基于支持向量机的基因剪接位点研究  

作　　者：李建晶[1] 赵苗[1] 齐丽丽[1] 李春波[1] 

机构地区：[1]河北工业大学计算机科学与软件学院

出　　处：《科学时代》2010年第1期44-45,共2页SCIENCE TIMES

摘　　要：只要将内含子识别出来就可以得到准确的剪接位点。所以在此使用识别内含子的方法来获得剪接位点。首先利用支持向量机算法，分析供体位点和受体位点之间的内含子两端序列对于基因剪接的影响，并对内含子两端序列的长度与剪接的关联性进行了深入的研究。研究发现，内含子区别于伪内含子的特征信息同时存在于内含子两端大约各70个碱基。由于标准支持向量机受类别差异影响和噪声、野值数据干扰较重，使得分类能力不高，所以提出将一种改进的支持向量机算法……加权近似支持向量机应用于剪接位点的识别中，结果表明加权近似支持向量机在识别内含子的准确率方面要优于标准支持向量机。

关 键 词：支持向量机算法 剪接位点 基因剪接 受体位点 内含子 特征信息 分类能力 序列对 

分 类 号：Q522.2[生物学—生物化学]