生物信息学在脂肪酶热稳定性评价中的应用  

Application of Bioinformatics in Evaluating the Thermostability of CALB

作　　者：孔祥禄[1] 郑穗平[1] 苏国栋[1] 杜红丽[1] 林影[1] 

机构地区：[1]华南理工大学生物科学与工程学院,广东省发酵与酶工程重点实验室,广东番禺510006

出　　处：《山西大学学报（自然科学版）》2009年第A02期113-116,共4页Journal of Shanxi University(Natural Science Edition)

基　　金：国家自然科学基金（No.U0773001）

摘　　要：研究利用实验室已有数据，通过同源建模、结构分析、分子动力学模拟等生物信息学方法探索一种新的脂肪酶热稳定性评价的方法．结果显示，酶三维结构中局部氢键和其相应的整体能量可以作为评价脂肪酶耐热性的参数．其中通过分子动力学所得的整体能量或RMSD值与热稳定性成负相关，相关系数分别为0．79和0．75．研究所获得方法将可以进一步应用到提高脂肪酶热稳定性的理性设计中去．Based on experimental data, a new method in qualitative evaluation thermal stability of lipases was explored by using bioinformatics tools such ashomology modeling, structure analyzing and molecular dynamics simulations. Consequently,we found that we can use its total energy and RMSD as the parameters in evaluating the thermal stability of lipases. The two parameters are negative correlation to the thermal stability of lipases and the correlation are 0.79 and 0.75 ,respectively. Our method will be further applied in theoretical design to enhance the thermal stability of lipase.

关 键 词：南极假丝酵母脂肪酶 同源建模 热稳定性 分子动力学模拟 

分 类 号：TQ925[轻工技术与工程—发酵工程]