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相关机构:四川大学福建农林大学中国科学院华中农业大学更多>>
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茶银尺蠖触角转录组及相关嗅觉基因的分析
《环境昆虫学报》2025年第2期504-514,共11页张方梅 尤伟晨 郭世保 陈俊华 史洪中 耿书宝 周洲 乔利 
河南省大别山实验室重点课题(DMLP006);河南省中央引导地方科技发展资金项目(Z20221341063);信阳农林学院创新团队建设项目(XNKJTD-007,KJCXTD-202001);河南省高等学校重点科研项目(24B210012),信阳生态研究院开放基金(2023XYQN08,2023XYMS11);河南省国际科技合作项目(242102520042);河南省科技攻关项目(242102110178)。
本研究利用IIIumina Hiseq 4000高通量测序平台对茶银尺蠖Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)雌雄成虫触角进行转录组测序,共获得93335条unigenes,N50长度为1151 bp。通过基因功能注释,有23581条unigenes注释到六大公共数据库中,...
关键词:茶银尺蠖 触角转录组 嗅觉相关蛋白 基因注释 
七种半翅目昆虫线粒体基因组数据
《生物多样性》2025年第2期138-142,共5页林珍 向家宝 蔡何佳奕 高贝 杨金涛 李俊毅 周青松 黄晓磊 邓鋆 
福建农林大学科技创新专项基金(KFB23016);福建农林大学杰出青年科研人才计划项目(Kxjq21004)。
昆虫是地球上物种多样性最高的类群,对特定昆虫类群的线粒体基因组研究还处于不断发展和积累的阶段。由于部分半翅目昆虫的线粒体基因组在GenBank数据库中缺失,阻碍了线粒体基因组在半翅目昆虫中的进一步应用。本研究报道了Maevius inde...
关键词:半翅目 线粒体基因组 基因注释 生物多样性 
1株猪源动物联合乳杆菌S7全基因组测序及生物信息学分析
《中国畜牧兽医》2025年第1期25-38,共14页刘辉 季海峰 王四新 陈美霞 张董燕 
重点研发计划(2022YFD1300400);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20240507);北京市农林科学院畜牧兽医研究所改革与发展项目(XMS202307);国家自然科学基金(32202705)。
[目的]旨在对1株具有较强耐酸耐胆盐特性的猪源动物联合乳杆菌S7进行全基因组测序及生物信息学分析。[方法]结合三代PacBio RSⅡ和二代Illumina HiSeq 2000测序技术对动物联合乳杆菌S7进行了全基因组测序,在此基础上使用GO、EggNOG、KEG...
关键词: 动物联合乳杆菌 全基因组测序 基因注释 
一株柴油降解菌Bacillus S3-2-LX的筛选鉴定和基因组测序分析
《西华师范大学学报(自然科学版)》2024年第6期569-578,共10页叶春宏 杨蕊毓 彭超 路璐 
国家自然科学基金项目(42107278);四川省科技厅应用基础研究项目(2021YJ0295,2022YEN0065);西华师范大学科研创新团队项目(CXTD2020-3)。
柴油污染对环境生物多样性和人类健康造成了严重威胁,微生物修复是目前柴油污染场地修复中的重要手段之一。以柴油为唯一的碳源,从四川某高校一垃圾堆放点的土壤中分离出一株芽孢杆菌属Bacillus的菌株S3-2-LX,菌体呈杆状,菌落呈乳白色...
关键词:柴油降解菌 分离和鉴定 芽孢杆菌属 基因组测序 基因注释 
苹果源云南链核盘菌近染色体水平基因组图谱构建与基因注释
《菌物学报》2024年第11期117-130,共14页戴承凤 谭颖 李幸运 吴若坤 孙广宇 梁晓飞 
国家苹果产业技术体系(CARS-27);国家重点研发计划(2023YFD1401400)。
褐腐病是核果和仁果等水果作物上的重要真菌病害,可导致采前和采后果实腐烂给生产带来重大损失。褐腐病由链核盘菌属真菌侵染引起,在我国有多个病原种,其中云南链核盘菌Moniliniayunnanensis是地理分布和寄主范围均较广的一个优势种,然...
关键词:苹果褐腐病 链核盘菌 基因组 适应进化 
桫椤转录组测序及生物信息学分析
《农业研究与应用》2024年第5期381-390,共10页史云吏 杨凯博 李其锦 和秋兰 梁圣华 陈健虹 黄红宝 黄耀恒 
广西南宁抽水蓄能电站保护植物迁地保护项目(029500202203030100900022);广西林草种质资源普查与收集项目(桂林科字[2021]第34号)。
【目的】桫椤是一种古老的蕨类植物,具有重要的生态和经济价值。本研究通过转录组测序揭示桫椤的基因表达特征,为桫椤的分子育种和功能研究提供理论基础。【方法】本研究通过高通量转录组测序和生物信息学技术获得桫椤unigenes序列,通...
关键词:桫椤 转录组 生物信息学 基因注释 SSR 
基于Illumina Bovine SNP 50K芯片对比利时蓝牛的遗传规律解析
《黑龙江畜牧兽医》2024年第20期45-52,62,125,126,共11页王雪艳 李小鹏 韩亚辉 刘悦欣 陶雪雨 韩志鹏 杨睿智 张成龙 周稳 徐新如 刘书东 
大学生创新创业训练计划项目(202210757004);新疆维吾尔自治区西门塔尔牛(安格斯)牛群体改良技术体系项目(2023XM-20)。
为了研究大型肉牛比利时蓝牛生长发育的遗传规律,筛选优异基因,试验基于Illumina Bovine SNP 50K芯片数据,采用PLINK软件对270头比利时蓝牛常染色体数据进行基因组长纯合片段(ROH)检测并基于选择信号分析,通过核苷酸多态性检测取前5%的...
关键词:比利时蓝牛 Illumina Bovine SNP 50K芯片 长纯合片段 选择信号分析 基因注释 基因功能富集分析 
产三峡肽素的草酸青霉SG-4的全基因组测序
《生物学杂志》2024年第5期20-25,共6页张极峰 白晓轩 刘超 李婧 李奥 刘士平 
湖北省自然科学基金项目(2023AFB188)。
为充分解析草酸青霉SG-4的遗传信息,利用二代Illumina测序和三代PacBio测序相结合的方法对SG-4的全基因组进行测序,经过基因组组装、基因预测和功能注释后,对全基因组进行共线性分析和次级代谢产物合成基因簇预测。结果表明,草酸青霉SG-...
关键词:草酸青霉 SG-4 基因组 基因注释 三峡肽素 
贝莱斯芽胞杆菌CS1.13生物合成TTMP相关基因分析及其发酵调控
《中国食品学报》2024年第10期37-46,共10页白丽君 兰箐松 张旭旭 鲁紫瑶 方海宇 刘君 禹艳春 蒋雪薇 
湖南省重点研发项目(2023NK2035);湖南省自然科学基金青年科学基金项目(2023JJ40017);湖南省教育厅优秀青年项目(23B0306);湖南省大学生创新训练计划项目(S202210536119)。
为解析芽胞杆菌四甲基吡嗪(TTMP)生物合成途径,对筛选自高盐稀态酱醪的贝莱斯芽胞杆菌CS1.13全基因组进行注释,结合固态发酵研究其TTMP的生物合成途径及调控特征,结果显示:COG、GO及碳水化合物活性酶注释发现CS1.13参与氨基酸代谢及转...
关键词:贝莱斯芽胞杆菌 四甲基吡嗪 基因注释 发酵调控 
白化红点齿蟾蝌蚪皮肤的转录组学分析
《水产学杂志》2024年第4期18-27,共10页柴鑫 杨卫诚 
国家自然科学基金项目(No.30560024);贵州省科技基金项目(黔科合LH字LKS〔2016〕,7207号合支撑〔2017〕2811号,黔科合重大专项字〔2016〕3022号).
为探究喀斯特洞穴的代表物种——红点齿蟾蝌蚪(Oreolalax rhodostigmatus)白化的分子调控机制,采用Illumina HiSeqTM4000对白化和黑色红点齿蟾蝌蚪皮肤组织进行了转录组测序,探寻基因表达差异,为红点齿蟾适应性进化提供理论依据。结果显...
关键词:红点齿蟾蝌蚪 皮肤白化 转录组测序 基因注释 
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