密码子使用偏性

作品数：37被引量：341H指数：10
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相关作者：杜淑辉顾万君马建民周童魏丹更多>>
相关机构：曲靖师范学院东南大学山西农业大学中国科学院更多>>
相关期刊：《长江大学学报（自然科学版）》《东北林业大学学报》《动物医学进展》《西部林业科学》更多>>
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西南牡蒿叶绿体基因组特征及系统发育分析被引量：1
《广西植物》2024年第9期1732-1745,共14页李志芳 陈丽玲 罗淑洁 刘天猛 
云南省基础研究专项青年项目(202001AU070017);大理大学博士科研启动费项目(KY2096107540)。
为探究西南牡蒿(Artemisia parviflora)的叶绿体基因组结构特征及其系统位置,该研究利用高通量测序技术对其进行测序,并借助生物信息学工具进行分析。结果表明:(1)西南牡蒿叶绿体基因组长151 047 bp,呈现为由4部分组成的环状双链结构,G...
关键词：西南牡蒿 叶绿体基因组 密码子使用偏性 分子标记 系统发育分析 
2种楠属植物叶绿体基因组特征及系统发育
《东北林业大学学报》2024年第6期58-63,84,共7页戴前莉 朱恒星 魏卓 卢敏 黄飞逸 陈本文 
重庆市科技兴林重点项目(ZD2022-2)。
应用Illumina Novaseq 6000高通量测序平台进行测序,组装了完整的崖楠(Phoebe yaiensis)和红毛山楠(Phoebe hungmoensis)叶绿体基因组,并对其基因组特征、基因构成、序列重复、边界收缩、密码子偏好性及系统发育进行分析。结果表明:崖...
关键词：崖楠 红毛山楠 叶绿体基因组 SSR 密码子使用偏性 系统发育 
珊瑚菜叶绿体基因组密码子使用偏性分析被引量：5
《植物资源与环境学报》2023年第6期1-10,共10页孙月琪 李密密 周义峰 
国家自然科学基金项目(31600169)。
为探究珊瑚菜(Glehnia littoralis F.Schmidt ex Miq.)叶绿体基因组密码子使用偏性及其影响因子,本研究基于珊瑚菜叶绿体基因组测序数据筛选到51个蛋白质编码基因,并对其密码子使用模式进行分析。结果显示:珊瑚菜叶绿体基因组密码子总G...
关键词：珊瑚菜 叶绿体基因组 密码子使用偏性 最优密码子 
芝麻叶绿体基因组的密码子使用偏性及其影响因素被引量：6
《分子植物育种》2023年第14期4535-4544,共10页李路丽 张萍 曾强 宗营杰 陆瑞菊 刘成洪 王俊生 陈志伟 
上海市农科院生物育种与生态安全创新研究项目[农科应基2021(09)];上海市农业遗传育种重点实验室开放课题(2021-1)共同资助。
通过分析芝麻叶绿体基因组密码子的使用偏性,阐明其密码子的使用偏性特征,并探讨其影响因素。以芝麻叶绿体基因组的50个蛋白编码序列为研究对象,利用CodonW等软件对其密码子使用模式及影响因素进行了分析。结果发现,芝麻叶绿体基因的GC...
关键词：芝麻 叶绿体基因组 密码子使用偏性 最优密码子 
艾纳香叶绿体基因组密码子使用偏性分析被引量：2
《西部林业科学》2023年第3期55-62,77,共9页赵月梅 徐其碧 杨贵清 尹鑫 徐林 
国家自然科学基金项目(31900273);贵州师范学院博士科研启动项目(2022BS015);大学生创新创业训练计划项目(S202114223051)。
为了明确艾纳香叶绿体基因组密码子的使用偏性,以53条蛋白质编码序列为研究对象,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP等对其密码子进行中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析。结果显示:(1)艾纳香叶绿体基因组密码子不同位置GC碱基含量为GC 1(4...
关键词：艾纳香 叶绿体基因组 最优密码子 密码子偏性 
翅果油树叶绿体基因组密码子偏好性分析被引量：2
《山西农业科学》2023年第3期233-240,共8页郭媛婷 张敏 杨玉洁 胡晓艳 杜淑辉 
科技部科技基础资源调查专项子课题(2019FY100802_04);山西省基础研究计划(自由探索类)(20210302124175);山西农业大学科技创新基金项目(2016YJ14)。
为明确翅果油树叶绿体基因组密码子使用偏好性,从Gen Bank数据库下载翅果油树叶绿体基因组序列,筛选出合适长度的序列并进行密码子使用偏好及其影响因素分析;使用Codon W软件分析序列得出A_(3)、T_(3)、C_(3)、G_(3)、GC_(3)、有效密码...
关键词：翅果油树 叶绿体基因组 密码子使用偏性 最优密码子 
石斛属叶绿体基因组密码子使用偏性及系统发育分析被引量：9
《分子植物育种》2022年第23期7759-7769,共11页王晓双 杨芳 罗茜 刘映良 朱斌 
国家自然科学基金委员会-贵州省人民政府喀斯特科学研究中心项目(U1812401);国家自然科学基金项目(31760124)共同资助。
石斛(Dendrobium)是集药用与观赏价值于一体的珍贵中药材,为促进药用植物叶绿体基因工程的发展,本研究利用CodonW、SPSSAU、CUSP以及MEGA 7.0等软件对石斛属叶绿体基因组密码子使用模式以及系统发育关系进行了分析。分析结果显示:31种...
关键词：石斛属 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子 系统发育 
天料木属植物叶绿体基因组密码子使用偏性分析
《热带林业》2022年第3期4-10,共7页尹为治 李佳灵 黄良鸿 方正 
为揭示天料木属4种植物叶绿体基因组密码子偏性特征及偏性特征的影响因素,对4种植物叶绿体基因组进行分析,结果显示:天料木属4种植物叶绿体基因组GC含量均不足50%;GC12与GC3双尾检验均呈显著相关(p<0.05);超过60%的基因ENc实际值围绕在...
关键词：天料木属植物 叶绿体基因组 密码子偏好性 
三种块菌(松露)全基因组密码子使用偏性及其影响因素被引量：2
《浙江农业学报》2022年第7期1439-1448,共10页韩利红 田雪莲 刘潮 付小林 王远献 
国家自然科学基金(32100010,31860005);云南省地方本科高校基础研究联合专项(202001BA070001-002)。
块菌又称松露,为珍稀野生药食兼用的大型真菌,具有极高的营养保健价值。密码子使用偏性分析可为块菌的遗传进化与资源开发提供理论依据。基于黑孢块菌(Tuber melanosporum)、白块菌(T.magnatum)和波氏块菌(T.borchii)的基因组数据,利用C...
关键词：块菌 基因组 密码子使用偏性 最优密码子 选择压力 
滇黄精叶绿体全基因组序列及其密码子使用偏性分析
《热带亚热带植物学报》2022年第3期336-348,共13页石乃星 谢平选 李立 文国松 
supported by the National Natural Sciences Foundation of China (Grant No. 81360611)
为探究滇黄精(Polygonatum kingianum)叶绿体全基因组特征和密码子使用偏性,利用第二代测序技术对滇黄精嫩叶进行测序,再经组装与注释后得到其叶绿体基因组全序列,通过MISA、EMBOSS和CodonW等软件对滇黄精叶绿体全基因组的SSR位点、系...
关键词：滇黄精 叶绿体基因组 密码子使用偏性 最优密码子 
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