岳红

作品数：23被引量：98H指数：6
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供职机构：中国科学院自动化研究所更多>>
发文主题：参数估计系统生物学分子量分布细胞信号转导网络信号转导通路更多>>
发文领域：自动化与计算机技术生物学理学自然科学总论更多>>
发文期刊：《模式识别与人工智能》《计算机与应用化学》《生物物理学报》《控制工程》更多>>
所获基金：国家自然科学基金中国科学院海外杰出学者基金“九五”国家科技攻关计划海外青年学者合作研究基金更多>>
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系统方法分析NF-κB信号转导网络产生持续振荡的条件被引量：2
《生物物理学报》2010年第5期406-420,共15页鲁保云 岳红 
国家自然科学基金项目(30770560)~~
振荡现象在生物系统中普遍存在,研究振荡现象对进一步了解细胞网络的基因调节功能具有重要意义。与实验研究相结合的系统分析方法为生物网络的振荡行为提供了新的研究途径。NF-κB是免疫应答、炎症反应和机体发育过程中的关键转录因子,...
关键词：稳态特性 持续振荡(极限环) 分岔分析 NF-κB信号转导网络 
信号转导网络的动态敏感性与振荡特性分析
《四川大学学报（工程科学版）》2010年第2期171-176,共6页贾建芳 岳红 
国家自然科学基金资助项目(30770560);山西省青年科技研究基金资助项目(2009021018-1);教育部博士点新教师基金资助项目(20091420120007)
为了理解细胞信号转导网络作为非线性动态自治系统的复杂性、系统内在的控制机理和系统的鲁棒性,提出从信息科学和控制工程的观点出发研究细胞网络的系统动态特性。以NF-κB信号转导网络为例,利用动态敏感性分析和非线性动力学分析等方...
关键词：信号转导网络 动态敏感性分析 振荡特性 极限环 负反馈 
采用Levenberg-Marquardt算法的信号转导通路模型参数估计被引量：1
《生物医学工程学杂志》2009年第1期22-29,共8页刘太元 贾建芳 王宏 岳红 
国家自然科学基金资助项目(30770560);中国科学院海外杰出学者基金资助项目(2004-1-4)
建立信号转导通路的数学模型,以便定量对其进行研究是系统生物学的一个基本任务,但是,参与信号转导通路的蛋白质众多,相互关系复杂,以及信号转导通路表现出的强非线性特性使模型未知参数的估计十分困难。以肿瘤坏死因子α(Tumor necrosi...
关键词：系统生物学 参数估计 参数可辨识性 信号转导通路Levenberg—Marquardt算法 
细胞信号转导网络模型简化的一种混合推理方法
《中国科学院研究生院学报》2008年第3期355-366,共12页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
国家自然科学基金项目(30770560)资助
细胞信号转导网络的结构复杂,规模庞大,建立的数学模型维数高,变量多,具有高度非线性.在复杂系统分析设计中,模型简化始终是主要的研究问题之一.本文提出一种基于混合推理方法的模型简化策略,利用代谢控制分析、敏感性分析、主元分析和...
关键词：细胞信号转导网络 模型简化 混合推理方法 系统生物 
一类信号转导通路模型参数辨识中最小应测量状态的确定
《生物数学学报》2008年第3期569-575,共7页刘太元 贾建芳 王宏 岳红 郭欣兰 
国家自然科学基金资助(60472065;60534010;30770560)
建立信号转导通路的数学模型是系统生物学的一个重要目标.但是信号转导通路本身的复杂结构及其所表现出的强非线性特征,使得对该类模型的参数辨识十分困难.参数辨识所需要的测量数据的选择对于辨识结果有重要影响.本文研究了一类信号转...
关键词：系统生物学 参数估计 参数可辨识性 测量数据集合 信号转导通路 
基于LHS方法NF-κB信号转导网络的多参数敏感性分析被引量：3
《应用基础与工程科学学报》2008年第4期605-615,共11页贾建芳 岳红 王宏 
国家自然科学基金资助(30770560)
细胞信号转导网络的复杂结构和动力学参数的不确定影响着系统的动态特性,如何定量确定参数变化对系统输出的影响,已经成为系统生物学研究的重要问题之一.以TNF-α诱导NF-κB信号转导网络为例,假定模型参数在其变化范围服从均匀分布,采...
关键词：NF-kB信号转导网络 多参数敏感性分析 Latin超立方抽样 系统生物学 
基于Morris法的细胞信号转导网络全局灵敏性分析被引量：4
《计算机与应用化学》2008年第1期7-10,共4页贾建芳 岳红 刘太元 王宏 
国家自然科学基金(60472065；30770560)
细胞信号转导网络的结构复杂和动力学参数的不确定影响着系统的动态特性,如何定量系统输出与参数变化的关系,以及参数间的相互影响,已经成为系统生物学研究的重要问题之一。以TNF-α诱导NF-kB信号转导网络作为研究对象,采用Morris法的...
关键词：全局灵敏性分析 Morris方法 细胞信号转导网络 
细胞信号转导网络输入信号的最优实验设计
《计算机与应用化学》2007年第8期1033-1038,共6页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
中国科学院海外杰出学者基金(2004-1-4)
细胞信号转导网络的结构复杂,规模庞大,具有高度非线性,数学模型的参数和变量数目很多,有效估计未知参数是系统生物学主要的研究问题之一。提出以Fisher信息矩阵和估计参数的协方差矩阵为基础,利用不同的优化实验设计方法,研究NF-κB信...
关键词：最优实验设计 Fisher信息矩阵 细胞信号转导网络 参数估计 
基于蒙特卡洛方法的信号转导网络鲁棒性分析被引量：1
《计算机仿真》2007年第10期295-299,共5页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
细胞信号转导网络内部结构的复杂性和动力学参数的不确定性影响着系统的动态特性,如何定量地确定系统特性与参数变化的关系,已经成为系统生物研究的重要问题之一。为了研究NF-κB信号转导网络的鲁棒性,应用蒙特卡洛(Monte-Carlo)随机模...
关键词：信号转导网络 鲁棒性分析 蒙特卡洛方法 系统生物 
基于TNF-α诱导NF-κB信号转导网络的参数敏感性分析与模型简化
《中国科学院研究生院学报》2007年第2期207-216,共10页贾建芳 刘太元 岳红 王宏 
中国科学院海外杰出学者基金项目(2004-1-4)资助
为了研究核转录因子kappa B(NF-κB)信号转导网络的内部结构和相互关联的参数对系统输出信号的影响,进行参数敏感性分析和系统模型简化是十分必要的.通过对基于TNF-α诱导的NF-κB信号转导网络数学模型进行分析,选择IKK作为系统的阶跃...
关键词：敏感性分析 模型简化 NF-κB信号转导网络 直接微分法 
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