张帅

作品数:15被引量:69H指数:5
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供职机构:中国水产科学研究院南海水产研究所更多>>
发文主题:珠江河口棘头梅童鱼DNA条形码鱼卵12S_RRNA基因更多>>
发文领域:农业科学轻工技术与工程文化科学自动化与计算机技术更多>>
发文期刊:《上海海洋大学学报》《海洋学报》《浙江海洋大学学报(自然科学版)》《海洋科学》更多>>
所获基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项广东省科技计划工业攻关项目中国水产科学研究院基本科研业务费专项基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目更多>>
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基于环境DNA的涠洲岛周围海域布氏鲸种群分布初探
《南方水产科学》2024年第3期36-46,共11页郑若丹 陈炳耀 张帅 麦俊晓 蒋佩文 王文欣 李敏 
农业农村部渔业发展补助资金“珍贵濒危水生野生动物栖息地调查”;中国海油海洋环境与生态保护公益基金会海洋环保项目(CF-MEEC/TR/2023-15);中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2021SD18)。
鲸类作为海洋生态系统中的顶级捕食者,是维持海洋生态平衡和生态稳定的关键物种。广西涠洲岛布氏鲸(Ba-laenoptera edeni edeni)是中国近海唯一稳定出现的须鲸种群,但其栖息地分布现状尚不明确。由于布氏鲸活动能力强、分布范围广,目视...
关键词:环境DNA 布氏鲸 种群分布 涠洲岛 
基于DNA条形码技术的大亚湾春季鱼卵种类组成研究
《中国水产科学》2024年第4期416-428,共13页胡凯 李敏 张帅 蒋佩文 蔡研聪 陈作志 徐姗楠 
广东省重点领域研发计划项目(2020B1111030001);中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助项目(2023TD05);广州市基础与应用基础研究项目(202201010639)。
为了解大亚湾海域鱼类早期资源的空间分布和种类组成,利用DNA条形码技术对该区域鱼卵种类和分布进行研究。于2022年4月在大亚湾的14个站点进行了采样调查,采用线粒体DNA的CO I(cytochrome oxidase subunit I)片段作为分子标记,利用DNA...
关键词:DNA条形码 鱼卵 种类组成 大亚湾 
利用环境DNA技术探测南海西沙鲸类物种多样性
《中国水产科学》2023年第12期1566-1576,共11页麦俊晓 张帅 郑若丹 王腾 赖晓芳 蒋佩文 王文欣 陈作志 李敏 
农业农村部渔业发展补助资金项目(珍贵濒危水生野生动物栖息地调查);中国海油海洋环境与生态保护公益基金会海洋环保项目(CF-MEEC/TR/2023-15);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2021SD18).
本研究通过提取南海西沙海域水体样本的环境DNA,利用鲸类线粒体12S rRNA和16S rRNA通用引物进行扩增和高通量测序,并结合目视观测的结果探讨环境DNA技术在鲸类物种多样性研究中的应用前景。结果显示,4种通用引物在鲸类鉴定方面具有一定...
关键词:环境DNA 通用引物 鲸类 物种多样性 西沙 南海 
基于DNA条形码技术的珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征的研究被引量:5
《海洋学报》2023年第3期52-65,共14页孔啸兰 张帅 陈作志 林昭进 蒋佩文 江艳娥 
广东省重点领域研发计划(2020B1111030001);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605);中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2020TD05)。
采用线粒体COⅠ和12S rRNA基因片段作为DNA条形码,分析珠江口春季鱼卵和仔稚鱼种类组成和分布特征,并探究两种条形码在鱼卵和仔稚鱼种类鉴定中的适用性。研究共扩增样本391个,成功鉴定的鱼卵和仔稚鱼共7目25科42属60种(2种未鉴定到种)...
关键词:COⅠ基因 12S rRNA基因 鱼卵和仔稚鱼 DNA条形码 
基于环境DNA宏条形码的珠江河口鱼类种类组成被引量:4
《上海海洋大学学报》2022年第6期1423-1433,共11页李红婷 邹柯姝 张帅 曹漪婷 卢芷程 陈作志 李敏 
中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2019TS13,2021SD18);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605);广东省科技计划项目(2019B121201001)。
利用环境DNA宏条形码技术对珠江河口区的鱼类组成进行初步探究。采用线粒体12S部分序列作为条形码标记,对采自珠江口伶仃洋7个采样点的水样滤膜DNA进行扩增,共获得有效序列26 777条,聚类得到35种可操作分类单元(OTU)序列。经比对共检测...
关键词:环境DNA(eDNA) 珠江河口 物种检测 鱼类多样性 
基于环境DNA宏条码和底拖网的珠江河口鱼类多样性被引量:13
《水生生物学报》2022年第11期1701-1711,共11页蒋佩文 李敏 张帅 陈作志 徐姗楠 
国家重点研发计划(2018YFD0900902);广东省科技计划项目(2019B121201001);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605);中国水产科学研究院基本科研业务费(2020TD05);中国水产科学研究院南海水产研究所基本科研业务费(2019TS13、2021SD18和2021SD01);广东省重点领域研发计划项目(2020B1111030001)资助~。
文章采用环境DNA宏条码和底拖网对珠江河口鱼类多样性进行了研究,并对两种方法进行了比较。利用环境DNA宏条码检测到了175种鱼类,而利用底拖网采集到了47种鱼类,结合两种方法共检测出179种鱼类,隶属于15目63科128属。其中两种方法共同...
关键词:12S rRNA基因 环境DNA 宏条码 鱼类多样性 珠江河口 
珠江河口棘头梅童鱼时空分布以及影响因素的研究进展被引量:3
《海洋科学》2022年第8期79-87,共9页熊朋莉 徐姗楠 陈作志 张帅 蒋佩文 范江涛 
国家重点研发计划(2018YFD0900902);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2020TD05,2021SD01)。
根据2019—2020年珠江河口底拖网调查数据,结合实测环境数据和遥感环境数据,建立以资源密度为响应变量的珠江河口棘头梅童鱼的广义加性模型(generalized additive models,GAM),分析棘头梅童鱼(Collichthy lucidus)时空分布规律,筛选影...
关键词:时空分布 环境因子影响效应 GAM模型 棘头梅童鱼 珠江河口 
基于线粒体COI和12S rDNA基因构建珠江河口鱼类DNA宏条形码数据库被引量:11
《南方水产科学》2022年第3期13-21,共9页蒋佩文 李敏 张帅 陈作志 徐姗楠 
广东省基础与应用基础研究重大项目(2019B030302004-05);广东省科技计划项目(2019B121201001);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605);中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2019TS13,2021SD18)。
为建立珠江河口鱼类本底DNA条形码数据库,为珠江河口鱼类种类识别和多样性研究提供信息化基础,于2020—2021年在珠江河口采集鱼类样本251尾,测定了6目10科41属99种鱼类的219条线粒体COI基因5'端的652 bp序列和247条线粒体12S rDNA基因5...
关键词:鱼类 COI基因 12S rDNA基因 DNA条形码数据库 珠江河口 
基于宏条形码技术的南海亮眶灯鱼食性初步分析被引量:7
《南方水产科学》2022年第3期22-29,共8页陈晓雷 李敏 陈作志 张俊 张帅 齐占会 徐姗楠 
广东省基础与应用基础研究重大项目(2019B030302004-05);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605);中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费资助(2020TD16);中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2021SD04)。
食性研究是鱼类生物学和生态学研究的重要内容,是进行渔业资源开发和管理的基础。以南海亮眶灯鱼(Diaphus splendidus)为研究对象,提取其胃含物DNA,选用线粒体基因细胞色素C氧化酶亚基I(Mitochondrial cytochrome oxidase subunit I,COI...
关键词:灯笼鱼 亮眶灯鱼 食性 宏条形码 胃含物 南海 
珠江河口水体环境DNA提取方法的建立及优化被引量:4
《南方水产科学》2022年第3期30-37,共8页李红婷 张帅 邹柯姝 陈作志 陈晓雷 蒋佩文 曹漪婷 李敏 
国家科技基础调查专项(2019FY101905);广东省科技计划项目(2019B121201001);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0605);中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2019TS13,2021SD18)。
近年来,环境DNA(eDNA)技术广泛应用于水生生物多样性研究。以珠江河口咸淡水生态系统为研究区域,采用滤膜法富集eDNA,选取直径47 mm、孔径0.45μm的硝酸纤维膜、醋酸纤维膜、玻璃纤维膜和聚碳酸酯膜共4种材质的滤膜,采用4种滤膜保存方法...
关键词:珠江河口 eDNA获取 eDNA保存 eDNA提取 
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