丁晓琴

作品数:27被引量:106H指数:6
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供职机构:北京药物化学研究所更多>>
发文主题:QSAR密度泛函构效关系分子电子结构更多>>
发文领域:理学医药卫生化学工程生物学更多>>
发文期刊:《化学学报》《高等学校化学学报》《化学进展》《功能材料》更多>>
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基于概念密度泛函理论磷酸酯类反应性物质毒性预测被引量:3
《物理化学学报》2018年第3期314-322,共9页丁晓琴 丁俊杰 李大禹 潘里 裴承新 
磷酸酯类反应性物质是乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂。本文应用概念密度泛函理论(CDFT),采用四组条件(B3LYP/6-311++G(2d,3p)/gas,B3LYP/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water,MP2/6-311++G(2d,3p)/gas,MP2/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water),对20多个磷...
关键词:概念密度泛函理论 反应性指数 有机磷酸酯类 乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂 定量构性关系 
钠离子通道开放剂的药效团模型与构效关系研究
《计算机与应用化学》2015年第8期897-902,共6页潘里 丁晓琴 丁俊杰 李大禹 陈冀胜 
采用软件Catalyst的Hip Hop、Hypo Gen方法和Sybyl 6.5的Co MSIA方法,对作用于钠离子通道位点2的一些类似物进行三维药效团模型和三维定量构效关系研究。计算结果表明,构建的药效团模型相关系数为0.946727,Co MSIA模型的交叉验证相关系...
关键词:钠离子通道位点2类似物 catalyst药效团 比较分子相似性指数分析(CoMSIA) 三维定量构效关系(3D-QSAR) 
ω-芋螺毒素的定量构效关系与虚拟筛选被引量:2
《物理化学学报》2014年第11期2157-2167,共11页丁俊杰 丁晓琴 李大禹 潘里 陈冀胜 
ω-芋螺毒素属于海洋生物活性多肽,由24-31个氨基酸残基组成.特异性作用于电压敏感的钙离子通道(VGCCs),能够直接开发成药物或作为先导化合物进行新药开发.本文应用新型氨基酸残基结构描述符cscales和遗传偏最小二乘算法,对ω-芋螺毒素...
关键词:ω-芋螺毒素 钙离子通道拮抗剂 QSAR 虚拟筛选 
指甲花醌(Lawsone)的化学反应性质理论预测被引量:2
《化学通报》2014年第4期333-340,共8页丁晓琴 丁俊杰 李大禹 
为分析指甲花醌(Lawsone)分子的化学反应性质,分别在B3LYP/6-31+G(d,p)和B3LYP/6-311++G(2d,3p)水平上,进行了其分子结构优化,并以导体连续极化模型(CPCM)作为溶剂化模型,计算了在气相和水溶液中其电离能、分子的硬度和亲电性、收敛的...
关键词:指甲花醌 化学反应性 概念密度泛函 福井函数 
甲胺磷碱性水解机理与反应速率常数理论计算被引量:1
《计算机与应用化学》2013年第4期335-340,共6页丁晓琴 丁俊杰 孙杨 陈冀胜 
运用密度泛函(DFT)理论,研究了农药甲胺磷分子在碱性条件下,水解微观反应机理和速率常数。在B3LYP/6-31+G(d,p)水平上分别优化了水溶液相反应途径上各反应态的几何结构,溶剂化模型采用连续极化连续模型(CPCM)。并用频率分析方法和内禀...
关键词:甲胺磷 碱性水解机制 活化自由能 速率常数 理论计算 
普通有机分子或药物热分解稳定性的理论预测被引量:2
《高等学校化学学报》2012年第5期1063-1068,共6页丁晓琴 丁俊杰 李大禹 孙杨 陈冀胜 
采用密度泛函理论方法,在B3LYP/6-31+G(d,p)水平上,对任意选定的32个有机化合物或药物进行最低能量构象优化和结构参数理论计算.建立了四极矩参数Qii与半数摩尔热分解函数Yd(1/2)的相关方程,其定量构性关系(QSPR)方程为Yd(1/2)=-8.65747...
关键词:有机分子或药物 半数分解温度 摩尔热分解函数 四极矩参数(Qii) 定量构性关系 
κ阿片受体与拮抗剂作用机制的计算机模拟研究
《中国药学杂志》2011年第10期747-752,共6页丁俊杰 丁晓琴 
目的构建人κ阿片受体三维结构模型,探讨拮抗剂与受体作用机制。方法应用同源模建方法构建人κ阿片受体三维结构模型,采用Profile-3D和Ram achandran图验证模型的可靠性。将选择性κ阿片受体拮抗剂5-′GNTI与受体进行分子对接和分子动...
关键词:阿片受体 同源模建 拮抗剂 分子对接 
HF在Cu(100)和SiO_2(100)晶面吸附的蒙特卡罗模拟
《计算机与应用化学》2010年第5期659-662,共4页丁俊杰 丁晓琴 刘艳 李磊 
HF同固体表面的相互作用,在腐蚀、催化和电化学等领域都有重要的意义。为了研究在低温低压条件下,HF在Cu和SiO_2晶体表面的吸附情况,本文采用巨正则蒙特卡罗(GCMC)模拟法,计算模拟HF在Cu(100)和SiO_2(100)晶体表面的吸附行为。结果表明...
关键词:巨正则蒙特卡罗 HF Cu(100)表面 SiO2(100)表面 吸附 
密度泛函方法研究辣椒碱分子的结构和性质被引量:7
《计算机与应用化学》2009年第5期529-533,共5页陈虹 陈冀胜 丁晓琴 丁俊杰 樊启平 
辣椒碱(Capsaicin)在医药、农业和反恐装备方面具有广泛的应用前景。本文用密度泛函理论DFT/B3LYP方法,在6-31+G(d,p)基组水平上对其进行了计算。密度泛函理论方法既考虑了电子相关,又较其他组态相互作用或微扰方法节省机时,其计算结果...
关键词:辣椒碱 密度泛函理论 几何构型 热力学性质 热分解机理 
从头计算研究水溶液中有机化合物的pKa值被引量:11
《计算机与应用化学》2007年第5期580-582,共3页陈虹 丁俊杰 丁晓琴 陈冀胜 樊启平 
运用量子化学方法计算水溶液中一些含氮小分子化合物和醇、酚、羧酸的pKa值。采取从头计算的Hartree-Fock法和6- 31G(d,p)基组,以及aug-cc-pVDZ基组,密度泛函理论的B3LYP法6-31G(d,p)基组,分别优化分子和离子的气相几何结构,采用极化连...
关键词:PKA PCM HF B3LYP 溶剂化能 
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