袁娜

作品数：10被引量：28H指数：3
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供职机构：江苏省农业科学院更多>>
发文主题：菜豆分子标记棉花生物信息学分子育种更多>>
发文领域：农业科学生物学经济管理更多>>
发文期刊：《棉花学报》《江苏农业学报》《群众》《江苏农业科学》更多>>
所获基金：江苏省农业科技自主创新基金国家自然科学基金江苏省自然科学基金转基因生物新品种培育专项更多>>
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基于靶向测序技术的菜豆SNP液相芯片开发及验证被引量：1
《园艺学报》2024年第5期1017-1032,共16页袁娜 徐勤圆 徐照龙 周玲 刘晓庆 陈新 杜建厂 
江苏省农业科技自主创新项目[CX(20)3099]。
根据公开发表的菜豆基因组和重测序数据,利用生物信息学的方法筛选出61950个高质量SNP位点,通过对目标位点进行探针设计评估,最终设计开发出分别包含40352、20855和10486个SNP位点的40K、20K和10K液相芯片。利用10K液相芯片,对89份菜豆...
关键词：菜豆 单核苷酸多态性 靶向测序 遗传多样性 
激发江苏种业强“芯”活力被引量：2
《群众》2022年第10期32-33,共2页赵涵 袁娜 
粮食安全是“国之大者”,是影响国家长治久安的重要因素。种子是我国粮食安全的关键,种业是保障国家粮食安全的核心所在。习近平总书记高度重视种业发展,强调要实现种业科技自立自强、种源自主可控,为种业高质量发展指明方向。江苏地处...
关键词：粮食安全 自立自强 种业科技 种业发展 东部沿海 创新能力建设 竞争主体 自主可控 
菜豆CACTA转座元件注释、标记开发及其在品种鉴定中的应用
《南京农业大学学报》2021年第4期646-655,共10页翟小杰 李阳 程静 徐照龙 刘大亮 袁娜 李英 杜建厂 
国家自然科学基金项目(31370266);江苏省农业科技自主创新基金(CX20-3099)。
[目的]本文旨在对菜豆(Phaseolus vulgaris)基因组中CACTA转座元件进行鉴定,分析其序列特征、插入位点特征、进化关系、基因结构和功能基因并进行标记开发,为CACTA转座元件功能研究和应用奠定基础。[方法]基于菜豆的全基因组数据,采用...
关键词：CACTA转座元件 分子标记 生物信息学 菜豆 
油菜杂交种宁杂21号及其双亲苗期在盐胁迫条件下差异表达基因分析被引量：2
《中国油料作物学报》2020年第4期603-612,共10页郭月 于艳芳 龙卫华 杜建厂 刘静 付丽 浦惠明 张洁夫 高建芹 袁娜 胡琼 胡茂龙 
中国农科院油料所农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室开放课题(KF2018005);国家重点研发计划(2016YFD0101300);国家农业现代产业技术体系建设专项(CARS-12);江苏省农业生物学重点实验室开放课题项目(4911707Z201810)。
为了解甘蓝型油菜杂种优势在盐胁迫中的表现,遏制减产,以油菜强优势杂交种宁杂21号及其亲本为材料,通过转录组测序,筛选鉴定得到1078个芽苗期差异表达基因(DEG)与耐盐杂种优势密切相关,并能被已有盐胁迫相关QTL注释,部分基因的表达能被...
关键词：甘蓝型油菜 耐盐 杂种优势 转录组 遗传机制 
绿豆Copia类反转座子全基因组注释及进化分析
《江苏农业学报》2020年第4期858-867,共10页李阳 袁娜 刘大亮 翟小杰 徐照龙 程静 杜建厂 
国家自然科学基金项目(31370266);江苏省农业科技自主创新基金项目(CX17-3004)。
利用基于结构从头寻找和同源比对的方法,从绿豆基因组中鉴定出插入位置明确的1198个完整的Copia类反转座子和1038个solo LTR转座子元件。这些元件不均匀分布在绿豆的22条染色体上,并和功能基因的分布呈现显著的负相关关系。绝大部分Copi...
关键词：Copia类反转座子 插入时间 进化树 绿豆 
棉花多肽的分离提取方法建立及质谱鉴定被引量：2
《江苏农业科学》2019年第20期95-98,共4页袁娜 戴琛 杨郁文 杜建厂 张保龙 
江苏省自然科学基金(编号:BK20170604)
多肽是一类小分子物质,在植物生长、发育及抗逆等众多生命过程中起着重要的调控作用。旨在探索棉花根部多肽的分离提取方法,建立基于改良尿素法的棉花多肽组样品收集方法。基于该方法,笔者在棉花根部组织中获得809个小分子肽序列,这些...
关键词：棉花 多肽 蛋白质组学 质谱分析 
棉花CLE多肽家族的全基因组鉴定与生物信息学分析被引量：7
《棉花学报》2019年第4期263-281,共19页袁娜 李阳 杨郁文 张保龙 杜建厂 
江苏省自然科学青年基金(BK20170604)
【目的】CLE(CLAVATA3/Embryo surrounding region-related)多肽是一类小分子分泌蛋白,在植物生长发育过程中,对于维持分生组织细胞增殖与分化间的平衡起到重要的信号转导和调控作用。CLE家族是迄今为止报道的最大的植物多肽分子家族,...
关键词：CLE基因 多肽 棉花 生物信息学 
棉花FAR1/FHY3基因家族的全基因组分析被引量：8
《棉花学报》2018年第1期1-11,共11页袁娜 王彤 刘廷利 杨郁文 郭月 刘静 张保龙 杜建厂 
江苏省自然科学基金(BK20170604);江苏省农业科技自主创新(CX(14)2007);转基因生物新品种培育重大专项(2014ZX0800501B)
【目的】FAR1/FHY3是1类起源于转座子酶的转录因子,在光敏色素A(phyA)信号通路的启动中起到非常重要的作用。通过对FAR1/FHY3家族进行全基因组学分析,为深入研究FAR1/FHY3在棉花光信号通路中的分子调控机理提供基础。【方法】利用生物...
关键词：亚洲棉 雷蒙德氏棉 陆地棉 FAR1/FHY3 生物信息学 
基于matK基因和ITS序列的江苏地方豆类植物的亲缘关系研究被引量：4
《南京农业大学学报》2017年第5期795-803,共9页王彤 刘静 郭月 袁娜 杜建厂 
国家自然科学基金项目(31370266);江苏省农业科技自主创新基金项目[CX14(5010)]
[目的]为探究江苏地方豆类植物之间的亲缘关系,从分子水平上对14种豆科植物进行了深入分析,旨在为后续豆类植物的种质创新和遗传改良提供理论依据。[方法]对14种豆类植物的mat K基因和ITS序列的扩增片段进行PCR产物直接测序,并结合Gen B...
关键词：豆类植物 MATK基因 ITS序列 亲缘关系 分化时间 
陆地棉NF-YB基因家族的全基因组分析被引量：2
《华北农学报》2016年第5期21-27,共7页刘静 徐珍珍 袁娜 郭月 张保龙 杜建厂 
江苏省“333”人才工程项目(BRA2013267);江苏省农业科技自主创新基金项目(CX13(3059));棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2016B03)
为了进一步了解NF-YB基因家族结构的功能,利用生物信息学手段,系统研究了陆地棉标准系TM-1基因组中NF-YB基因家族的数目、亚细胞定位、染色体分布、进化关系、基序以及组织表达情况。结果表明:TM-1基因组中共有41个NF-YB基因家族成员,...
关键词：NF-YB基因家族 陆地棉 生物信息 
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