徐维维

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供职机构：苏州大学计算机科学与技术学院更多>>
发文主题：蛋白质水分子蛋白质结构雅可比矩阵对接更多>>
发文领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《软件导刊》《生物物理学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金更多>>
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蛋白质loop区域闭合数值方法分析与比较
《软件导刊》2013年第8期29-33,共5页孙路 吕强 徐维维 权丽君 
针对蛋白质loop区域的闭合问题,比较分析了两种来源于机器人学的数值方法——循环坐标下降法(CCD)和雅可比矩阵方法,进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下降法要明显优于雅可比矩阵方法,而雅可比矩阵方法则可以较...
关键词：蛋白质 loop区域闭合 数值方法 循环坐标下降法 雅可比矩阵 
引入显式水分子对接提高蛋白质配体复合物结构的预测精度
《生物物理学报》2012年第12期983-997,934,共15页徐维维 吕强 吴宏杰 权丽君 
国家自然科学基金项目(60970055;61170125)
在蛋白质复合物界面一般都会存在着一定量的水分子,这些水分子通过空间占据和氢键方式影响蛋白质与配体的位置关系。应用现有的计算机方法研究蛋白质-配体对接时,一般不会显式地考虑水分子的作用。本文显式地将水分子引入蛋白质-配体对...
关键词：水分子 空间占据 氢键 蛋白质-配体对接 
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