蛋白质折叠

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带有停滞检测的蚁群算法在2D HP格点模型中的应用
《计算机应用与软件》2016年第2期227-231,共5页刘羽 熊壬浩 
国家自然科学基金项目(41264005);广西教育厅科研项目(201102ZD018)
为了提高蛋白质折叠结构预测的求解效率,针对2D HP格点模型,研究蚁群ACO(Ant Colony Optimization)算法在该问题上的应用。采用四元组表示绝对的折叠方向,并建立构象和解的一一对应关系。通过实验对算法各阶段的常用策略、方法进行比较...
关键词:HP模型 蛋白质折叠 蚁群算法 停滞检测 遗传算法 
改进的牵引移动的蚁群算法在2D HP模型中的应用
《计算机应用与软件》2015年第3期275-278,共4页高翔 杨惠 张成文 
甘肃省教育厅研究生导师项目(1215_04)
蛋白质折叠问题就是从氨基酸序列中预测蛋白质的构象,该问题是生物信息学的一个突出问题。主要研究二维HP格点模型,它是用于模拟蛋白质折叠问题的一个具有代表性的简化模型,并且将蚁群算法用于求解该二维HP蛋白质的折叠问题。此外,在局...
关键词:蛋白质折叠 HP模型 牵引移动 蚁群优化 
蛋白质折叠问题的蚁群优化算法研究被引量:2
《计算机应用与软件》2013年第8期297-301,329,共6页侯金彪 
蛋白质是一类重要的生物大分子,在生物体内占有特殊的地位,是生命的主要承担者。而研究蛋白质的折叠,是生命科学领域的前沿课题之一。在概述蚁群算法及2D HP蛋白质模型的基础上,针对蛋白质折叠问题提出一种蚁群优化算法,并用几个比较典...
关键词:蛋白质折叠 蚁群算法 格点模型 
基于改进的模拟退火算法的蛋白质折叠研究被引量:1
《计算机应用与软件》2009年第12期24-26,共3页徐贞如 王晓明 
国家自然科学基金项目(70371063)
采用改进的模拟退火算法,搜索出最小自由能的蛋白质的三维结构,并根据组成该蛋白质的每个氨基酸的空间位置和属性,利用Java3D技术对其结构进行仿真。计算结果证明,该方法能在较短的时间内根据蛋白质的二级结构预测出其最小自由能的蛋白...
关键词:蛋白质折叠 改进的模拟退火算法 计算机仿真 
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