张琪

作品数：6被引量：4H指数：1
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供职机构：复旦大学化学系更多>>
发文主题：核糖体翻译后修饰硫生物合成自由基更多>>
发文领域：生物学理学更多>>
发文期刊：《科学通报》《生物化学与生物物理进展》《合成生物学》《微生物学报》更多>>
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合成生物学策略发现新型核糖体肽Xenopeptide
《科学通报》2024年第10期1361-1372,共12页莫天录 曾丹丹 马溯泽 贾一飞 韩沅均 丁伟 张琪 
国家自然科学基金(32370092);国家重点研发计划(2023YFF1103600);生物反应器国家重点实验室开放课题;微生物代谢国家重点实验室开放课题资助。
S-腺苷甲硫氨酸自由基(rSAM)酶家族是目前已知的最大酶超家族之一,由22000多个成员组成.这些酶在大自然中广泛存在,被认为是地球上最早的生物催化剂之一.随着大量的微生物基因组信息被解析,分析显示,微生物中大量核糖体肽类天然产物的...
关键词：S-腺苷甲硫氨酸自由基酶 核糖体肽 翻译后修饰 合成生物学 
基于深度学习识别RiPPs前体肽及裂解位点被引量：1
《合成生物学》2022年第6期1262-1276,共15页吕靖伟 邓子新 张琪 丁伟 
国家重点研发计划(2018Y F A0900402)。
得益于基因测序技术的快速发展,基因组测序数据呈现爆炸式增长,核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)是近十年逐渐进入人们视野的一大类肽类天然产物。这类化合物在自然界中分布极其广泛,具有丰富的结构多样性和生物活性多样性,是天然药物...
关键词：深度学习 RiPPs 前体肽 预训练模型 天然产物挖掘 
环番合成酶PacB催化Xye类核糖体肽翻译后修饰研究
《合成生物学》2021年第5期826-836,共11页韩沅均 莫天录 邓子新 张琪 丁伟 
科技部重点研发计划(2018YFA0900402)。
近年来,一类含有分子内三残基环番结构的新型核糖体肽引起了广泛关注。这类化合物通常由一类S-腺苷甲硫氨酸自由基酶催化核心肽中芳香氨基酸的sp^(2)碳和相邻第三位氨基酸残基侧链的sp^(3)碳之间形成C—C或C—O键,这类酶被称为三残基环...
关键词：S-腺苷甲硫氨酸自由基酶 三残基环番合成酶 核糖体肽 翻译后修饰 
塞克肽类(Sactipeptide)天然产物的研究进展被引量：1
《生物化学与生物物理进展》2020年第10期1032-1045,共14页陈允亮 李国权 杨云鹏 贾卫东 施爱平 张琪 
国家自然科学基金(31400083,21822703);镇江市重点研发计划(NY2018015);丹徒区重点研发计划(NY2017001)资助项目。
塞克肽是一类重要的核糖体肽天然产物,具有多种生物活性,它们的共同特征是存在由半胱氨酸巯基与受体氨基的α-碳原子连接的分子内硫醚键.本篇综述总结了近年来塞克肽的发现、活性、生物合成、作用机制等多方面的工作,详细讨论了由SAM自...
关键词：塞克肽 核糖体肽 硫醚键 SAM自由基酶 
核糖体肽生物合成中的典型翻译后修饰研究被引量：1
《生物技术通报》2020年第10期215-225,共11页汪金秀 张琪 丁伟 陈拓 
国家自然科学青年科学基金项目(31600398);甘肃杰出青年基金项目(17JR5RA308)。
核糖体肽类天然产物(RiPPs)是由核糖体合成,经由翻译后修饰得到的一大类天然产物,具有广泛的结构和生物活性多样性。综述了核糖体肽的类别及种类众多的翻译后修饰机理,探讨了翻译后修饰对结构多样性的意义,并对生物信息学背景下利用基...
关键词：核糖体肽 后修饰 生物合成途径 基因组挖掘 
羊毛硫肽类化合物(Lanthipeptide)生物合成新进展被引量：1
《微生物学报》2016年第3期373-382,共10页莫天录 薛林贵 张琪 
国家自然科学基金(KRH1615548)~~
羊毛硫肽化合物(Lanthipeptides)是由核糖体合成并经过翻译后修饰得到的一大类肽类天然产物。这类化合物广泛的产生于不同种类的细菌,具有丰富的结构和生物活性多样性,为活性药物研究和开发提供重要的来源。本文综述了近几年来羊毛硫肽...
关键词：羊毛硫肽 核糖体肽天然产物 底物控制 抗菌活性 立体选择性 
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