湖南省自然科学基金(07JJ5086)

作品数:6被引量:12H指数:2
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基于YKW图形表达的人类基因短编码序列识别
《计算机应用》2011年第8期2087-2091,共5页骆嘉伟 颜军 何海峰 
国家自然科学基金资助项目(60873184);湖南省自然科学基金资助项目(07JJ5086)
针对人类短编码序列的识别问题,根据碱基在密码子三个位置的偏性和碱基自身物理化学性质的分类,提出一种新的图形表示方法——YKW图形,然后在此图形上,提取了9个有效的面积矩阵特征,识别过程中,为了提高识别率利用递增特征选择算法添加...
关键词:图形表达 短编码序列识别 面积矩阵 基因序列 
基于BW ratio与二进制量子粒子群的基因选择方法
《微计算机信息》2011年第1期224-226,共3页杨华 骆嘉伟 
基金申请人:骆嘉伟;项目名称:新型表达模式下的功能基因分析算法研究;基金颁发部门:国家自然科学基金委(60873184);基金申请人:骆嘉伟;项目名称:基于聚类的基因功能预测方法;基金颁发部门湖南省自然科学基金委(07JJ5086)
信息基因选择在肿瘤识别问题中起着关键作用。本文提出了一种新的组合式的肿瘤信息基因选择方法,首先从单个基因的样本相关性角度出发,采用BW-ratio过滤指标对基因子集进行初选;然后采用二进制量子粒子群算法进一步对信息基因精选,支持...
关键词:基因表达谱 信息基因选择 二进制量子粒子群算法 支持向量机 
RNA二级结构的2D图形表示及相似性分析
《世界科技研究与发展》2010年第5期586-589,共4页杨卫东 骆嘉伟 
国家自然基金(60873184);湖南省自然科学基金(07JJ5086)
结合RNA序列的核苷酸分类提出了一种新的RNA二级结构的2D图形表示法。该图形表示法能够唯一地表示RNA二级结构,而且图形是无退化的,即不存在重叠或交叉现象。把该图形表示法应用于9个病毒RNA二级结构,通过计算这些序列的数字特征和序列...
关键词:RNA二级结构 图形表示法 相似性 2D 
基于最小二乘模糊支持向量机的基因分类研究被引量:6
《计算机应用研究》2010年第2期459-461,共3页骆嘉伟 苏涵沐 陈涛 
国家自然科学基金资助项目(60873184);湖南省自然科学基金资助项目(07JJ5086)
随着大量基因表达数据的涌现,把海量的数据划分成数量相对较少的组,有助于提取对生理学和医药学等有价值的生物信息。基因分类技术能够很好地处理和分析这些基因数据。提出了一种应用于基因分类的模糊最小二乘支持向量机方法,通过设置...
关键词:基因微阵列 基因分类 最小二乘 隶属度函数 模糊支持向量机 
基于信息离散度的DNA序列相似性分析被引量:4
《计算机应用》2009年第1期269-272,共4页骆嘉伟 刘芳 杨华 
国家自然科学基金资助项目(60873184);湖南省自然科学基金资助项目(07JJ5086)
信息离散性度量方法在生物信息处理领域中获得成功的应用,其基本思想是利用子序列分布差异来表示序列之间的差异,但是子序列长度的变化对结果的影响较大。文中提出了一种新的基于信息离散度的DNA序列相似性分析方法,利用不同距离的碱基...
关键词:碱基对 完全信息集 离散度函数 相似性 
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