权丽君

作品数：10被引量：15H指数：2
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供职机构：苏州大学计算机科学与技术学院更多>>
发文主题：G蛋白偶联受体蛋白质结构拓扑拓扑模型GPCR更多>>
发文领域：自动化与计算机技术生物学文化科学机械工程更多>>
发文期刊：《计算机学报》《计算机教育》《软件导刊》《计算机工程与应用》更多>>
所获基金：国家自然科学基金江苏高校优势学科建设工程资助项目江苏省自然科学基金更多>>
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“以赛促融”为导向的计算机专业课程教学模式
《计算机教育》2024年第12期159-162,共4页权丽君 吴剑 
国家自然科学基金面上项目“基于多组学生物互作语义表征的疾病相关突变识别方法研究”(62272335);江苏高校“青蓝工程”资助项目(苏教师函[2023]27号);苏州大学2023年高等教育教改研究重点课题“面向产教研融合的计算机专业课程教学模式探索与实践”(苏大教[2023]118号);江苏高校优势学科建设工程资助项目。
在新工科背景下,针对计算机专业课程内容滞后于产业发展、产学研融合保障有限、教学方式单一等问题,提出以“以赛促融”为导向的教学模式,以操作系统课程为例,从以赛促教与学、以赛促产教融合、以赛促科教融合3个方面介绍教学实施过程,...
关键词：以赛促融 教学模式 高校竞赛 产学研融合 操作系统 成果导向 
基于注意力机制的蛋白质残基相互作用预测方法
《计算机应用与软件》2024年第6期55-61,共7页何如吉 权丽君 吕强 
国家自然科学基金项目(31801108);“苏州大学江苏省计算机信息处理重点实验室”开放课题(KJS1843);江苏高校优势学科建设工程资助项目。
蛋白质残基相互作用预测对于构建蛋白质三级结构具有重要作用,许多基于深度学习的预测方法陆续提出。残基对的相互作用不仅由残基对本身属性决定,还受到所有其他残基对的影响,但多数深度模型采用的卷积神经网络更关注对局部特征的提取,...
关键词：蛋白质 残基相互作用 注意力机制 深度学习 
增强分子拓扑信息的多任务图神经网络算法
《计算机工程与应用》2023年第10期86-93,共8页蒋晔路 权丽君 吴庭芳 吕强 
国家自然科学基金(62272335,62002251);江苏省自然科学基金(BK20200856);江苏高校优势学科建设工程资助项目。
以分子毒性为代表的分子属性预测在以药物设计为主的多个领域的发展中发挥着重要作用,但直接利用分子结构信息快速且准确地预测分子毒性一直是一个挑战。目前,卷积网络和图网络等深度学习方法的出现在这个问题的解决上得到了一定的进展...
关键词：分子毒性预测 分子结构建模 图神经网络 多任务深层网络 
BMBQA:融合MCNN和BiGRU的蛋白质模型质量评估算法被引量：2
《小型微型计算机系统》2022年第7期1419-1425,共7页聂良鹏 权丽君 吴庭芳 孙晓雨 何如吉 吕强 
国家自然科学基金项目(31801108)资助;国家自然科学基金青年基金项目(62002251)资助;江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20200856)资助;江苏高校优势学科建设工程资助项目资助.
蛋白质模型质量评估是指对计算手段预测出的蛋白质结构进行评分,以选择尽可能接近天然结构的蛋白质模型,这对在蛋白质结构预测中挑选最优的蛋白质模型和在生物医学研究中恰当使用它们起到至关重要的作用.随着3D蛋白质数据的不断增长,基...
关键词：蛋白质模型质量评估 多尺度卷积神经网络 双向门控循环神经网络 GDT_TS 数据增强 CASP13 
基于语义特征向量的DNA与转录因子结合特异性预测
《计算机应用与软件》2022年第2期38-43,112,共7页孙晓雨 权丽君 梅杰 黄立群 吕强 
国家自然科学基金项目(31801108);苏州大学江苏省计算机信息处理重点实验室开放课题(KJS1843);江苏高校优势学科建设工程资助项目。
基因表达的生物系统受到DNA和转录因子(Transcription Factor,TF)相互作用的调控,但是对于DNA和TF的结合机制,人们仍然不够了解。为此,提出一个结合深度学习和SVC的模型预测TF与DNA序列结合特异性,并将这一方法命名为semanticSVC。在ENC...
关键词：DNA特异性 转录因子 深度学习 SVC t-SNE降维 特征向量可视化 单点突变 
单级双吸离心泵转子系统的可靠性分析被引量：8
《机电工程》2021年第9期1207-1211,共5页张飞 权丽君 
国家自然科学基金资助项目(31801108)。
针对单级双吸泵转子系统可靠性问题,采用有限元的方法对转子进行了静力学分析和模态分析,对转子系统的可靠性进行了研究。首先,对单级双吸离心泵转子系统结构进行了分析,建立了转子系统的有限元模型;然后,针对转子系统的应力、强度、临...
关键词：离心泵 转子系统 模态分析 可靠性分析 
基于五星教学原理的算法导论混合式教学设计被引量：3
《电脑知识与技术》2020年第18期139-141,共3页权丽君 吴剑 
国家自然科学基金(31801108);江苏高校优势学科建设工程资助项目资助。
《算法导论》作为计算机专业一门重要的专业必修课,具有多学科性、强理论性和高概括性。在高校教学中,线上教学可以辅助传统的线下教学。这样的混合式教学不仅发挥了教学者的主导性,也提高了学习者的主观能动性。目前,现有的研究大多只...
关键词：算法导论 混合式教学 五星教学原理 高校教学 新型教学环境 
GPCR跨膜螺旋的结构拓扑建模及其预测方法被引量：2
《计算机学报》2013年第10期2168-2178,共11页吴宏杰 吕强 权丽君 陈荣 陈沙沙 李海鸥 钱培德 
国家自然科学基金"蛋白质柔性对接计算机模拟方法研究"(61170125);江苏省自然科学基金"GPCR跨膜螺旋结构预测的计算方法研究"(BK20131154)资助
7个α跨膜螺旋组成的螺旋束是G蛋白偶联受体的最主要拓扑特征,其三维结构的预测精度直接影响完整受体的三维结构预测、配体对接及功能分析的准确性.近期许多研究小组提出了各种方法,同时也遇到了一个共同的问题:采样时难以在7个跨膜螺...
关键词：跨膜螺旋 G蛋白偶联受体 结构拓扑 约束 
蛋白质loop区域闭合数值方法分析与比较
《软件导刊》2013年第8期29-33,共5页孙路 吕强 徐维维 权丽君 
针对蛋白质loop区域的闭合问题,比较分析了两种来源于机器人学的数值方法——循环坐标下降法(CCD)和雅可比矩阵方法,进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下降法要明显优于雅可比矩阵方法,而雅可比矩阵方法则可以较...
关键词：蛋白质 loop区域闭合 数值方法 循环坐标下降法 雅可比矩阵 
引入显式水分子对接提高蛋白质配体复合物结构的预测精度
《生物物理学报》2012年第12期983-997,934,共15页徐维维 吕强 吴宏杰 权丽君 
国家自然科学基金项目(60970055;61170125)
在蛋白质复合物界面一般都会存在着一定量的水分子,这些水分子通过空间占据和氢键方式影响蛋白质与配体的位置关系。应用现有的计算机方法研究蛋白质-配体对接时,一般不会显式地考虑水分子的作用。本文显式地将水分子引入蛋白质-配体对...
关键词：水分子 空间占据 氢键 蛋白质-配体对接 
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