转录起始位点

作品数：60被引量：100H指数：5
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转录起始位点预测方法的研究进展
《信阳师范学院学报（自然科学版）》2024年第1期127-134,共8页郝瑞杰 李星雨 马子菡 李敏 邵燕瑞 晋朦朦 杨稚萱 杨柯华 丁依菲 李浩哲 魏雪锋 
国家自然科学基金项目(31802043);河南省自然科学基金项目(162300410227);河南省高校重点研究项目(17A230007);信阳师范学院青年科研基金项目(2018-QN-044);信阳师范学院生科院特色骨干学科培育项目;国家级大学生科创项目(S201810477010)。
详细介绍了计算定位法在转录起始位点(TSS)鉴定中的重要作用,并重点分析了不同计算方法的建模原理、DNA序列特征采集和运行效率等。最后,展望了预测工具的未来发展方向,为有效开展TSS定位及转录调控研究奠定了基础。
关键词：转录起始位点 预测工具 效果分析 
通过优化的5'RACE技术鉴定牛脂肪组织KLF4基因转录起始位点
《农业生物技术学报》2023年第4期856-866,共11页郝瑞杰 张燕玲 徐淑雨 李敏 张铭铭 李星雨 陈亚珍 郭允 昝林森 
国家自然科学基金(31802043);河南省自然科学基金(162300410227);河南省高校重点研究项目(17A230007);信阳师范学院青年科研基金项目(2018-QN-044);国家级大学生科创项目(S201810477010);信阳师范学院生科院特色骨干学科培育项目。
5’cDNA末端快速扩增(5’rapid amplification of cDNA ends,5’RACE)技术是基因转录表达调控研究的关键手段之一,其操作复杂,对样品要求较高。牛(Bos taurus)脂肪组织杂质含量高,单位体积RNA含量低,经常造成5’cDNA末端扩增的失败,影...
关键词：5’cDNA末端快速扩增(5’RACE)技术 特异性反转录 RACE片段大小 牛脂肪组织 Kruppel样因子4(KLF4)基因 
细胞重编程过程中核小体定位改变研究进展
《遗传》2022年第3期208-215,共8页崔浩亮 史佩华 高锦春 张新博 赵顺然 陶晨雨 
国家自然科学基金项目(编号:31802063);河北省自然科学基金项目(编号:C2020204058);河北农业大学引进人才科研专项(编号:ZD201718)资助。
细胞重编程是指在精卵结合或核移植过程中,核遗传物质的表观遗传标记发生删除和重塑,从而使已分化的细胞成为具有全能性的过程。发生细胞重编程的方法主要有细胞融合、体细胞核移植以及诱导多能干细胞等。核小体是染色质的基本结构及功...
关键词：细胞重编程 核小体定位 染色质重塑 转录起始位点 
中国科学院实现利用基因组编辑精细调控草莓糖分含量
《蔬菜》2020年第10期18-18,共1页
中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组发现,对基因上游转录起始位点(uORF)进行编辑可显著提高基因翻译效率,利用自有的基因组编辑调控植物内源基因翻译效率技术体系在无性繁殖作物草莓中实现了对数量性状的精细调控,并获得了...
关键词：无性繁殖作物 糖分含量 中国科学院 基因组编辑 生物学研究所 转录起始位点 胞嘧啶 数量性状 
真核模式生物核小体分布参数模型分析被引量：1
《生物学杂志》2020年第2期37-40,共4页丰继华 郭亚茹 牟锦 黄月月 刘珂 范力栋 
国家自然科学基金(31160234)。
真核生物核小体空间分布影响着遗传信息的传递,是表观遗传和基因工程的研究基础,对其进行数学建模是研究DNA三维结构与基因调控的基本途径,但空间维度建模素来为科学研究的难题。为比较单细胞与多细胞生物基因转录起始位点周围核小体分...
关键词：核小体 真核模式生物 转录起始位点(TSS) 果蝇 酵母 正弦复合模型 
prtR严紧调控的分子基础及对绿脓杆菌素表达的影响被引量：1
《生物技术》2018年第4期361-365,共5页孙子羽 满都拉 陈忠军 吴卫辉 
教育部博士点基金项目("PrtR调控铜绿假单胞菌细胞毒性和耐药性的研究";20120031120019;新教师类);内蒙古自然科学基金项目("Suh B调控铜绿假单胞菌对β-内酰胺类抗生素耐药性的分子机制研究";No.2016BS0307);草原英才团队资助计划(内蒙古自治区农业微生物发酵产业创新人才团队)
[目的]阐明铜绿假单胞菌prtR严紧调控的分子基础及对绿脓杆菌素表达的影响。[方法]通过5'RACE确定prtR和ptrB的转录起始位点;通过RT-PCR的方法研究prtR的相对表达水平和对绿脓杆菌素表达的影响。[结果]prtR和ptrB的转录起始位点分别位...
关键词：铜绿假单胞菌 prtR 转录起始位点 调控 绿脓杆菌素 
家蚕滞育关联山梨醇脱氢酶基因的启动子活性分析被引量：2
《昆虫学报》2018年第4期391-397,共7页朱娟 谢雨辰 陈艳荣 唐顺明 易咏竹 沈兴家 
国家自然科学基金项目(31672490);江苏省自然科学基金项目(BK20151322);江苏省高校自然科学研究重大项目(15KJA180001)
【目的】明确家蚕Bombyx mori滞育关联基因山梨醇脱氢酶基因BmSDH(BmSDH-1,BmSDH-2a和BmSDH-2b)的转录特性。【方法】用5'RACE技术确定家蚕3个BmSDH基因的转录起始位点。利用PCR技术克隆3个BmSDH基因约1 kb及BmSDH-2a不同长度的启动子...
关键词：家蚕 启动子 山梨醇脱氢酶 滞育 转录起始位点 表达调控 
内含子ncRNA独立转录的研究进展
《国际遗传学杂志》2018年第1期44-49,共6页孙倩 马宁 高旭 赵炜明 
国家自然科学基金（81171997）
内含子 ncRNA 是非编码 RNA 的组成部分,它们在基因的转录调控和转录后调控中发挥着十分重要的作用.大多数内含子 ncRNA 随宿主基因一起转录,而部分内含子ncRNA 存在独立转录的特性.由于这种独立转录特性会对相关基因和通路产生重要的影...
关键词：内含子ncRNA 独立转录 转录起始位点 miRNA-mirtrons 
人SAMHD1基因核心启动子区域的初步鉴定和分析被引量：2
《安徽医科大学学报》2017年第11期1592-1596,共5页张栋 李苗苗 董阳 刘星赟 应松成 方圣云 沈玉先 
国家自然科学基金(编号:81372576);安徽省自然科学基金(编号:1508085MH158);安徽省博士后研究人员科研活动经费资助(编号:2015B066)
目的鉴定人不育-α-基序结构域和组氨酸/天冬氨酸残基双联体结构域包涵蛋白1(SAMHD1)基因的核心启动子区域,研究SAMHD1的转录调控机制。方法从Hep G2细胞中提取基因组DNA,PCR扩增SAMHD1基因翻译起始位点上游937、667、553、399 bp片段...
关键词：SAMHD1 核心启动子 转录起始位点 转录调控 
基于遗传片段分析系统的转录起始位点分析技术:从预测到结果评估被引量：2
《微生物学报》2017年第2期254-263,共10页黎志凤 张文燕 刘杨 曲绍峰 王岩 朱丽萍 李越中 
国家自然科学基金(31370123;30900027);高等学校博士学科点专项科研基金(200804221017);山东大学实验室建设软件项目(sy2008023)~~
【目的】以遗传片段分析仪内标法替代传统放射性标记引物延伸技术进行样本转录起始位点(TSS)分析,并弥补引物延伸技术应用于未知样本缺乏前期预测和后期评估环节,形成一套基于遗传片段分析仪内标法分析未知样品TSS的完整技术方案。【方...
关键词：片段分析系统 转录起始位点(TSS) 转录丰度 荧光标记引物 引物延伸 粘球菌 GROEL 
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