染色体微阵列分析技术在核型正常的骨骼系统发育异常患儿中的应用研究  

Application of chromosome microarray analysis for patients with skeletal anomalies and a normal karyotype

作　　者：郭乔丽[1] 符芳[1] 李茹[1] 张永玲[1] 杨昕[1] 韩瑾[1] 潘敏[1] 甄理[1] 廖灿[1] 

机构地区：[1]广州医科大学附属广州市妇女儿童医疗中心优生围产研究所,510000

出　　处：《中华医学遗传学杂志》2016年第3期306-311,共6页Chinese Journal of Medical Genetics

基　　金：广东省科技计划项目（重点项目：20148020213001,面上项目：20138022000005）;广州市科信局重点项目（2014Y2-00059）

摘　　要：目的探讨染色体微阵列分析技术（chromosome microarray analysis，CMA）在核型正常的骨骼系统发育异常（skeletal anomalies，SA）患儿中的应用价值。方法选取2012年6月至2015年5月因骨骼系统发育异常伴或不伴有其他异常而到广州市妇女儿童医疗中心就诊的43例患儿。所有患儿均行常规G显带染色体核型分析，核型结果正常者按照美国Affymetrix公司CytoScan750K芯片的标准操作流程进一步行全基因组CMA检测，并通过配套的CHAS软件及相关的生物信息学方法分析检测结果。结果43例患儿中，染色体核型分析发现2例患儿染色体核型异常，核型异常比例为4．65％。41例核型结果正常的患儿进一步行全基因组CMA检测。在CMA检测的患儿中，分为单纯SA组17例，SA合并精神运动发育迟缓组6例，SA合并其他系统结构畸形组18例。CMA检测结果提示9例患儿基因组发生了致病性拷贝数变异（copy number variations，CNVs），致病性CNVs的总体检出率为21．95％。其中，单纯SA组、SA合并精神发育迟缓组以及SA合并其他系统结构畸形组的致病性CNVs检出率分别为17．65％（3／17）、33．33％（e／6）以及22．22％（4／18）[P=0．576（17．65％vs．33．33％）、P=1．000（17．65％VS．22．22％）和P=0．618（33．33％vs．22．22％），Fisher’s检验]。结论全基因组高分辨率CMA技术在核型正常的骨骼系统发育异常患儿中能够将致病性检出率额外提高了21．95％，建议染色体核型结果正常的骨骼系统发育异常患者进一步行CMA检测。单纯SA组、SA合并精神运动发育迟缓组以及SA合并其他结构畸形组之间其致病性CNVs检出率没有统计学差异。Objective To analyze patients with skeletal anomalies （SA） but a normal karyotype using chromosome microarray analysis （CMA）. Methods From June 2012 to May 2015, 43 children found to have skeletal anomalies with or without other abnormalities were subjected to karyotyping analysis. For those with a normal karyotype, DNA was extracted and hybridized with Affymetrix CytoScan 750 kb arrays following the manufacturer＇s protocol. The results were analyzed with CHAS v2.0 software. Results Two patients （4.65%） were detected with an abnormal karyotype. The remaining 41 patients with a normal karyotype were classified into 3 groups： isolated SA （n： 17）, SA with mental retardation （n=6）, and SA with other structural anomalies （n= 18）. Clinically significant copy number variations （CNVs） were found in 21.95% （9/41） of the cases, which included 17.65%（3/17） with isolated SA, 33.33% （2/6） with SA and mental retardation, and 22.22% （4/18） of SA with other structural deformities. Conclusion Wholegenome CMA can detect clinically significant CNVs which may not be found by conventional karyotyping analysis and increase the detection rate by approximately 21.95 %. It may be recommended for patients with SA but a normal karyotype.

关 键 词：染色体微阵列分析 拷贝数变异 骨骼系统发育异常 基因型-表型关系分析 

分 类 号：R726.8[医药卫生—儿科] R440[医药卫生—临床医学]