廖奇

作品数:16被引量:44H指数:4
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供职机构:宁波大学医学院更多>>
发文主题:功能注释非编码RNAS非编码RNA生物信息学大肠癌更多>>
发文领域:医药卫生生物学更多>>
发文期刊:《中国科学:生命科学》《临床医学进展》《生命科学》《生物物理学报》更多>>
所获基金:国家自然科学基金浙江省自然科学基金王宽诚教育基金宁波市自然科学基金更多>>
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长链非编码RNA在肿瘤免疫微环境中的作用被引量:4
《生命科学》2022年第2期212-219,共8页胡诗芸 奕天飞 王家立 廖奇 叶孟 
国家自然科学基金项目(31970630);浙江省自然科学基金项目(LY21C060002);浙江省属高校基本科研业务费(SJLZ2021001)。
长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)作为非编码RNA的重要组成部分,可通过影响细胞因子及免疫检查点相关分子的表达来调节肿瘤微环境中多种免疫细胞的功能以及分布情况,从而重塑免疫抑制性肿瘤微环境,影响肿瘤进展,并与多种临...
关键词:肿瘤微环境 长链非编码RNA 免疫细胞 肿瘤 
RNA结合蛋白与非编码RNA调节关系的研究进展被引量:4
《中国细胞生物学学报》2021年第1期263-272,共10页倪舒静 徐美倩 陈辰 王玲琳 朱婷琰 奕天飞 吉米丽古丽•艾尼 廖奇 
浙江省自然科学基金(批准号:LY21C060002);浙江省属高校基本科研业务费(批准号:SJLZ2021001);国家自然科学基金(批准号:31970630)资助的课题。
近年来,越来越多的研究表明,RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)与多种类型的非编码RNAs(noncoding RNA,ncRNAs)具有互相调节的关系,且调节机制形式多样。一方面,RBP可以调节ncRNA的生物合成、稳定性和功能;另一方面,ncRNA也可以影响...
关键词:RNA结合蛋白 非编码RNA 调节关系 MIRNA 长非编码RNA circRNA 
福建北部地区斯氏并殖吸虫疫源地宿主感染情况分析被引量:6
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》2020年第1期102-109,共8页蔡茂荣 罗鋆 艾琳 廖奇 卓鸣莺 陈佳 陈锦钟 柳建发 程由注 
国家寄生虫资源库;福建省漳州市自然科学基金(No.ZZ2017J09);福建省漳州市重大科技项目(No.ZZ2017ZD05)。
目的考察福建北部地区斯氏并殖吸虫中间宿主螺、蟹种群及其孳生地,比较生态环境改变前后感染率,并分析其变化原因。方法 2009-2019年,以并殖吸虫病例为线索,对福建省北部南平市的建瓯市小桥镇涤上村、东峰镇桂林村、城关镇七里街村和建...
关键词:斯氏并殖吸虫 中间宿主 种群 孳生地 感染率 影响因素 分子鉴定 
长非编码RNA调节恶性疟原虫的毒力及其基因激活研究进展
《临床医学进展》2019年第4期613-618,共6页揭君津 柳建发 刘丹妮 廖奇 陈佳 蒋雯雯 
长链非编码RNA (long non-coding RNAs, lncRNAs)为一类长度大于200 nt,不具有蛋白质编码功能且大多具有polyA尾巴结构的RNA分子。截止2016年,全球每年疟疾发病病例高达2.16亿例,近年来,由于耐药性原虫和耐杀虫剂蚊的出现,消除疟疾对人...
关键词:恶性疟原虫 长链非编码RNA VAR基因 
盐酸小檗碱改善慢性炎症痛和抑郁的作用研究被引量:5
《中华医学杂志》2018年第14期1103-1108,共6页徐芳 杨婧 孟波 郑晋伟 廖奇 陈骏萍 陈晓薇 
国家自然科学基金(81671089);浙江省自然科学基金(LY15H090011);宁波市自然科学基金(2016A610086,2016A610144);宁波市生命健康科技创新团队一重大精神疾病转化医学(2015C110026);浙江省医药卫生科技计划(No.2017KY591);浙江省公益技术应用研究计划项目(No.2017C37126);宁波市第二医院华美研究基金(2017HMKY34)
目的探讨盐酸小檗碱(BBR)对小鼠慢性炎症痛及其伴发的抑郁样症状的影响及其机制。方法本实验使用雄性ICR小鼠40只,2月龄,体质量25~30g。采用小鼠足底注射完全弗氏佐剂(CFA)的方法建立慢性痛动物模型。应用随机数字表法将小鼠分为...
关键词:炎症 疼痛 抑郁 治疗结果 
CRISPR相关的生物信息学基础被引量:3
《中国生物化学与分子生物学报》2016年第10期1067-1076,共10页陶洋 李金城 廖奇 
国家自然科学基金项目(No.31301084);浙江省自然科学基金项目(No.LQ13C060002);宁波大学2016年度研究生科技创新基金资助项目(No.g16096)~~
成簇规律间隔短回文序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)是细菌和古细菌在不断进化的过程中获得的一种适应性免疫防御机制,该结构与一些功能相关的蛋白质(CRISPR-associated,Cas)合称CRISPR-Cas系...
关键词:CRISPR 基因编辑 生物信息学 
大肠癌长非编码RNA的研究进展被引量:1
《中国细胞生物学学报》2016年第9期1163-1171,共9页鲁利贞 李金城 叶孟 陶洋 廖奇 
浙江省自然科学基金项目(批准号:LQ13C060002);国家自然科学基金项目(批准号:81172771;31301084);宁波大学学科项目(批准号:XKL14D2097;XYL14023);宁波大学王宽诚教育基金项目资助的课题;浙江省统计局青年研究课题~~
长非编码RNA(long noncoding RNA,lnc RNA)是长度大于200 nt,因缺少完整的阅读编码框而不编码蛋白质的一种功能性分子。研究发现,长非编码RNA在众多肿瘤的发生、发展过程中发挥着重要的作用。已有研究报道,在大肠癌细胞中,大量长非编码...
关键词:长非编码RNA 大肠癌 抑癌基因 癌基因 
机器学习方法在基因功能注释中的应用被引量:1
《中国生物化学与分子生物学报》2016年第5期496-503,共8页李金城 廖奇 沈其君 
浙江省自然科学基金项目(No.LQ13C060002);国家自然科学基金项目(No.81172771;No.31301084);宁波大学学科项目(No.XKL14D2097和No.XYL14023);宁波大学王宽诚教育基金项目~~
目前,基于计算机数学方法对基因的功能注释已成为热点及挑战,其中以机器学习方法应用最为广泛。生物信息学家不断提出有效、快速、准确的机器学习方法用于基因功能的注释,极大促进了生物医学的发展。本文就关于机器学习方法在基因功能...
关键词:功能注释 机器学习法 功能预测 基因 
鉴定和预测长非编码RNAs的生物信息学方法被引量:1
《生命科学》2015年第7期946-952,共7页陈思佟 岑益 柳建发 李洋 廖奇 
浙江省自然科学基金项目(LQ13C060002);国家自然科学基金项目(31301084);宁波大学王宽诚教育基金
越来越多的研究表明,长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lnc RNAs)可以调节蛋白质编码基因的表达、稳定性及亚细胞定位,参与众多重要的生物过程。由于lnc RNAs是一类新发现的非编码RNAs,挖掘各物种的lnc RNAs仍然是一个值得研究的问题...
关键词:长非编码RNAs 鉴定 计算机预测 测序 
lncRNAs功能注释和预测被引量:8
《中国生物化学与分子生物学报》2015年第3期239-243,共5页余铖亮 骆亮 廖奇 
浙江省自然科学基金(No.LQ13C060002);国家自然科学基金(No.31301084);宁波大学王宽诚教育基金~~
随着测序技术的发展,在各种哺乳动物中发现越来越多的长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs),但是大部分lncRNAs的功能却未知.鉴于lncRNAs在众多生物过程如免疫反应、发育和基因印迹中表现出对蛋白编码基因和其它非编码RNAs的重...
关键词:长非编码RNAs(1ncRNAs) 功能注释 生物信息学 
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