黄金艳

作品数：4被引量：23H指数：3
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供职机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院更多>>
发文主题：数据过滤基因融合多个数据库突变检测方法生物信息分析更多>>
发文领域：医药卫生更多>>
发文期刊：《中华胃肠外科杂志》《上海交通大学学报（医学版）》更多>>
所获基金：国家自然科学基金上海市国际科技合作基金更多>>
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黄芩苷抗肿瘤作用机制的研究进展被引量：14
《上海交通大学学报（医学版）》2021年第2期246-250,共5页刘梦珂 纪濛濛 程林 黄金艳 孙晓建 赵维莅 王黎 
国家自然科学基金(81520108003,81670176,81830007);上海市科学技术委员会课题(16JC1405800);上海市杰出青年医学人才培养资助计划;上海市教育委员会高峰高原学科建设计划(20152206,20152208);上海市人才基金(2017079);上海交通大学医学院高水平地方高校创新团队(SSMUZLCX20180801)。
黄芩苷是从中药黄芩中提取出来的一种黄酮类化合物。研究表明其作为黄芩的有效成分之一,在抗氧化、抗炎症和抗病毒等方面均具有疗效。随着研究的深入,黄芩苷在抗肿瘤方面的作用被逐渐地认识,其对肿瘤的影响和抗肿瘤的作用机制,如阻滞肿...
关键词：黄芩苷 抗肿瘤 肿瘤凋亡 肿瘤转移 肿瘤微环境 
急性淋巴细胞白血病基因融合与突变知识库的构建
《上海交通大学学报（医学版）》2018年第9期1027-1032,1027,共6页严天奇 陈立伟 朱勇梅 李剑峰 代雨婷 崔舒雅 姜璐 陈冰 黄金艳 
国家自然科学基金(81570122,81770205);上海市教育委员会高峰高原学科建设计划(20161303)。
目的·建立急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)基因融合与突变知识库,以辅助临床基因检测。方法·通过对文献进行文本挖掘,收集ALL相关的基因融合与突变注释信息。基于NodeJS平台的Express框架和MySQL数据库系统的...
关键词：急性淋巴细胞白血病 基因融合 基因突变 知识库 
基于基因Panel测序数据的分析方法被引量：5
《上海交通大学学报（医学版）》2017年第11期1574-1580,共7页李剑峰 严天奇 崔博文 孔杰 王舒 陈冰 黄金艳 
国家自然科学基金(81570122,81770205);上海市教育委员会高峰高原学科建设计划(20161303)~~
目的·针对基因Panel测序数据整合多种二代测序分析方法,建立一套具备质量控制、基因突变检测的自动化分析及可视化工具。方法·整合Fast QC、Prinseq等方法开发针对基因Panel测序数据的质量控制和可视化R包;BWA或TMAP用于FASTQ文件与...
关键词：二代测序 基因Panel测序 质量控制 基因突变检测 可视化 
大数据生物信息分析促进肿瘤分子靶点的发现被引量：4
《中华胃肠外科杂志》2015年第1期9-12,共4页黄金艳 于颖彦 
国家自然科学基金（81172329,81372644）;国家科技部重大项目（2012AA02A504,2012AA02A203）;上海市国际合作项目（12410706400）
高通量组学研究产生的大数据一般具有数据量巨大、数据种类繁多、价值需深入挖掘和处理响应速度快等特征。以人的全基因组DNA双端测序为例，如果以平均30倍覆盖率测序则可产生100 GB的原始数据（压缩FASTQ格式），回帖到基因组后的二进...
关键词：肿瘤 分子靶点 基因组 大数据 生物信息学 
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