吕志鹏

作品数:11被引量:85H指数:4
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供职机构:华中科技大学更多>>
发文主题:局部搜索算法PERM蛋白质折叠拟人算法局部搜索更多>>
发文领域:自动化与计算机技术生物学理学电气工程更多>>
发文期刊:《小型微型计算机系统》《中国科学:信息科学》《科学通报》《计算机研究与发展》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家教育部博士点基金更多>>
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求解增量二分图优化问题的动态规划驱动的局部搜索算法被引量:2
《中国科学:信息科学》2021年第4期582-601,共20页彭博 卢晨贝 赵岳虎 苏宙行 廖毅 吕志鹏 
中央高校基本科研业务费专项资金(批准号:JBK1901011,JBK190504);智能信息处理与实时工业系统湖北省重点实验室基金(批准号:znxx2018QN01)资助项目。
增量二分图优化问题(dynamic bipartite drawing problem,DBDP)是一个具有NP难度的组合优化问题,该问题在实际生产生活中有着广泛的应用.本文提出了一种新的动态规划驱动的局部搜索(DP-LS)算法来求解该问题.不同于文献中求解该问题和该...
关键词:增量二分图优化问题 动态规划 局部搜索 增量评估机制 
求解多阶段护士排班问题的带权禁忌搜索算法被引量:5
《中国科学:信息科学》2016年第7期834-854,共21页苏宙行 王卓 吕志鹏 
国家自然科学基金(批准号:61370183;61100144);2013教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目
本文研究了多阶段护士排班问题,该问题由第2届国际护士排班竞赛提出,在医疗优化领域具有重要的意义.针对多阶段护士排班问题,本文提出了一种带权禁忌搜索算法.该算法使用了3种互斥的简单邻域结构与一种复合邻域结构,并根据其适应性动态...
关键词:护士排班 禁忌搜索 时刻表规划 人员排班 元启发式 组合优化 
求解最小连通支配集问题的变深度邻域搜索算法被引量:3
《中国科学:信息科学》2016年第4期445-460,共16页王灵敏 周淘晴 吴歆韵 吕志鹏 
国家自然科学基金(批准号:61370183;61100144);2013教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目
本文提出了一种求解最小连通支配集问题的变深度邻域搜索(VDNS)算法.结合最小连通支配集问题的特点,VDNS算法采用了一种高效的邻域结构,该邻域结构由一系列基础邻域动作组成,合理地限制了搜索空间,提高了算法的搜索效率.同时,本文还提...
关键词:元启发式算法 变深度邻域搜索 邻域结构 最小连通支配集 增量更新 
求解大规模云计算负载均衡问题的局部搜索算法被引量:3
《中国科学:信息科学》2015年第5期587-604,共18页王卓 吕志鹏 叶涛 
国家自然科学基金(批准号:61100144);教育部博士点基金(批准号:20110142120081)资助项目
本文研究了云计算负载均衡问题,该问题是2012年ROADEF/EURO挑战赛的主题.ROADEF/EURO挑战赛由法国运筹学会和欧洲运筹学会共同发起,其目的在于聚集国际学术界的研究力量,帮助工业界攻克迫切需要解决的核心技术难题.本次ROADEF/EURO 201...
关键词:云计算负载均衡 机器再分配 Google竞赛 NP难问题 局部搜索 邻域划分 
基于P2HP平台的蛋白质折叠分布式计算被引量:3
《计算机工程》2008年第9期109-111,共3页刘宇 吕志鹏 罗飞 
通过对基于格点模型的PERM算法进行定性分析,提出并行化计算PERM算法的策略。该策略保存了PERM算法中最关键的平均权重向量,并分发至多个计算单元进行模拟运算,从而达到减少计算时间、提高运算结果精确度的目的。以P2HP为计算平台,对多...
关键词:蛋白质折叠 分布式计算 对等网络 
求解HP模型蛋白质折叠问题的改进PERM算法被引量:7
《计算机研究与发展》2007年第9期1456-1461,共6页陈矛 黄文奇 吕志鹏 
国家自然科学基金项目(10471051);国家"九七三"重点基础研究发展规划基金项目(2004CB318000)
pERM是一种用来求解基于HP模型的蛋白质折叠问题的高效算法.在介绍PERM算法核心思想的基础上,对影响算法效率的因素做了改进:重新定义了权重和权重预测公式,并对选择动作时不同情况下的权重计算公式进行了统一,得到了改进的PERM算法.对...
关键词:NP难 蛋白质折叠 HP模型 增长型算法 PERM算法 
求解蛋白质折叠问题的模拟退火算法被引量:3
《小型微型计算机系统》2007年第1期75-78,共4页陈矛 黄文奇 吕志鹏 
国家自然科学基金项目(10471051)资助;国家"九七三"计划项目(2004CB318000)资助.
通过构造新的数学模型,把三维AB模型的蛋白质折叠问题由一个带约束的优化问题转化为无约束优化问题,然后提出一个模拟退火算法.对如何得到初始构形,提出了一个启发式策略.实算结果表明,本文算法效率较高,对四条氨基酸测试序列,本文算法...
关键词:蛋白质折叠问题 AB非格点模型 NP难度 
求解蛋白质结构预测问题的局部搜索算法被引量:4
《计算机科学》2005年第11期148-149,151,共3页吕志鹏 黄文奇 
国家973计划(批准号:G1998030600)资助项目
蛋白质结构预测问题是计算生物学领域的核心问题之一。通过理论计算的方法根据蛋白质氨基酸序列直接预测其空间结构是解决这一问题的有效途径。构造了新的邻域结构,采用了部分随机跳坑策略,对此问题提出了新的局部搜索算法。计算结果表...
关键词:蛋白质结构预测 格点模型 局部搜索 跳坑 局部搜索算法 蛋白质结构 预测问题 CARLO方法 求解 理论计算 
CGSP作业管理器合成服务的QoS优化模型及求解被引量:53
《计算机学报》2005年第4期578-588,共11页金海 陈汉华 吕志鹏 宁小敏 
国家自然科学基金重大研究计划项目基金(90412010);国家自然科学基金(60273076);国家"九七三"重点基础研究发展规划项目基金(2003CB317003);教育部中国教育科研网格计划 ChinaGrid 资助.
服务网格为松散的分布式服务提供了一个“电子市场”,使整合这些来自不同地方的异构的、动态的资源成为可能.CGSP的作业管理器提供了一个网格环境下的服务合成工具.在CGSP作业管理器早期开发和使用的实践中,作者发现合成服务难以提供预...
关键词:CGSP 虚拟服务 服务合成 QOS 模拟退火算法 局部搜索算法 
求解蛋白质折叠问题的改进PERM算法
《华中科技大学学报(自然科学版)》2004年第7期1-3,共3页黄文奇 程念华 吕志鹏 
国家高技术研究发展计划资助项目 (G1 9980 30 6 0 0 ) ;湖北省咸宁市白云山林场开发基金资助项目
在学习PERM算法的基础上 ,指出了影响PERM算法效率的关键因素 ,进而提出了一种改进的PERM算法———IPERM (ImprovedPERM ) .计算结果表明 ,IPERM的计算效率优于PERM算法 。
关键词:蛋白质折叠 PERM IPERM 门限 裁减 
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