广东省生物芯片重点实验室基金

作品数：10被引量：14H指数：2
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相关机构：南方医科大学广西科技大学华南基因组研究中心广州医学院更多>>
相关期刊：《南方医科大学学报》《中国生物工程杂志》《热带医学杂志》《医学分子生物学杂志》更多>>
相关主题：基因表达谱转录因子结合位点转录调控网络电离肝组织更多>>
相关领域：医药卫生生物学更多>>
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结直肠癌组织特异性治疗靶点的生物信息学筛选
《医学分子生物学杂志》2011年第2期152-155,共4页尹曦 叶云 梁爽 马文丽 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金（No.2004B60144）
目的 预测与筛选结直肠癌组织特异性基因,作为靶向治疗的候选靶点.方法 利用自主开发的Python语言程序分析人类正常组织与结直肠癌组织mRNA表达的组织特异性,结合人类胚胎干细胞富集基因集以及文献挖掘结果,筛选可能的与结直肠癌发生或...
关键词：结直肠癌 组织特异性 治疗靶点 生物信息学 
不同分化程度卵巢癌细胞中胚胎干细胞相关通路的基因集富集分析被引量：1
《中国组织工程研究与临床康复》2010年第27期5006-5009,共4页叶云 王桂平 杨晓勤 尹曦 梁爽 郑文岭 马文丽 
广东省生物芯片重点实验室基金(2004B60144)资助项目~~
背景:近年来一些研究发现肿瘤细胞具有与干细胞类似的特征,因此,控制干细胞功能的某些基因调控网络,可能也在某些肿瘤中同样发挥作用。目的:观察不同分化程度卵巢癌的分子特征,获得与胚胎干细胞相关基因的表达情况。方法:从美国国立生...
关键词：表达谱 胚胎干细胞 分化 卵巢癌 基因通路 富集基因集 
利用基因表达谱提取乳腺癌细胞分化相关特征基因被引量：1
《热带医学杂志》2010年第4期377-379,393,共4页叶云 王桂平 杨晓勤 梁爽 郑文岭 马文丽 
广东省生物芯片重点实验室基金(No.2004B60144)
目的利用基因芯片数据挖掘识别与乳腺癌组织学分级相关的特征基因,对乳腺癌的临床诊断和生物医学研究起到借鉴和参考作用。方法从公共基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)获得乳腺癌芯片表达数据,利用支持向量机提取获得不同组...
关键词：表达谱 乳腺癌 组织学分级 支持向量机 特征基因 
Let-7a在人宫颈癌HeLa细胞不同周期时相的表达被引量：1
《南方医科大学学报》2009年第3期442-445,共4页周珏宇 马文丽 余海浪 肖维威 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金(2004B60144)
目的探讨微小RNAlet-7a在HeLa细胞不同周期时相的差异表达。方法应用经典的双胸苷阻断法将HeLa细胞同步化于不同的周期时相,应用流式细胞术检测同步化的效率。应用实时荧光定量RT-PCR方法检测不同周期时相的HeLa细胞中let-7a的表达水平...
关键词：HELA细胞 微小RNA 细胞周期 同步化 
肝组织选择性细胞通讯类基因转录调控网络的构建被引量：5
《南方医科大学学报》2008年第9期1582-1585,共4页廖之君 马文丽 梁爽 孟伟 商涛 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金(2004B60144)
目的探讨肝脏组织选择性基因表达的转录调控机制。方法按照基因功能的差异对组织选择性Affymetrix探针集(共3919条探针)进行聚类,挑选肝组织选择性细胞通讯类(LSCC)基因进行研究。收集各基因上游的500个碱基序列,用3种软件分别预测这些...
关键词：组织选择性 肝 转录因子 转录因子结合位点 转录调控网络 
肝组织选择性转录因子调控网络的构建被引量：1
《中国生物工程杂志》2008年第S1期7-10,共4页廖之君 马文丽 梁爽 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金资助项目(2004B60144)
目的:构建肝脏组织选择性转录因子的调控网络。方法:按照基因功能的差异对组织选择性Affymetrix探针集(共3919条探针)进行聚类,挑选肝组织选择性转录因子(liver-selective transcription factor,LSTF)基因进行研究。收集各基因上游的50...
关键词：组织选择性 肝 转录因子 转录因子结合位点 转录调控网络 
荧光交换标记法基因表达芯片的数据挖掘
《福建医科大学学报》2008年第3期236-239,共4页廖之君 马文丽 梁爽 刘华 张海燕 陈数珍 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金资助项目(2004B60144)
目的探讨荧光染料交换标记设计的基因芯片数据挖掘方法,并对低剂量电离辐射影响人成纤维细胞基因表达谱数据进行分析。方法应用GeneSifter在线软件和Panther生物学信息数据库,对下载于NCBI的GEO数据库的8个样品GSM(包含4个时间点),选择...
关键词：荧光 成纤维细胞 辐射 电离 芯片分析技术 自动数据处理 
电离辐射影响成纤维细胞基因调控网络的初步研究
《热带医学杂志》2008年第4期291-294,共4页廖之君 马文丽 梁爽 陈霞 商涛 董云巧 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金(No.2004B60144)。
目的探讨电离辐射影响人成纤维细胞基因表达的转录调控机制,并构建基因与相应转录因子的调控网络。方法先对前期研究已经获得的差异表达基因进行功能注释,选择结合功能类基因(数量最多)进入研究;再用MaxLAPS,TFME和SCOPE3种软件预测这...
关键词：电离辐射 细胞凋亡 转录因子 转录因子结合位点 转录调控网络 
电离辐射影响人成纤维细胞基因表达谱的数据挖掘被引量：3
《热带医学杂志》2008年第3期212-216,共5页廖之君 马文丽 梁爽 陈霞 左长清 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金(No.2004B60144)
目的从基因表达谱水平探讨2株人成纤维细胞和低剂量电离辐射3个时间点的可能交互效应,掘其差异表达基因。方法应用GeneSifter在线软件和Panther生物学信息数据库,对下载于NCBI的GEO(Gene Expression Omnibus)数据库的12个样品GSM(数据包...
关键词：电离辐射 人成纤维细胞 基因表达谱 数据挖掘 文献挖掘 
Velcade影响K562细胞基因表达谱的分子机制被引量：2
《南方医科大学学报》2008年第3期373-376,共4页廖之君 马文丽 孟伟 梁爽 孟凡义 郑文岭 
广东省生物芯片重点实验室基金(2004B60144)~~
目的应用生物信息学方法探索Velcade影响K562细胞基因表达谱的分子机制。方法提取并扩增Velcade处理组和溶剂对照组的K562细胞RNA,与22K Agilent Human1A基因芯片杂交,用Agilent Feature Extraction软件采集扫描数据,再以GeneSifter,GAT...
关键词：VELCADE 基因表达 数据挖掘 细胞凋亡 糜酶1基因 
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