折叠类型

作品数:15被引量:20H指数:3
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常见致病菌糖基转移酶的结构与功能被引量:1
《中国生物化学与分子生物学报》2022年第3期290-297,共8页牛静丽 张楠楠 葛宏华 
国家自然科学基金项目(No.31970103);安徽省重点研究与开发计划面上攻关项目(No.202004a06020035);安徽省自然科学基金(No.2108085MC76)资助。
糖基转移酶(glycosyltransferases,GTs)将糖基从活化的供体转移到糖、脂、蛋白质和核酸等受体,其参与的蛋白质糖基化是最重要的翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs)之一。近年来越来越多的研究证明,糖基转移酶与致病菌...
关键词:致病菌 糖基转移酶 折叠类型 致病机制 
α类蛋白质折叠类型自动化分类研究
《生命科学研究》2016年第5期381-388,共8页宗立平 李晓琴 
国家自然科学基金资助项目(31171267)
蛋白质折叠类型识别是蛋白质结构研究的重要内容,折叠类型分类是折叠识别的基础。通过对ASTRAL-1.65数据库α类蛋白质所属折叠类型进行系统研究,建立蛋白质折叠类型模板数据库,提取反映折叠类型拓扑结构的模板特征参数,根据模板特征参数...
关键词:α类蛋白质 折叠类型 打分函数 Fdscore 自动化分类 
Bromodomain-like折叠类型模板的设计被引量:1
《北京工业大学学报》2016年第10期1572-1580,共9页李晓琴 张春城 
国家自然科学基金资助项目(21173014);北京市自然科学基金资助项目(4112010)
针对折叠类型分类中所选天然模板普适性不足的问题,提出了Bromodomain-like折叠类型模板的设计方法.选SCOPe Astral 2.03序列相似度小于40%并且分辨率高于0.25 nm的52个可用Bromodomain-like折叠样本,基于多结构比对结果及数据分析,建...
关键词:折叠类型分类 模板设计 结构比对 系统聚类 
基于设计模板的BRD-like折叠类型综合分类方法
《生物信息学》2016年第2期100-107,共8页张春城 李晓琴 
国家自然科学基金资助项目(No.21173014);北京市自然科学基金资助项目(No.4112010)
蛋白质折叠规律研究是生命科学重大前沿课题,折叠类型分类是蛋白质折叠研究的基础。构建BRD-like折叠类型模板数据库,建立了基于多模板的综合分类方法,并用于该折叠类型的分类。对实验集的12 117个样本进行检验,结果的敏感性、特异性分...
关键词:蛋白质分类 折叠类型分类 模板数据库 分类方法 
α/β类蛋白质折叠类型的分类方法研究被引量:5
《生物信息学》2014年第2期123-132,共10页马帅 王勤 李晓琴 
北京自然科技基金(4112010)资助
蛋白质折叠规律的研究是生命科学重大前沿课题之一,折叠分类是蛋白质折叠研究的基础。本文基于LIFCA数据库,选取样本量大于2的55种α/β类蛋白质折叠类型为研究对象。结合蛋白质折叠类型的定义及其保守拓扑结构特征,确定了55种蛋白质折...
关键词:α β类蛋白质 折叠类型分类 打分函数 LIFCA数据库 
基于特征片段信息的PH domain-like barrel 蛋白质折叠类型分类方法被引量:3
《生物信息学》2012年第2期125-129,共5页孔令强 李晓琴 
北京市自然科学基金(4112010;KM201110005027)资助项目
蛋白质折叠类型分类是蛋白质分类研究的重要内容。以SCOP数据库中的 PH domain-like barrel 折叠类型为研究对象,选择序列相似度小于25%的61个样本为检验集,通过结构特征分析,确定了该折叠类型的模板及其对应的特征参数,利用模板与待测...
关键词:折叠类型 标准模板 打分函数 折叠类型分类 
基于功能域组分的蛋白质折叠类型识别被引量:3
《生物化学与生物物理进展》2011年第2期166-172,共7页闫金丽 陈治伟 徐海松 李晓琴 
国家自然科学基金(30570427);北京市自然科学基金(4092008)资助项目~~
蛋白质空间结构研究是分子生物学、细胞生物学、生物化学以及药物设计等领域的重要课题.折叠类型反映了蛋白质核心结构的拓扑模式,对折叠类型的识别是蛋白质序列与结构关系研究的重要内容.选取LIFCA数据库中样本量较大的53种折叠类型,...
关键词:折叠类型 折叠识别 功能域 LIFCA数据库 
聚焦矩形中的折叠问题
《初中生辅导》2010年第14期26-30,共5页肖国刚 
在图形变换中,折叠类型的题目在中考中频频出现,此类题对识别和理解几何图形的能力、空间思维能力和综合解决问题的能力都提出了比以往更高的要求。
关键词:折叠类型 解决问题 勾股定理 矩形 空间思维能力 图形变换 几何图形 计算问题 数学思想方法 直角三角形 
原始蛋白结构与功能研究进展
《山东理工大学学报(自然科学版)》2008年第4期100-103,共4页杨芙蓉 姜莹英 张红雨 
国家自然科学基金资助项目(30570383)
近年来在生命起源研究方面,蛋白质起源研究来有很大进展,因为各种"组学(-omics)"的快速发展提供了关于蛋白质结构与功能的大量信息,据此可以初步推断原始蛋白的结构与功能特征.文章就该领域的最新研究进展进行了综述.
关键词:生命起源 蛋白质 折叠类型 小分子配体 
分子生物学
《中国生物学文摘》2008年第7期19-21,共3页
蛋白质折叠类型识别方法研究;A型激酶锚定蛋白及其信号复合物结构与功能;KCNE2的两种突变体157T和V65M对Kv4.3通道功能的调节;过氧亚硝酸阴离子通过乌苷酸环化酶途径抑制钠电流影响海马神经元兴奋性;膜脂物理属性及化学成分对BKCa钾离...
关键词:分子生物学 钾离子通道 海马神经元 过氧亚硝酸 识别方法 折叠类型 调节作用 化学成分 
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