中国科学院知识创新工程重要方向项目(KGGX1-YW-13)

作品数：6被引量：7H指数：2
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相关作者：迟学斌郎显宇陆忠华涂强陈文亮更多>>
相关机构：中国科学院中国科学院研究生院更多>>
相关期刊：《微电子学与计算机》《计算机系统应用》《计算机应用研究》《科研信息化技术与应用》更多>>
相关主题：CUDA统一计算设备架构ZIGBEEWSN管理综述更多>>
相关领域：自动化与计算机技术电子电信生物学自然科学总论更多>>
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冷冻电镜三维重构在CPU-GPU系统中的并行性
《华中科技大学学报（自然科学版）》2011年第S1期115-119,共5页李兴建 李临川 谭光明 张佩珩 
国家重大研究发展计划资助项目(2009AA01A129);中国科学院知识创新工程重大项目(KGGX1-YW-13);国家自然科学基金资助项目(60803030)
为了有效地发掘和利用异构系统在应用和体系结构上的并行性,以冷冻电镜三维重构为例展示如何利用应用程序潜在的并行性.通过分析重构计算所有的并行性,实现了将动态自适应的划分算法用于任务在异构系统上高效的分发.在曙光星云系统的部...
关键词：任务级并行 数据级并行 高性能计算 统一计算设备架构(CUDA) 冷冻电镜 
基于CUDA的体数据可视化工具
《计算机系统应用》2011年第1期185-187,共3页叶良 单桂华 刘俊 迟学斌 
中国科学院知识创新工程重大项目(KGGX1-YW-13);财政部国家重大科研装备研制项目(ZDYZ2008-2)
GPU的可编程性和并行计算能力的飞速发展为可视化提供了新的解决途径。基于支持CUDA的GPU,利用光线投射,实现了一个可以对体数据进行交互式可视化的工具,包括阻光度融合、等值面绘制、MIP绘制以及X光线投影等多种绘制效果,并加入了Phon...
关键词：CUDA 可视化 光线投射 PHONG光照模型 
无线传感器网络管理综述被引量：4
《计算机系统应用》2010年第12期265-270,共6页毕斌 王金一 陈文亮 阎保平 
中国科学院十一五信息化专项(INFO-115-D02);中国科学院计算机网络信息中心知识创新工程青年人才领域基金资助项目(CNIC-QN-09005);中国科学院知识创新工程重大项目(KGGX1-YW-13)
作为一种新兴的网络范型,无线传感器网络为我们提供了一种新的监测和控制模型。由于传感器网络自身特性,给网络管理带来许多挑战,传统的网络管理不再适用于无线传感器网络。目前对于传感器网络管理的研究,尚无一个统一的管理标准。文中...
关键词：无线传感器网络 WSN 网络管理 管理框架 ZIGBEE 
基于CUDA的蛋白质翻译后修饰鉴定MS-Alignment算法加速研究被引量：1
《计算机应用研究》2010年第9期3409-3414,共6页翟艳堂 涂强 郎显宇 陆忠华 迟学斌 
中国科学院知识创新工程重大项目基金资助项目(KGGX1-YW-13);CNIC主任基金资助项目(CNIC_ZR_09005);财政部国家重大科研装备研制项目(ZDYZ2008-2);中国科学院院长奖获得者科研专项基金资助
对MS-Alignment算法进行分析得出该算法很难满足大规模数据对鉴定速度的要求,而且具有的一个特点是相同的任务在不同的数据上重复计算,为数据划分提供了基础。基于CUDA编程模型使用图形处理器（GPU）对步骤数据库检索及候选肽段生成进...
关键词：蛋白质翻译后修饰鉴定 MS-Alignment 图形处理器 统一计算设备架构 
InsPecT的千核并行及优化
《科研信息化技术与应用》2010年第4期76-82,共7页涂强 郎显宇 陆忠华 迟学斌 
中国科学院知识创新工程重大项目(批准号:KGGX1-YW-13)面向蛋白质科学的高性能计算研究;863项目(批准号:2006AA01A117)中国国家网格运行管理技术研究;863项目(批准号:2006AA01A116)面向科学研究的超级计算服务环境;863项目(编号:2009AA01A130)CNGrid生物信息与计算化学科学计算社区研究与开发;国家自然科学基金(批准号:60533020)当代并行机的并行算法应用基础研究;国家自然科学基金(批准号:60673064)特征信息发现的并行算法及实现研究
蛋白质翻译后修饰(PTMs)在复杂的生命过程中起到极其重要的调控作用,对蛋白质翻译后修饰的研究是对蛋白质结构及其功能分析的深入,也是当前蛋白质组学的重要方向。InsPecT软件由于具备盲搜索功能,在蛋白质翻译后修饰鉴定领域备受关注,...
关键词：蛋白质翻译后修饰鉴定 INSPECT 负载平衡 千核 
一种冷冻电子断层三维重构的并行迭代算法被引量：2
《微电子学与计算机》2009年第8期101-103,107,共4页万晓华 张法 刘志勇 
国家自然科学基金重点项目(900612019);中科院知识创新工程重大项目(KGGX1-YW-13)
迭代重构算法是当前解决冷冻电子断层三维重构问题的有效算法,但其海量计算需求限制了其广泛应用.提出了一种冷冻电子断层三维重构的并行迭代算法,在曙光4000H高性能计算机上的实验结果表明并行迭代算法不仅能够获得较好的加速性能,而...
关键词：冷冻电子断层 迭代算法 并行计算 
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