国家自然科学基金(69971010)

作品数：8被引量：50H指数：4
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再测序DNA微阵列的等长变覆盖探针设计方法被引量：1
《东南大学学报（自然科学版）》2004年第2期215-218,共4页谢建明 方辉 胡弘 陆祖宏 孙啸 
国家自然科学基金资助项目 ( 699710 10 );江苏省自然科学基金资助项目 (BK2 0 0 2 0 5 7)
针对再测序DNA微阵列的寡核苷酸探针设计 ,提出了 2种等长变覆盖的方法 :①基于Tm距离的探针优化方法 ,从冗余探针集中逐步删除具有最大Tm 距离的探针 ;②应用遗传算法 ,将候选探针集编码为染色体 ,通过选择、交叉和变异等遗传操作得到...
关键词：探针设计 再测序DNA微阵列 等长变覆盖法 遗传算法 
寡核苷酸合成的一种优化方法
《生物技术》2002年第4期26-28,共3页张玉骥 朱纪军 孙啸 陆祖宏 
国家自然科学基金资助项目 ( 69971 0 1 0 )
为提高寡核苷酸的合成效率 ,结合本实验室研制出的探针并行合成装置 ,提出了一种寡核苷酸合成的优化方法 ,可有效减少合成的循环次数 ,同时使合成成本降低、合成时间缩短 。
关键词：寡核苷酸 合成 基因芯片 芯片优化 并行合成 
高密度基因芯片探针布局方法
《生物技术》2001年第5期28-30,共3页孙啸 顾万君 何农跃 陆祖宏 
国家自然科学基金资助项目 (6 99710 10 )
为了提高基因芯片制备质量和检测的准确性 ,提出两种基因芯片布局方法 ,一是分子印章凸点优化布局方法 ,另一种是基于探针杂交解链温度的梯度场布局方法。利用上述两种方法对所设计的高密度基因芯片进行控针布局实验 ,结果表明 :第一种...
关键词：基因芯片 点阵密度 探针布局方法 
生物信息学中基因数据可视化被引量：11
《计算机与应用化学》2001年第5期403-410,共8页杨锡南 孙啸 
国家自然科学基金资助项目 ( 6 99710 10 )
科学可视化技术是进行生物数据挖掘的重要手段。本文综合介绍了主要的基因数据可视化技术 :各种基因调控网、层次树显示、信息壁技术。
关键词：科学可视化 生物信息学 基因数据 数据挖掘 生物数据 可视化技术 基因调控网 层次树显示 信息壁技术 数据库 语义镜 
一种高密度基因芯片设计的新方法被引量：5
《电子学报》2001年第3期293-296,共4页孙啸 王晔 赵雨杰 马建明 陆祖宏 
国家自然科学基金!(No .69971 0 1 0 )
基因芯片是一种由高密度寡核苷酸探针所形成的微阵列 .本文首先提出一种基因芯片上寡核苷酸探针设计的新思想 ,即变长变覆盖探针优化设计方法 ,通过该方法设计的寡核苷酸探针的杂交解链温度最大程度地保持一致 ,可有效地减少碱基杂交错...
关键词：基因芯片 探针设计 动态规划 DNA芯片 
生物信息学在基因芯片中的应用被引量：20
《生物物理学报》2001年第1期27-34,共8页孙啸 王晔 何农跃 赵雨杰 陆祖宏 
国家自然科学基金!资助项目 (69971010)
生物信息学和基因芯片是生命科学研究领域中的两种新方法和新技术 ,生物信息学与基因芯片密切相关 ,生物信息学促进了基因芯片的研究与应用 ,而基因芯片则丰富了生物信息学的研究内容。本论文探讨生物信息学在基因芯片中的应用 ,将生物...
关键词：生物信息学 基因芯片 DNA阵列 探针设计 
基因芯片设计及数据分析软件系统被引量：12
《东南大学学报（自然科学版）》2000年第5期1-6,共6页孙啸 王晔 张晓莉 谢建明 陆祖宏 
国家自然科学基金资助项目! (69971 0 1 0 )
基因芯片是提取生物分子信息的一种新技术 ,该技术是分子生物学与电子信息科学交叉的产物 .基因芯片在基因型分析、基因表达监控和疾病检测方面有着重要的应用 .本论文分析基因芯片中的信息处理问题 ,介绍一个高密度基因芯片设计及数据...
关键词：基因芯片 DNA阵列 探针设计 优化 数据分析软件系统 
一种高密度基因芯片的优化方法被引量：3
《生物技术》2000年第4期42-46,共5页孙啸 何农跃 赵雨杰 陆祖宏 
国家自然科学基金资助课题!(6 99710 10 )
Gene chip is the fusion of molecular biology,microelectronics and micromechanics.Mask board is the key to high-density gene chip fabrication.By using masks ,DNA probes can be synthesized in situ with high density and ...
关键词：基因芯片 优化技术 高密度基因芯片 
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