常乘

作品数：9被引量：39H指数：4
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供职机构：北京蛋白质组研究中心更多>>
发文主题：蛋白质组学质谱肽段定量蛋白质组学蛋白质相互作用更多>>
发文领域：生物学自动化与计算机技术理学更多>>
发文期刊：《生物化学与生物物理进展》《中国科学：生命科学》《生物工程学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
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基于数据非依赖采集的以肽为中心分析算法和软件的研究进展被引量：2
《生物工程学报》2023年第9期3579-3593,共15页张莹莹 舒坤贤 常乘 
国家重点研发计划(2021YFA1301603)。
数据非依赖采集(data-independent acquisition,DIA)是一种高通量、无偏性的质谱数据采集方法,具有定量结果重现性好,对低丰度蛋白质友好的特点,是近年来进行大队列蛋白质组研究的首选方法之一。由于DIA产生的二级谱是混合谱,包含了多...
关键词：计算蛋白质组学 定量蛋白质组学 数据非依赖采集 以肽为中心 
蛋白质组学中色谱保留时间对齐算法的研究进展被引量：1
《生物工程学报》2022年第3期961-975,共15页刘祎 常乘 朱云平 
国家重点研发计划(2020YFE0202200)。
色谱是目前蛋白质组学流程中的一个基本环节,而色谱的保留时间对齐是有效提高鉴定和定量准确性的重要步骤之一。经过多年的发展,目前已经产生了一系列保留时间对齐算法。文中主要从可用性角度对蛋白质组学分析中色谱保留时间对齐算法及...
关键词：蛋白质组学 色谱 保留时间对齐 算法 软件 
基于质谱的蛋白质生物标志物发现中的特征选择与机器学习方法研究进展被引量：5
《生物工程学报》2019年第9期1619-1632,共14页徐开琨 韩明飞 黄传玺 常乘 朱云平 
国家自然科学基金(No.21605159)资助~~
随着质谱技术的进步以及生物信息学与统计学算法的发展,以疾病研究为主要目的之一的人类蛋白质组计划正快速推进。蛋白质生物标志物在疾病早期诊断和临床治疗等方面有着非常重要的意义,其发现策略和方法的研究已成为一个重要的热点领域...
关键词：质谱 蛋白质组学 生物标志物 机器学习 特征选择 深度学习 
基于机器学习的蛋白质相互作用文献挖掘方法研究进展被引量：4
《中国科学：生命科学》2016年第11期1235-1248,共14页李满生 常乘 马洁 朱云平 
国家重点基础研究发展计划(批准号:2013CB910800);国际合作计划(批准号:2014DFB30010);国家高技术研究发展计划(批准号:2015AA020108);国家自然科学基金(批准号:61303073,21475150,21275160)资助
蛋白质相互作用是生物体内一类极其重要的分子活动.自动挖掘、整合生物文献中的蛋白质相互作用有助于生物学的研究,获得了人们的广泛关注,成为生物文献挖掘领域的重要任务之一.目前,基于机器学习的蛋白质相互作用挖掘方法已经取得了很...
关键词：蛋白质相互作用 蛋白质相互作用挖掘 文献挖掘 机器学习 
目标-诱饵库搜索策略在蛋白质组质谱鉴定和质控中的应用及研究进展被引量：3
《生物化学与生物物理进展》2016年第7期661-672,共12页冯晓东 马洁 常乘 白明泽 朱云平 舒坤贤 
国际合作计划(2014DFB30010);国家重点基础研究发展计划(973)(2013CB910800);国家自然科学基金(21475150,21105121,61501071)资助项目;重庆市研究生科研创新项目(CYS14154)资助
基于串联质谱的蛋白质组研究会产生海量的质谱数据,这些数据通常使用数据库搜索引擎进行鉴定分析,并根据肽段谱图匹配(PSM)反推真实的样品蛋白质.对于高通量蛋白质组数据的处理,其鉴定结果的可信是后续分析应用的前提,因此对鉴定结果的...
关键词：串联质谱 蛋白质鉴定 目标-诱饵 质量控制 
基于质谱的定量蛋白质组学策略和方法研究进展被引量：14
《中国科学：生命科学》2015年第5期425-438,共14页常乘 朱云平 
国家重点基础研究发展计划(批准号:2011CB910601;2013CB910800);国际合作计划(批准号:2014DFB30010);国家高技术研究发展计划(批准号:2012AA020409;2012AA020201);国家自然科学基金(批准号:21475150;21105121)资助项目
定量蛋白质组学已经成为组学领域研究的热点之一.相关实验技术和计算方法的不断创新极大地促进了定量蛋白质组学的飞速发展.常用的定量蛋白质组学策略按照是否需要稳定同位素标记可以分为无标定量和有标定量两大类.每类策略又产生了众...
关键词：质谱 定量蛋白质组学 定量算法 无标定量 有标定量 绝对定量 
基于质谱技术筛选差异表达蛋白的统计学策略研究进展
《中国科学：生命科学》2015年第4期347-358,共12页王锦霞 常乘 马洁 吴松锋 庄举娟 朱云平 
国家重点基础研究发展计划(批准号:2013CB910800);国家自然科学基金(批准号:21105121,21475150);国家高技术研究发展计划(批准号:2012AA020201);蛋白质组信息学关键技术及分析系统研发国际合作项目(批准号:2014DFB30010);中央高校基本科研业务费(批准号:3132015159)资助
随着质谱技术的快速发展,蛋白质组学已成为继基因组学、转录组学之后的又一研究热点,寻找可靠的差异表达蛋白对于生物标记物的发现至关重要.因此,如何准确、灵敏地筛选出差异蛋白已成为基于质谱的定量蛋白质组学的主要研究内容之一.目前...
关键词：质谱 蛋白质组学 差异表达蛋白 统计学原理 多重假设检验 
中国蛋白质组学研究进展——以人类肝脏蛋白质组计划和蛋白质组学技术发展为主题被引量：1
《中国科学：生命科学》2014年第11期1099-1112,共14页李衍常 李宁 徐忠伟 翟琳辉 樊锋旭 常乘 张成普 郑俊杰 徐平 贺福初 
国家重点基础研究发展计划(批准号:2011CB910600;2013CB911201);国家自然科学基金(批准号:31070673;31170780)资助项目
蛋白质组学是对细胞或生物体全部蛋白质的系统鉴定、定量并阐释其生物学功能的学科.自21世纪初期开始,随着高精度、高灵敏度和快速扫描质谱仪的出现和快速发展以及微量蛋白质组样品高效分离技术的进步,蛋白质组学获得了快速发展,并在生...
关键词：蛋白质组学 人类肝脏蛋白质组计划 蛋白质相互作用 蛋白质翻译后修饰 生物信息学 
基于质谱的选择反应监测技术相关策略和方法的研究进展被引量：9
《生物化学与生物物理进展》2012年第11期1118-1127,共10页常乘 吴松锋 马洁 张伟 朱云平 
国家重点基础研究发展计划(973)(2011CB910601,2010CB912700);国家高技术研究发展计划(863)(2012AA020409,2012AA020201);国家自然科学基金(21105121)资助项目~~
随着蛋白质组学研究的不断深入,基于质谱的选择反应监测技术(SRM)已经成为以发现生物标志物为代表的定向蛋白质组学研究的重要手段.SRM技术根据假设信息,特异性地获取符合假设条件的质谱信号,去除不符合条件的离子信号干扰,从而得到特...
关键词：定向蛋白质组学 生物质谱 选择反应监测技术 蛋白质特异性肽段 母离子-子离子对 
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