云南省应用基础研究基金(2011FB082)

作品数：10被引量：6H指数：1
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果蝇核小体定位研究进展被引量：1
《基因组学与应用生物学》2016年第11期3024-3027,共4页李泽华 丰继华 周晓雯 于华峥 陈静 
国家自然科学基金资助项目(31160-234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082);云南省高校重点实验室开放基金(MWK201104);云南民族大学校级研究生项目"果蝇核小体定位成因的研究"共同资助
基因组上核小体位置的确定涉及DNA、RNA聚合酶、转录因子、后转录修饰与组蛋白变异、组蛋白修饰酶和染色质重塑复合体之间的相互作用。真核状态基因组的DNA是被包裹在核小体中,故理解控制核小体沿DNA定位的原理对于进一步理解组蛋白结...
关键词：核小体 核小体定位 果蝇 
不同转录率下真核模式生物核小体位置研究
《云南民族大学学报（自然科学版）》2016年第1期81-86,共6页魏恨恨 丰继华 胡焕 周晓雯 李泽华 
国家自然科学基金(31160234);云南省应用基础研究计划(2011FB082);省高校重点实验室开放基金(MWK201104);云南民族大学研究生创新基金(2015YJCXY256)
真核生物中核小体的位置在不同转录率基因上是不同的.我们通过对热冲击前后酵母核小体位置实验数据、酵母转录率数据进行统计分析和比较后,发现在压力环境下,敏感上表达基因中的高转录水平基因与敏感下表达基因中低转录水平基因上的核...
关键词：平衡位置 热冲击 转录水平 敏感表达基因 
ISW2缺失下基因功能对核小体定位影响的研究
《生物物理学》2015年第4期67-76,共10页胡焕 丰继华 魏恨恨 周晓雯 李泽华 
国家自然科学基金资助项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082);省高校重点实验室开放基金(MWK201104);云南民族大学校级研究生一般项目(2015YJCXY255)。
为研究染色质重塑因子对核小体定位的影响以及ISW2缺失情况下基因功能对核小体形成的作用,本文分别对ISW2敲除、野生型(WT)及富营养培养条件下(YPD)三种酵母核小体占位率数据进行聚类、比较、分析后发现,在ISW2缺失情况下核小体的位置远...
关键词：核小体定位 基因功能(GO) ISW2 野生型 富营养培养 
压力条件下真核模式生物核小体移动模式研究
《基因组学与应用生物学》2015年第7期1473-1481,共9页魏恨恨 丰继华 胡焕 周晓雯 李泽华 
国家自然科学基金资助项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082);云南省高校重点实验室开放基金(MWK201104)共同资助
细胞在面对外界压力(热冲击)时会通过重塑核小体以应对环境变化。本文通过对热冲击前后酵母核小体位置实验数据、体外实验数据进行统计、比较、分析后,发现在没有任何生理扰动下,核小体的定位跟其DNA偏好性有关。但在环境压力下,对热冲...
关键词：热冲击 发散模式 收敛模式 基础表达 
基于DNA弯曲度的H2A.Z核小体定位与修饰研究
《生物信息学》2015年第1期13-17,共5页单增辉 丰继华 陈攀峰 魏恨恨 胡焕 
国家自然科学基金项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082)
在真核生物染色质中,H2A.Z是高度保守的组蛋白变异体,与转录调控、基因组的稳定性密切相关。为了探讨组蛋白修饰、DNA弯曲度与H2A.Z核小体定位三者之间的关联,在得到实验所测的相关数据后,利用MINE算法并结合皮尔逊相关系数在酵母全基...
关键词：转录起始位点(TSS) 组蛋白变异体 H2A.Z 修饰 核小体 
酵母基因组组蛋白修饰之间相关性的研究被引量：1
《基因组学与应用生物学》2015年第1期185-189,共5页陈攀峰 丰继华 单增辉 魏恨恨 胡焕 
国家自然科学基金资助项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082);云南省高校重点实验室开放基金(MWK201104)共同资助
我们在对染色质修饰作用进行研究的过程中,发现以往的研究只关注化学修饰间的线性关系,而对于非线性关系未充分重视。为此,我们对Pokholok等(2005)人测出的酵母组蛋白甲基化修饰与乙酰化修饰数据进行了插值处理,得到了16种全基因组组蛋...
关键词：组蛋白修饰 Pearson相关分析法 MINE算法 
两种模式生物核小体定位比较研究
《生物信息学》2014年第3期162-166,共5页卢英 丰继华 单秋甫 陈攀峰 单增辉 
国家自然科学基金资助项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082);省高校重点实验室开放基金(MWK201104)资助
在对两种模式生物酵母与果蝇胚胎期核小体定位进行研究时,发现不同物种间以及同一物种中不同表达模式基因上的核小体分布呈现出差显著异性。在总体上,转录起始位点附近的酵母核小体NFR区域比果蝇的NFR短。经基因中心对齐后,酵母与果蝇...
关键词：酵母 果蝇胚胎期 核小体定位 核小体缺失区域(NFR) 
酵母和果蝇胚胎期核小体定位模式比较研究
《信息通信》2014年第3期48-50,共3页卢英 丰继华 单秋甫 
国家自然科学基金资助项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082);省高校重点实验室开放基金(MWK201104)
在进行酵母与果蝇胚胎期核小体定位研究时,发现不同物种或同一物种中不同表达模式基因与全体基因的排列比较中,核小体分布呈现出差异性。我们观察到酵母全体基因中核小体排列对核小体缺失区域(NFR)的基因3’端比基因5’端的影响小,而果...
关键词：酵母 果蝇胚胎期 核小体定位 核小体缺失区域(NFR) 
果蝇胚胎期不同表达模式基因转录起始位点上游核小体的定位被引量：1
《生物物理学报》2014年第1期72-78,共7页单秋甫 丰继华 卢英 单增辉 陈攀峰 
国家自然科学基金项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082)~~
在研究果蝇胚胎期核小体定位时,发现不同表达模式基因上的核小体定位特征有着很大的差异。与以往研究结果不同的是,在果蝇胚胎期限制性表达基因的转录起始位点上游-1核小体位置上存在着H2A.Z核小体。有趣的是,与单细胞酵母基因上的核小...
关键词：核小体 表达模式 转录起始位点 
基于核小体位置预测的酵母进化印迹研究被引量：3
《生物信息学》2013年第2期150-152,160,共4页肖建平 丰继华 卢英 单秋甫 
国家自然科学基金资助项目(31160234);云南省应用基础研究计划项目(2011FB082)
在利用核小体定位实验数据训练支持向量机(SVM)对任意酵母DNA序列的核小体形成能力进行预测的过程中,发现染色质结构对基因组DNA分子进化过程有着显著影响。我们观察到核小体DNA比连接DNA的平均预测准确率低15%,这种普遍存在的局部预测...
关键词：核小体 转录起始位点 预测准确率 进化印记 
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