国家自然科学基金(31270761)

作品数:5被引量:2H指数:1
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氟离子核糖开关调控行为的动力学研究
《武汉大学学报(理学版)》2020年第1期74-80,共7页龚沙 杜承意 李丹 
国家自然科学基金(31600592,31270761);湖北省重点实验室开放基金(201932003).
核糖开关位于RNA(ribonucleic acid)的非编码区,参与调控很多重要的生物过程。本文利用已发展的RNA转录折叠预测方法,研究了位于Thermotoga petrophila中的氟离子核糖开关。计算结果表明,该核糖开关在转录过程中先折叠成一个包含假结并...
关键词:氟离子核糖开关 转录折叠 基因调控 RNA结构 折叠动力学 
Molecular dynamic simulation of the thermodynamic and kinetic properties of nucleotide base pair
《Chinese Physics B》2017年第12期1-6,共6页王宇杰 王珍 王晏莉 张文炳 
Project supported by the National Natural Science Foundation of China(Grant Nos.11574234 and 31270761)
A nucleotide base pair is the basic unit of RNA structures. Understanding the thermodynamic and kinetic properties of the closing and opening of a base pair is vital for quantitative understanding the biological funct...
关键词:THERMODYNAMICS KINETICS molecular dynamic simulation 
丁型肝炎病毒(HDV)天然序列和G11C突变序列的转录折叠动力学研究被引量:1
《武汉大学学报(理学版)》2016年第1期69-77,共9页邹彦娟 龚沙 王宇杰 张文炳 
国家自然科学基金资助项目(31270761)
在转录折叠条件下,丁型肝炎病毒(HDV)的自剪切活性的发挥受到转录过程中形成的中间态结构、转录速率、突变位点等的影响.本文采用转录折叠动力学方法研究了HDV的天然(wild-type,wt)序列在不同转录速率下的转录折叠动力学行为,并分析了G...
关键词:转录折叠 主方程方法 HDV 突变 
Folding Kinetics of HDV Ribozyme with C13A:G82U and A16U:U79A Mutations被引量:1
《Wuhan University Journal of Natural Sciences》2015年第5期421-429,共9页ZOU Yanjuan WANG Yujie GONG Sha ZHANG Wenbing 
Supported by the National Natural Science Foundation of China(31270761)
Gene mutations influence the folding kinetics of hepatitis delta virus (HDV) ribozyme. In this work, we study the effect of the double mutation on the folding kinetics of HDV ribozyme. By using the master equation m...
关键词:hepatitis delta virus (HDV) ribozyme master equation method folding kinetics recursive search 
RNA碱基对的分子动力学模拟
《武汉大学学报(理学版)》2014年第3期269-274,共6页张勇 王宇杰 张文炳 
国家自然科学基金资助项目(31270761)
RNA作为一种重要的生物大分子,其很多生物功能都与其结构有关.RNA碱基对的热力学性质和动力学性质是预测RNA结构的基础.本文采用全原子分子动力学方法模拟了RNA碱基对G—C在3种不同温度下的打开及闭合情况,统计分析了其打开和闭合几率....
关键词:RNA碱基对 分子动力学模拟 自由能 热力学 
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