李文军

作品数：2被引量：1H指数：1
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供职机构：中国科学技术大学计算机科学与技术学院更多>>
发文主题：串联质谱肽段蛋白质翻译后修饰序列标签翻译后修饰更多>>
发文领域：自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《计算机工程》《计算机应用》更多>>
所获基金：国家自然科学基金更多>>
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基于肽序列标签的蛋白质翻译后修饰中的过滤算法
《计算机应用》2012年第5期1488-1490,共3页李文军 徐云 邵明芝 
国家自然科学基金重点项目(60533020)
大量的质谱数据无法被鉴定或是鉴定的精度不够高,特别是在肽段数据库较大时,普通的算法精度下降很快。提出一种新的盲搜索算法,此算法基于一种全新的基于相似关系度量的打分模型。为了处理大规模问题,同时还应用了基于母离子质量和肽序...
关键词：肽序列标签 翻译后修饰 质谱 盲搜索 大规模 
基于串联质谱的快速肽段鉴定算法被引量：1
《计算机工程》2010年第18期214-216,共3页邵明芝 徐云 王颖 李文军 
国家自然科学基金资助重点项目"当代并行机的并行算法应用基础研究"(60533020)
在现有RT-PSM算法的基础上,完成蛋白质数据库酶切成肽段数据库的转换过程,提出有效峰提取的优化策略,设计一个肽段鉴定算法——FPI-PSM。对于没有翻译后修饰的情形,采用Keller数据集进行测试。与RT-PSM算法相比,FPI-PSM算法的灵敏度提高...
关键词：串联质谱 肽段鉴定 碎片离子 有效峰提取 
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