孙西红

作品数：4被引量：22H指数：3
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供职机构：河南科技大学动物科技学院更多>>
发文主题：高羊茅基因注释转录组种子萌发RNA-SEQ更多>>
发文领域：农业科学更多>>
发文期刊：《草业科学》《基因组学与应用生物学》《湖南农业大学学报（自然科学版）》《南方水产科学》更多>>
所获基金：河南省自然科学基金博士科研启动基金广东省渔业生态环境重点实验室开放基金国家科技支撑计划更多>>
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基于高通量测序的杂交鳢转录组数据分析
《湖南农业大学学报（自然科学版）》2019年第5期529-535,共7页黄勇 龚望宝 陈海刚 孙西红 
国家科技支撑计划(2012BAD25B04);河南省自然科学基金项目(162300410069);河南省高等学校重点科研项目(16A240002);广东省渔业生态环境重点实验室开放基金(LFE–2016–13)
运用高通量技术对杂交鳢进行转录本测序和数据分析,经拼接与组装,最终获得52 065条unigenes,长度范围201~12 407 bp,序列平均长度为710 bp。从长度分布、GC含量和基因表达量等方面对unigenes进行评估,数据显示测序质量较好。进一步的数...
关键词：杂交鳢 转录组 unigenes 基因注释 
基于RNA-Seq高通量测序技术的大口黑鲈转录组分析被引量：9
《南方水产科学》2019年第1期106-112,共7页黄勇 龚望宝 陈海刚 熊建利 孙西红 
国家科技支撑计划项目(2012BAD25B04);河南省自然科学基金项目(162300410069);河南省高等学校重点科研项目(16A240002);广东省渔业生态环境重点实验室开放基金(LFE-2016-13)
文章以大口黑鲈(Micropterus salmoides)组织作为研究对象,利用RNA-seq技术进行转录本测序和数据分析,经拼接组装,最终获得35 659条unigenes,序列平均长度738 bp,序列长度中位数(N50)为1 052 bp。另外从长度分布与GC含量等方面对unigene...
关键词：大口黑鲈 转录组 unigenes 基因注释 
基于RNA-Seq高通量测序技术的大鲵转录组分析被引量：4
《基因组学与应用生物学》2018年第9期3759-3768,共10页黄勇 高小蝉 孙西红 
河南省自然科学基金(No.162300410069);河南省高等学校重点科研项目(No.16A240002)共同资助
为发掘大鲵的功能基因,该研究以大鲵组织作为研究对象,利用RNA-seq技术对大鲵进行转录本测序和数据分析,经拼接组装共获得132 912条Unigenes,序列平均长度690 bp,N50为1 263 bp。另外从长度分布、GC含量与表达水平等方面对Unigenes进行...
关键词：大鲵 转录组 Unigenes 基因注释 
Na_2CO_3胁迫对高羊茅种子萌发的影响被引量：10
《草业科学》2014年第4期677-682,共6页孙西红 赵凌平 王占彬 
河南科技大学博士基金项目(09001634);河南省教育厅重点项目(13A2302812013)
研究了不同浓度Na2CO3(0、20、40、60、80和100mmol·L-1)胁迫对4个高羊茅(Festuca arundinacea)品种(美洲虎3号、雅典娜、爱瑞3号和火凤凰)种子萌发的影响。结果表明,Na2CO3胁迫均会延迟4个高羊茅品种的初始萌发时间,延缓发芽进程。随N...
关键词：高羊茅 NA2CO3胁迫 碱性盐 种子萌发 
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