刘太元

作品数：8被引量：5H指数：1
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供职机构：中国科学院自动化研究所更多>>
发文主题：参数估计参数辨识方法概率密度函数动态系统直方图更多>>
发文领域：生物学理学自然科学总论自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《计算机仿真》《计算机与应用化学》《生物物理学报》《生物数学学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金中国科学院海外杰出学者基金更多>>
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采用Levenberg-Marquardt算法的信号转导通路模型参数估计被引量：1
《生物医学工程学杂志》2009年第1期22-29,共8页刘太元 贾建芳 王宏 岳红 
国家自然科学基金资助项目(30770560);中国科学院海外杰出学者基金资助项目(2004-1-4)
建立信号转导通路的数学模型,以便定量对其进行研究是系统生物学的一个基本任务,但是,参与信号转导通路的蛋白质众多,相互关系复杂,以及信号转导通路表现出的强非线性特性使模型未知参数的估计十分困难。以肿瘤坏死因子α(Tumor necrosi...
关键词：系统生物学 参数估计 参数可辨识性 信号转导通路Levenberg—Marquardt算法 
细胞信号转导网络模型简化的一种混合推理方法
《中国科学院研究生院学报》2008年第3期355-366,共12页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
国家自然科学基金项目(30770560)资助
细胞信号转导网络的结构复杂,规模庞大,建立的数学模型维数高,变量多,具有高度非线性.在复杂系统分析设计中,模型简化始终是主要的研究问题之一.本文提出一种基于混合推理方法的模型简化策略,利用代谢控制分析、敏感性分析、主元分析和...
关键词：细胞信号转导网络 模型简化 混合推理方法 系统生物 
一类信号转导通路模型参数辨识中最小应测量状态的确定
《生物数学学报》2008年第3期569-575,共7页刘太元 贾建芳 王宏 岳红 郭欣兰 
国家自然科学基金资助(60472065;60534010;30770560)
建立信号转导通路的数学模型是系统生物学的一个重要目标.但是信号转导通路本身的复杂结构及其所表现出的强非线性特征,使得对该类模型的参数辨识十分困难.参数辨识所需要的测量数据的选择对于辨识结果有重要影响.本文研究了一类信号转...
关键词：系统生物学 参数估计 参数可辨识性 测量数据集合 信号转导通路 
基于Morris法的细胞信号转导网络全局灵敏性分析被引量：4
《计算机与应用化学》2008年第1期7-10,共4页贾建芳 岳红 刘太元 王宏 
国家自然科学基金(60472065；30770560)
细胞信号转导网络的结构复杂和动力学参数的不确定影响着系统的动态特性,如何定量系统输出与参数变化的关系,以及参数间的相互影响,已经成为系统生物学研究的重要问题之一。以TNF-α诱导NF-kB信号转导网络作为研究对象,采用Morris法的...
关键词：全局灵敏性分析 Morris方法 细胞信号转导网络 
细胞信号转导网络输入信号的最优实验设计
《计算机与应用化学》2007年第8期1033-1038,共6页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
中国科学院海外杰出学者基金(2004-1-4)
细胞信号转导网络的结构复杂,规模庞大,具有高度非线性,数学模型的参数和变量数目很多,有效估计未知参数是系统生物学主要的研究问题之一。提出以Fisher信息矩阵和估计参数的协方差矩阵为基础,利用不同的优化实验设计方法,研究NF-κB信...
关键词：最优实验设计 Fisher信息矩阵 细胞信号转导网络 参数估计 
基于蒙特卡洛方法的信号转导网络鲁棒性分析被引量：1
《计算机仿真》2007年第10期295-299,共5页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
细胞信号转导网络内部结构的复杂性和动力学参数的不确定性影响着系统的动态特性,如何定量地确定系统特性与参数变化的关系,已经成为系统生物研究的重要问题之一。为了研究NF-κB信号转导网络的鲁棒性,应用蒙特卡洛(Monte-Carlo)随机模...
关键词：信号转导网络 鲁棒性分析 蒙特卡洛方法 系统生物 
基于TNF-α诱导NF-κB信号转导网络的参数敏感性分析与模型简化
《中国科学院研究生院学报》2007年第2期207-216,共10页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
中国科学院海外杰出学者基金项目(2004-1-4)资助
为了研究核转录因子kappa B(NF-κB)信号转导网络的内部结构和相互关联的参数对系统输出信号的影响,进行参数敏感性分析和系统模型简化是十分必要的.通过对基于TNF-α诱导的NF-κB信号转导网络数学模型进行分析,选择IKK作为系统的阶跃...
关键词：敏感性分析 模型简化 NF-κB信号转导网络 直接微分法 
基于Unscented卡尔曼滤波器的信号转导通路参数与不可观测状态估计被引量：1
《生物物理学报》2007年第1期54-66,共13页刘太元 贾建芳 王宏 岳红 
中国科学院海外杰出学者基金项目(2004-1-4)~~
系统生物学的一个主要目的是建立细胞信号转导通路的数学模型。然而细胞信号转导通路多具有较强非线性、参与生化反应物质多等特点,同时测量数据往往不完备,并且混有来自实验各个阶段的各种噪声,这些都给模型参数估计带来很大困难。该...
关键词：系统生物学 Unscented卡尔曼滤波器 参数估计 信号转导通路 
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