由DeepMind开发的AlphaFold在蛋白质结构预测领域取得了前所未有的巨大突破,对生命科学的研究产生了革命性的影响。基于大规模的结构预测,AlphaFold结构预测数据库得以建立,它包含2亿多种蛋白,并覆盖了数十种物种的完整蛋白质组。该综...
关键词:AlphaFold 蛋白质 进化 蛋白质动力学 简正模分析 统计物理 
新算法揭示蛋白质进化秘密
《光学精密机械》2023年第3期25-25,共1页
一个国际科研团队在出版的《自然》杂志上刊发论文称,他们开发出一种新算法,来比较“阿尔法折叠”数据库中所有已预测蛋白质的结构,揭示了不同物种蛋白质之间的相似性。最新研究结果有助科学家理解蛋白质的进化历程,并为人类免疫蛋白质...
关键词:数据库 科研团队 阿尔法 进化历程 相似性 蛋白质 新算法 
蛋白质结构的“限域下最低能量结构片段”假说与蛋白质进化的“石器时代”被引量:3
《物理化学学报》2020年第1期103-112,共10页曹傲能 
国家自然科学基金(31871007,31571024);国家重点研发计划(2016YFA0201600)资助项目.
蛋白质折叠问题被称为第二遗传密码,至今未破译;蛋白质序列的天书仍然是"句读之不知,惑之不解"。在最近工作的基础上,我们提出了蛋白质结构的"限域下最低能量结构片段"假说。这一假说指出,蛋白质中存在一些关键的长程强相互作用位点,这...
关键词:蛋白质折叠 多肽 生命起源前 杂合体 人工蛋白质 金抗体 
链霉亲和素及其亲和系统的蛋白质进化被引量:2
《中国生物化学与分子生物学报》2019年第7期722-729,共8页张檬 罗棉兴 陈国 
国家自然科学基金(No.21576108);福建省新世纪优秀人才项目资助;华侨大学研究生科研创新基金资助项目~~
链霉亲和素/生物素(Streptavidin/Biotin)体系作为目前已知的最高亲和力作用体系,已在生物学研究中获得广泛应用。本文针对Streptavidin/Biotin和Strep-Tactin/Strep-tag两个相关系统的演化,分别从链霉亲和素蛋白的结构改造、亲和肽标...
关键词:链霉亲和素 亲和系统 亲和肽标签 蛋白质进化 
核糖体展示研究进展被引量:3
《生物技术通报》2016年第8期22-27,共6页郭园 
核糖体展示是一种无细胞系统,可以从文库中筛选蛋白质和多肽。翻译的蛋白质及其mRNA同时结合在核糖体上形成mRNA-核糖体-蛋白质三聚体,通过配体亲和分离得到功能性蛋白及其编码的mRNA,转换成对应的DNA后进行相关蛋白的表达,可用于抗体...
关键词:核糖体展示 抗体 选择 蛋白质进化 
基于蛋白质进化配对的残基间距离约束挖掘方法
《计算机科学》2015年第7期262-264,299,共4页王彩霞 吕强 李海鸥 罗升 
国家自然科学基金(61170125)资助
蛋白质的进化配对是指在进化过程中残基对之间形成的相对稳定的相互作用。基于已被发现的进化配对,采用机器学习的分类技术,将其转换成残基对之间的距离约束,从而将一种定性的残基对之间的相互作用挖掘为定量的距离约束,这为蛋白质的结...
关键词:进化配对 距离约束 支持向量机 
遗传密码扩充技术在蛋白质研究中的应用进展被引量:1
《中国生化药物杂志》2011年第4期328-331,共4页刘亚光 方正之 姚文兵 
博士点基金(20090096110006);"青蓝工程"资助
生命科学发展需要获得进化的蛋白质来满足科学研究的需要,在蛋白质中引入非天然氨基酸从而赋予其更多的功能成为蛋白质进化的一个重要手段。一项遗传密码扩充技术很好的实现了在体内定点引入非天然氨基酸,这项技术的关键是获得一对正交...
关键词:蛋白质进化 非天然氨基酸 定点引入 遗传密码扩充 氨酰tRNA合成酶/tRNA分子对 
研究显示蛋白质进化难以逆转
《东北农业大学学报》2009年第10期121-121,共1页
生物进化是否可逆一直是人们感兴趣的问题。最新一期英国《自然》杂志刊登的研究报告说,分子水平的实验显示,蛋白质一旦向前进化,便难以原路返回过去的状态。
关键词:生物进化 蛋白质 显示 逆转 《自然》杂志 分子水平 
《自然》:研究显示蛋白质进化难以逆转
《现代生物医学进展》2009年第18期I0001-I0001,共1页
生物进化是否可逆一直是人们感兴趣的问题。最新一期英国《自然》杂志刊登的研究报告说。分子水平的实验显示,蛋白质一旦向前进化,便难以原路返回过去的状态。
关键词:《自然》杂志 生物进化 蛋白质 显示 逆转 分子水平 
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