马建民

作品数：7被引量：60H指数：3
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供职机构：东南大学更多>>
发文主题：密码子聚类分析密码子偏性蛋白编码基因折叠类型更多>>
发文领域：生物学电子电信建筑科学社会学更多>>
发文期刊：《Journal of Southeast University(English Edition)》《东南大学学报（自然科学版）》《建筑技术》《生物物理学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
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Site discrepancy of synonymous codon usage in SARS coronavirus and other viruses in Coronaviridae
《Journal of Southeast University(English Edition)》2005年第2期203-206,共4页周童 顾万君 马建民 孙啸 陆祖宏 
TheNationalNaturalScienceFoundationofChina(No. 60121101)
The synonymous codon usage in the translational initiation and termination regions of genes of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus and five other viruses in Coronaviridae was systematically analyzed.T...
关键词：codon usage severe acute respiratory syndrome (SARS) CORONAVIRUS gene expression site discrepancy 
不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析被引量：1
《东南大学学报（自然科学版）》2004年第1期72-77,共6页顾万君 周童 马建民 孙啸 陆祖宏 
国家自然科学基金资助项目 ( 60 12 110 1)
在传统的Chou Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息 ,计算了 2 0 0个蛋白 ( 4 9种全α结构蛋白 ,69种全β结构蛋白 ,38种α + β结构蛋白 ,44种α/β结构蛋白 )中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构 (...
关键词：同义密码子使用 氨基酸二级结构偏向性 蛋白质二级结构预测 蛋白质折叠类型 蛋白设计 
一种基于密码子使用偏性的检测型基因芯片设计方法被引量：3
《东南大学学报（自然科学版）》2002年第4期581-585,共5页马建民 顾万君 周童 孙啸 陆祖宏 
国家重大基础研究资助项目 (G19980 5 12 0 0 );国家自然科学基金资助项目 (695 2 5 10 2 )
首先预测特定蛋白密码子使用概率表 ,以确定序列中各氨基酸的编码密码子 ,这样可以将芯片表面探针的数量减少为原来的 4.47% .然后进一步考虑密码子在编码时的C G选择性分离原则、G T配对原则 ,以进一步将芯片表面探针的数量减少至 4.2 ...
关键词：检测型基因芯片 设计方法 特定蛋白 密码子使用偏性 C-G选择性分离原则 G-T配对原则 探针优化 遗传密码 
不同折叠类型蛋白编码基因的密码子使用被引量：9
《东南大学学报（自然科学版）》2002年第3期362-366,共5页顾万君 马建民 周童 孙啸 陆祖宏 
国家重大基础研究项目 (G19980 5 12 0 0 );国家自然科学基金资助项目 ( 6 95 2 5 10 2 )
对 1 95个编码不同折叠类型蛋白 (5 0种全α结构蛋白 ,6 6种全 β结构蛋白 ,3 7种α +β结构蛋白 ,42种α/β结构蛋白 )基因的密码子使用偏性的方差分析研究表明 ,不同折叠类型蛋白的密码子使用偏性有着显著的区别 .特定折叠类型的蛋白...
关键词：编码基因 密码子 蛋白质 折叠类型 二级结构 预测 方差分析 使用偏性 氨基酸 
不同结构的蛋白编码基因的密码子偏性研究被引量：40
《生物物理学报》2002年第1期81-86,共6页顾万君 马建民 周童 孙啸 陆祖宏 
国家重大基础研究项目(G1998051200) ;国家自然科学基金资助项目(69525102)
利用聚类分析方法 ,对两类具有不同三级结构的75个蛋白的编码基因的密码子使用偏性进行了分析。75个基因样本序列按照对应蛋白的三级结构被很清晰的分成了两类 ,从而发现密码子的使用与蛋白质的三级结构有很大的相关性。
关键词：蛋白编码基因 偏性 密码子 蛋白质三级结构 聚类分析 MRNA 
哺乳动物MHC密码子使用概率的聚类分析被引量：18
《东南大学学报（自然科学版）》2001年第2期1-5,共5页周童 马建民 顾万君 孙啸 陆祖宏 
国家重大基础研究项目!(G19980 5 12 0 0 );国家自然科学基金资助项目!( 695 2 5 10 2 ) .
利用系统聚类分析方法对随机选取的 3种哺乳动物的 60个主要组织相容性复合体(MHCⅠ类和Ⅱ类 )基因的mRNA序列进行了同义密码子使用概率偏性研究 .结果发现 ,不同物种的MHC基因群中类型相同的基因具有相近的同义密码子使用偏性 ,而对于...
关键词：同义密码子 密码子偏性 MHC 聚类分析 生物信息学 哺乳动物 使用概率 
早拆模板竖向施工荷载传递的研究被引量：2
《建筑技术》1995年第1期47-49,共3页郭正兴 章建军 马建民 王银芝 
早拆模板竖向施工荷载传递的研究郭正兴，章建军，马建民，王银芝（东南大学，南京２１００９６）（南通市建工局）（溧阳市茶亭建安公司）高层建筑现浇楼板应用早拆模板体系的基本原理是：楼板混凝土浇筑后３～４ｄ，达到设计强度５０...
关键词：高层建筑 早拆模板 载荷 竖向施工 传递 
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