顾万君

作品数:11被引量:78H指数:5
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供职机构:东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室更多>>
发文主题:密码子密码子使用聚类分析密码子偏性蛋白编码基因更多>>
发文领域:生物学医药卫生电子电信水利工程更多>>
发文期刊:《生物物理学报》《Journal of Southeast University(English Edition)》《东南大学学报(自然科学版)》《生物信息学》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
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DNA存储中的编码技术被引量:4
《生物信息学》2020年第2期76-85,共10页毕昆 顾万君 陆祖宏 
脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic Acid,DNA)是一种天然的信息存储介质,具有存储密度高、存储时间长、损耗率低等特点。在传统存储方式不能满足信息增长的需求时,DNA数据存储技术逐渐成为研究热点。DNA编码是用尽可能少的碱基序列无错的...
关键词:DNA存储 压缩编码 纠错算法 转换模型 
影像组学辅助磨玻璃结节诊断的研究进展被引量:6
《中国胸心血管外科临床杂志》2019年第8期805-809,共5页李洪 韩路 李响 虞梁 袁梅 顾万君 陈亮 王俊 
江苏省社会发展临床前沿技术基金项目(BE2018746);江苏省临床医学研究中心支撑体系建设“临床研究与转化骨干培育计划”(2017CX010)
磨玻璃结节的良恶性判定对肺癌的早期发现、早期诊断、早期治疗具有重要意义。影像组学可以通过无创技术,利用结节的特征性表现实现对磨玻璃结节良恶性的早期诊断。本文就CT影像组学在辅助磨玻璃结节的诊断方面的最新研究进展进行综述。
关键词:影像组学 磨玻璃结节 CT 
乳腺癌影像基因组学研究进展被引量:8
《中国医学影像学杂志》2018年第12期952-956,共5页明文龙 袁少勋 谢建明 刘宏德 顾万君 孙啸 
近年来,我国乳腺癌发病率不断升高,并呈年轻化趋势[1],对乳腺癌的早期预防、精确诊疗和预后分析能力迫切需要提高。分子生物学与免疫学的快速发展为乳腺癌早期诊断、分型、预防警示及预后判断奠定了基础。最初,乳腺癌按照基因表达谱差...
关键词:乳腺肿瘤 磁共振成像 乳房X线摄影术 超声检查 乳房 基因组学 综述 
基于序列特征的环状RNA识别被引量:2
《生物信息学》2018年第2期113-118,共6页周晶 谢雪英 顾万君 
国家自然科学基金(61372164;61471112;61571109);江苏省重点研发计划(BE2016002-3);中央高校基本科研业务费专项资金(2242017K3DN04)
环状RNA是新发现的一类具有重要生物学功能的RNA。现有的环状RNA识别工具依赖高通量测序数据,因数据本身和识别方式的弊端而普遍存在准确性不足、不同方法间重复性低以及假阳性率/假阴性率高等缺点。为了解决该问题,我们搭建模型来实现...
关键词:环状RNA 序列特征 机器学习 随机森林 支持向量机 
Site discrepancy of synonymous codon usage in SARS coronavirus and other viruses in Coronaviridae
《Journal of Southeast University(English Edition)》2005年第2期203-206,共4页周童 顾万君 马建民 孙啸 陆祖宏 
TheNationalNaturalScienceFoundationofChina(No. 60121101)
The synonymous codon usage in the translational initiation and termination regions of genes of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus and five other viruses in Coronaviridae was systematically analyzed.T...
关键词:codon usage severe acute respiratory syndrome (SARS) CORONAVIRUS gene expression site discrepancy 
不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析被引量:1
《东南大学学报(自然科学版)》2004年第1期72-77,共6页顾万君 周童 马建民 孙啸 陆祖宏 
国家自然科学基金资助项目 ( 60 12 110 1)
在传统的Chou Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息 ,计算了 2 0 0个蛋白 ( 4 9种全α结构蛋白 ,69种全β结构蛋白 ,38种α + β结构蛋白 ,44种α/β结构蛋白 )中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构 (...
关键词:同义密码子使用 氨基酸二级结构偏向性 蛋白质二级结构预测 蛋白质折叠类型 蛋白设计 
一种基于密码子使用偏性的检测型基因芯片设计方法被引量:3
《东南大学学报(自然科学版)》2002年第4期581-585,共5页马建民 顾万君 周童 孙啸 陆祖宏 
国家重大基础研究资助项目 (G19980 5 12 0 0 );国家自然科学基金资助项目 (695 2 5 10 2 )
首先预测特定蛋白密码子使用概率表 ,以确定序列中各氨基酸的编码密码子 ,这样可以将芯片表面探针的数量减少为原来的 4.47% .然后进一步考虑密码子在编码时的C G选择性分离原则、G T配对原则 ,以进一步将芯片表面探针的数量减少至 4.2 ...
关键词:检测型基因芯片 设计方法 特定蛋白 密码子使用偏性 C-G选择性分离原则 G-T配对原则 探针优化 遗传密码 
不同折叠类型蛋白编码基因的密码子使用被引量:9
《东南大学学报(自然科学版)》2002年第3期362-366,共5页顾万君 马建民 周童 孙啸 陆祖宏 
国家重大基础研究项目 (G19980 5 12 0 0 );国家自然科学基金资助项目 ( 6 95 2 5 10 2 )
对 1 95个编码不同折叠类型蛋白 (5 0种全α结构蛋白 ,6 6种全 β结构蛋白 ,3 7种α +β结构蛋白 ,42种α/β结构蛋白 )基因的密码子使用偏性的方差分析研究表明 ,不同折叠类型蛋白的密码子使用偏性有着显著的区别 .特定折叠类型的蛋白...
关键词:编码基因 密码子 蛋白质 折叠类型 二级结构 预测 方差分析 使用偏性 氨基酸 
不同结构的蛋白编码基因的密码子偏性研究被引量:40
《生物物理学报》2002年第1期81-86,共6页顾万君 马建民 周童 孙啸 陆祖宏 
国家重大基础研究项目(G1998051200) ;国家自然科学基金资助项目(69525102)
利用聚类分析方法 ,对两类具有不同三级结构的75个蛋白的编码基因的密码子使用偏性进行了分析。75个基因样本序列按照对应蛋白的三级结构被很清晰的分成了两类 ,从而发现密码子的使用与蛋白质的三级结构有很大的相关性。
关键词:蛋白编码基因 偏性 密码子 蛋白质三级结构 聚类分析 MRNA 
高密度基因芯片探针布局方法
《生物技术》2001年第5期28-30,共3页孙啸 顾万君 何农跃 陆祖宏 
国家自然科学基金资助项目 (6 99710 10 )
为了提高基因芯片制备质量和检测的准确性 ,提出两种基因芯片布局方法 ,一是分子印章凸点优化布局方法 ,另一种是基于探针杂交解链温度的梯度场布局方法。利用上述两种方法对所设计的高密度基因芯片进行控针布局实验 ,结果表明 :第一种...
关键词:基因芯片 点阵密度 探针布局方法 
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