焦清局

作品数：4被引量：1H指数：1
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供职机构：上海交通大学更多>>
发文主题：拟南芥基因基因调控网络代谢通路生物信息学更多>>
发文领域：生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《科学通报》《安徽农业科学》《生物信息学》《Agricultural Science & Technology》更多>>
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Genetic Data Clustering Based on Minimum Coding Length
《Agricultural Science & Technology》2012年第6期1376-1380,共5页汪雪红 焦清局 常盼盼 黄继风 
[Objective] This paper aimed to provide a new method for genetic data clustering by analyzing the clustering effect of genetic data clustering algorithm based on the minimum coding length. [Method] The genetic data cl...
关键词：Genetic clustering Lossy compression Gaussian distribution Minimum coding length 
基于最小编码长度的基因数据聚类
《安徽农业科学》2012年第19期10003-10005,10072,共4页汪雪红 焦清局 常盼盼 黄继风 
[目的]分析基于最小编码长度的基因数据聚类算法的聚类效果,以期为基因数据聚类提供新的方法。[方法]将基因数据的聚类看成是高维混合数据的聚类,通过对基因数据进行预处理后,再利用主成分分析将基因数据降维,降维后基因数据呈类高斯分...
关键词：基因聚类 有损压缩 高斯分布 最小编码长度 
拟南芥花药基因的共表达分析
《生物信息学》2010年第4期350-355,共6页焦清局 刘太岗 郑小琪 连爱娥 黄继风 
上海市教育委员会教育科学研究资助项目(批准号:07ZZ60)
运用图论中最大团算法,对ATTED-Ⅱ数据库中提供的拟南芥共表达数据进行分析,为进一步研究基因功能提供了较为可靠的数据。文中提出的算法首先根据芯片数据鉴定拟南芥花药基因,然后以ATTED-Ⅱ数据库为基础构建每一个花药基因的共表达网络...
关键词：拟南芥 花药 共表达 最大团 ATTED-Ⅱ数据库 
拟南芥代谢通路下基因调控网络的构建被引量：1
《科学通报》2009年第23期3710-3715,共6页焦清局 杨仲南 黄继风 
上海市教育委员会教育科学研究资助项目(批准号:07ZZ60)
基因调控网络在研究基因之间的调控关系及揭示复杂的生命现象方面有着重要的意义.拟南芥整个生长过程是由基因网络所调控.本文利用拟南芥代谢通路下基因共表达这一属性,结合启动子序列分析的生物信息学方法来预测拟南芥代谢通路下基因...
关键词：拟南芥 代谢通路 基因调控网络 生物信息学 模体 
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