蛋白质亚细胞定位

作品数:51被引量:108H指数:5
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相关机构:云南大学济南大学南京农业大学湖南大学更多>>
相关期刊:《计算机仿真》《山东师范大学学报(自然科学版)》《山东医药》《生物化学与生物物理进展》更多>>
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PSO_BFA优化词袋模型及蛋白质亚细胞定位预测被引量:2
《计算机工程与应用》2020年第1期165-171,共7页胡雪娇 陈行健 赵南 薛卫 
中央高校基本科研业务费专项资金(No.KYZ201668)
提出了一种基于PSO_BFA优化的词袋模型。传统词袋模型有两个重要参数:窗口大小d和字典大小k。结合粒子群算法和细菌觅食算法产生新的PSO_BFA混合优化算法,在PSO进行局部搜索时,加入BFA的复制和迁移行为,得到PSO_BFA的最优解即为窗口大...
关键词:词袋模型 粒子群算法 细菌觅食 亚细胞定位预测 
基于SVM的蛋白质亚细胞定位预测被引量:4
《计算机工程与应用》2019年第11期136-141,共6页刘清华 赖裕平 丁洪伟 杨志军 崔晓龙 
国家自然科学基金(No.61461053,No61461054,No.61072079)
首先基于特征融合思想,采用氨基酸组成、熵密度和自相关系数结合的方式构建190维特征向量进行特征表达,与仅考虑氨基酸组成信息的传统方法相比,能更好地表达蛋白质结构信息。然后利用LDA(Linear Discriminant Analysis)方法进行降维,降...
关键词:特征融合 熵密度 自相关系数 线性判别分析(LDA) 支持向量机 
一种新的蛋白质亚细胞定位预测方法被引量:1
《计算机工程与应用》2012年第6期126-128,共3页程昔恩 吴志诚 
国家自然科学基金(No.60961003);江西省自然科学基金(No.2010GQS0127)
蛋白质亚细胞定位是蛋白质组学基本问题之一。某些类型蛋白质可能存在于两个或两个以上的亚细胞位置,这类蛋白质的亚细胞定位问题更为复杂。分别利用Gene Ontology和伪氨基酸成分法,将一条蛋白质表示为一实值向量;采纳多标记学习中的Ran...
关键词:蛋白质亚细胞定位 多标记学习 GENE ONTOLOGY 最近邻算法 
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