张宇镭

作品数：4被引量：104H指数：1
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供职机构：上海交通大学生命科学技术学院更多>>
发文主题：亲缘关系双核核酸序列自然语言文本分子更多>>
发文领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
发文期刊：《计算机工程与应用》《计算机工程》《中国微生态学杂志》更多>>
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使用角色反演句法分析器RNA二级结构的预测
《计算机工程》2006年第8期207-209,共3页党琰 张宇镭 张冬茉 赵立平 
RNA二级结构预测问题是生物信息学的一个研究重点。该文主要利用自然语言理解中句法分析的方法来研究RNA二级结构预测。使用基于角色反演算法建立起来的,采用概率上下文无关文法进行分析的句法分析器,来预测RNA二级结构。结合传统Chart...
关键词：RNA二级结构预测 句法分析 角色反演算法 概率上下文无关文法 
基于双核酸频率分布特征的细菌亲缘关系定量分析被引量：1
《中国微生态学杂志》2006年第4期261-263,共3页张宇镭 赵立平 
目的采用生物信息学方法定量分析细菌的亲缘关系。方法抽取全基因组核酸序列的双核苷酸频率特征向量,表征数字特征。采用Pearson相关系数分析特征向量之间的距离。结果以119个细菌的全基因组核酸序列为研究对象,两两比对的结果为:越是...
关键词：Pearson相关性系数 双核酸频率特征向量 基因组特征 
利用Pearson相关系数定量分析生物亲缘关系被引量：103
《计算机工程与应用》2005年第33期79-82,99,共5页张宇镭 党琰 贺平安 
论文主要利用计算语言学中使用的统计学方法定量分析生物物种的亲缘关系。以包含生物体遗传信息的核酸序列为研究对象,采用计算语言学的思想和方法,将每一个生物体的核酸序列看作一篇很长的自然语言文本,抽取核酸序列的双核苷酸频率分...
关键词：Pearson相关系数 核酸序列 自然语言文本 
从粪便样品中检测动物冠状病毒的分子技术研究
《中国微生态学杂志》2005年第4期249-251,253,共4页魏桂芳 张宇镭 刘惠莉 赵立平 
目的感染冠状病毒的动物向环境排毒主要是通过粪便,建立直接从粪便样品对动物冠状病毒进行检测的分子技术具有重要的公共卫生学意义。方法通过计算机模拟和实验方法对已报道的2对针对冠状病毒pol基因的通用引物的通用性进行了验证。不...
关键词：冠状病毒 通用引物 TiaqMan探针 
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