朱平

作品数：60被引量：134H指数：6
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供职机构：江南大学理学院更多>>
发文主题：聚类分析同义密码子P53氨基酸蛋白质序列更多>>
发文领域：理学自动化与计算机技术生物学文化科学更多>>
发文期刊：《生态环境学报》《系统工程理论与实践》《计算机应用与软件》《计算机应用研究》更多>>
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卵巢癌基因共表达网络及预后标志物的研究被引量：3
《生物学杂志》2020年第5期10-14,23,共6页顾云婧 朱平 
国家自然科学基金项目(No.11271163)。
卵巢癌是一种早期诊断率低而致死率较高的恶性肿瘤,对其预后标志物的鉴定和生存率的预测仍是生存分析的重要任务。利用卵巢癌预后相关基因构建基因共表达网络,鉴定预后生物标志物并进行生存率的预测。首先,对TCGA(The cancer genome atl...
关键词：卵巢癌 生物标志物 预后模型 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 
关于正则语言的子集的研究
《科教导刊》2020年第24期36-38,共3页饶淑珍 聂佳 过榴晓 朱平 
江南大学教学教改课题资助;全国大学生创新课题资助。
基于泵引理和正则语言的代数判定定理,本文证明了正则语言的子集未必是正则语言。以L={x|x∈{0,1}^*,且x中(10)和(10)作为子串出现次数相等}为例,文中通过构造等价语言L’={x|x∈{0,1}^*,且x的首尾字符相同}证明了L的正则性,其子集L2={0...
关键词：正则语言 正则语言的代数判定定理 泵引理 上下文无关语言 
基于加权网络的卵巢癌可变剪接预后特征分析被引量：1
《生命科学研究》2019年第6期444-451,共8页顾云婧 潘以红 朱东月 朱平 
国家自然科学基金资助项目(11271163)
可变剪接作为转录调节的调控机制,对肿瘤的治疗和预后具有重要意义。本文对卵巢癌预后相关的可变剪接事件进行了系统分析,以挖掘可变剪接在卵巢癌中的预后价值。首先,从TCGASpliceSeq数据库中下载卵巢癌患者数据,运用单因素Cox回归分析...
关键词：卵巢癌 可变剪接 蛋白质交互网络(PPI network) 预后预测 
基于拟比对CNN方法的人类p53癌症基因二级数据库构建及分析被引量：2
《食品与生物技术学报》2019年第4期15-20,共6页王丹丹 李晨鸿 徐海阳 蔡蓉 朱平 
国家自然科学基金项目(11271163)
以NCBI维护的一级数据库为数据源建立人类癌症p53核苷酸序列二级数据库,该数据库设计主要包括4个方面:癌症信息、p53序列信息、样本信息和参考文献信息。以XML格式为中间格式保存一级数据库数据,并通过解析提交到二级数据库,初步实现数...
关键词：二级数据库 癌症 p53基因序列 细胞神经网络 序列比对 
肺癌关键基因筛选及预测模型的研究被引量：3
《生物学杂志》2019年第2期22-27,40,共7页潘以红 范雪萌 朱平 
国家自然科学基金项目(No.11271163)
为了识别肺癌发展过程中的关键基因,揭示其发展的潜在机制,得到肺癌的预测模型,从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载了基因芯片GSE19188和GSE40791进行研究。首先对基因表达数据分析得到805个同趋势差异表达基因(differentially e...
关键词：肺癌 差异表达基因(DEGs) 蛋白质交互(PPI)网络 串话基因 预测模型 
检验双重性质特征的基因模糊聚类分析方法被引量：2
《计算机工程与应用》2018年第19期216-220,共5页祖颖 朱平 马冲 
国家自然科学基金(No.11271163)
针对基因序列分类的特点,结合模糊聚类分析方法,在原来的Markov链模型基因聚类方法的基础上,引入核酸碱基对的相互作用,得到具有双重性质特征的距离矩阵,并根据模糊聚类分析方法得到模糊相似性矩阵和其动态聚类图,从而实现基因序列的分...
关键词：模糊聚类 MARKOV链 相互作用 双重性质 
蛋白质序列图形变换及其相似性聚类分析被引量：1
《生命科学研究》2018年第3期191-200,228,共11页潘以红 钱东 朱平 
国家自然科学基金资助项目(11271163)
基于氨基酸的疏水性和相对分子质量,先把20种氨基酸分为8类,按不同间隔角度放置于圆周上。根据z轴坐标的划分,建立一个坐标空间。将蛋白质序列中的氨基酸按排列顺序映射到空间坐标系中,得到序列的3D模型。将3D模型转换为20维矩阵图,分...
关键词：蛋白质序列图形化 蛋白质序列数值化 矩阵图差异分析 离散傅里叶变换(DFT) 系统发育树 
拟密码子适应指数方法的设计及应用被引量：2
《生命科学研究》2018年第2期122-128,共7页马冲 祖颖 朱平 
国家自然科学基金资助项目(11271163)
密码子适应指数(codon adaptation index,CAI)测量的是生物体内某个基因所用密码子与高表达基因所用密码子的相符合程度,是反映密码子偏好性的一个重要指标。文章根据拟氨基酸编码方法首次提出拟密码子适应指数(quasi-codon adaptation ...
关键词：密码子适应指数(CAI) 拟氨基酸编码方法 拟密码子适应指数(Q-CAI) 密码子偏好性 同义密码子相对使用度(RSCU) 
P53家族基因的三周期性及其分步聚类分析被引量：1
《生命科学研究》2017年第6期488-493,共6页钱东 潘以红 朱平 
国家自然科学基金资助项目(11271163)
P53家族基因(p53、p63和p73)与肿瘤密切相关。为研究其相关性质,首先用Voss映射将p53家族基因的蛋白质编码序列(coding sequence,CDS)映射为数值序列;继而对数值序列进行离散傅立叶变换,并计算其功率谱;接着基于功率谱研究p53家族基因...
关键词：P53家族 基因 DNA序列 三周期性 聚类分析 
基于混沌游走表示的p53家族基因的进化差异性分析
《计算机与应用化学》2017年第9期655-660,共6页钱东 潘以红 朱平 
国家自然基金资助(11271163)
P53家族基因和肿瘤密切相关,为研究其进化差异性,首先利用混沌游走表示的方法,将p53家族基因的CDS序列映射为平面直角坐标系中的点列。继而,利用点列的坐标值构造加权特征向量,以此对CDS序列进行数值刻画。接着,基于欧式距离对CDS序列...
关键词：P53家族 混沌游走表示 聚类分析 进化差异性 
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