《基因组学与应用生物学》

作品数：7415被引量：27109H指数：44
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《基因组学与应用生物学》
主办单位：广西大学
最新期次：2025年2期更多>>
发文主题：基因组学与应用生物学基因组学生物信息学分析基因克隆基因更多>>
发文领域：农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
发文作者：陈保善杜晓东兰干球张伟伟赵德刚更多>>
发文机构：广西大学中国热带农业科学院海南大学上海海洋大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
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ISDT:一种基于高通量测序数据的外源序列插入位点检测工具
《基因组学与应用生物学》2024年第9期1510-1520,共11页张镇 杨芊茹 杜含笑 李雨桐 陆晨琪 姜宁 
国家重点研发计划(2021YFC2501800,2022YFC2009802)资助。
精准识别外源序列插入位点对于转基因研究、基因编辑研究及疾病机制探索等领域至关重要。随着高通量测序技术的快速发展和广泛应用,越来越多的研究者将高通量测序技术应用到插入位点分析研究中来,深入探索外源序列插入事件。基于这样的...
关键词：高通量测序 外源序列 插入位点 精准识别 检测工具 
南洋鼠线粒体基因组结构特征及其属级分类关系的分子证据
《基因组学与应用生物学》2024年第7期1225-1235,共11页谯娅琴 白一然 涂飞云 
海南省自然科学基金项目(323MS037、321RC544)资助。
南洋鼠(Chiromyscus langbianis)是亚洲特有的一种树栖鼠类,其属级分类一直存在争议,不同的分类系统将其归入白腹鼠属(Niviventer)或费氏树鼠属(Chiromyscus),影响了对其生物学特性的认识。本研究旨在通过测定和分析南洋鼠的线粒体基因...
关键词：南洋鼠 线粒体基因组 遗传距离 系统发育 
黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组全序列分析及系统进化被引量：1
《基因组学与应用生物学》2024年第6期1066-1077,共12页陈云霞 黄娅琳 侯森林 周用武 
江苏高校“青蓝工程”(2021);“十四五”江苏省重点学科“公安技术”(2022);野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室项目共同资助。
黄颈亚马逊鹦鹉(Amazona auropalliata)属于《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录Ⅱ监管物种。为了更好地了解黄颈亚马逊鹦鹉的起源、进化以及在鹦形目中的系统发育地位,本研究使用一代直接测序法获得了黄颈亚马逊鹦鹉的线粒体基因组序...
关键词：黄颈亚马逊鹦鹉 线粒体基因组 结构特征 系统进化 
基于杜洛克猪全基因组重测序的InDel分析及重要经济性状基因定位
《基因组学与应用生物学》2024年第6期1010-1027,共18页何健 郑伟杰 孙艳梅 张瑞琪 王素青 马亮亮 袁仁强 赵云翔 郭金彪 
广东省重点领域研发计划项目(2022B0202090002);国家现代农业产业技术体系(CASR-PIG-35);国家现代农业产业技术体系广西创新团队建设专项资金(nycytxgxcxtd-2023-15-03)共同资助。
本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因。选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用F_(st)&P_(i)的联合分析,保留...
关键词：选择信号分析方法 杜洛克猪 全基因组重测序 重要经济性状 候选基因 
不同生长阶段伊拉兔骨骼肌转录组数据的挖掘分析被引量：1
《基因组学与应用生物学》2024年第6期1028-1038,共11页吴倩雯 王露 王文佳 姬正伟 路宏朝 程佳 
秦巴生物资源与生态环境省部共建国家重点实验室(培育)“市校共建”科研专项(SXC-2101);国家自然科学基金项目(32272884)共同资助。
为了进一步挖掘伊拉兔骨骼肌转录组的数据,本研究运用生物信息学对3个生长阶段的伊拉兔腓肠肌转录组数据进行深入的综合分析。通过对可变剪切、新转录本及其转录因子的表达模式和分子功能进行可视化呈现,结果发现,在伊拉兔骨骼肌的生长...
关键词：可变剪切 转录本 转录因子 转录组 伊拉兔 
青藏高原不同海拔藏药独一味转录组分析
《基因组学与应用生物学》2024年第2期338-352,共15页李孝平 徐浩 余静雅 韩赟 韩霜 张发起 
第二次青藏高原综合科学考察研究项目(20190ZKK05020102);三江源国家公园联合研究专项(LHZX-2021-01)共同资助。
为了研究独一味(Phlomoides rotata)在不同海拔生境下基因表达差异及响应机制,本研究基于NR、GO和KEGG等数据库进行差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的注释,以及功能富集分析,获得独一味的DEGs,以及关联的代谢通路,...
关键词：转录组 独一味 低温胁迫 P5βR基因亚家族 环烯醚萜合成酶 
RNA修饰在生殖发育中的研究进展
《基因组学与应用生物学》2023年第11期1146-1158,共13页文君 陈慧芳 乔延召 朱翠 白银山 
广东省重点领域研发计划(2021B0707010007);广东省基础与应用基础研究基金项目(2022A1515011185)共同资助。
RNA修饰是表观遗传学调控的重要组成部分,在生命活动中发挥着极其重要的调控作用。随着RNA修饰检测技术的发展,越来越多的RNA修饰类型被鉴定出来,涉及甲基化修饰、羟甲基化修饰、乙酰化修饰和磷酸化修饰等。这些修饰广泛存在于编码和非...
关键词：RNA修饰 表观遗传学修饰 配子形成 胚胎发育 
中国沙棘SSR-PCR反应体系的优化及引物开发被引量：1
《基因组学与应用生物学》2023年第10期1038-1049,共12页刘青青 马玉花 李雄杰 马福林 高佩 马亚琼 杨开宇 
国家自然科学基金项目(31660071);青海省科技厅项目(2017-ZJ-734)。
本研究旨在建立适宜中国沙棘(Hippophae rhamnoides subsp.sinensis)SSR-PCR的反应体系,以期为中国沙棘遗传多样性分析、种质资源鉴定等相关研究奠定基础。本研究以来自青海不同地区的中国沙棘野生种的150个植株为试验材料,采用单因素...
关键词：中国沙棘 SSR-PCR 单因素试验 正交试验 
蜡梅比较基因组学及木兰类植物系统进化分析
《基因组学与应用生物学》2023年第8期791-807,共17页沈植国 
河南省农业科学院科技创新团队项目(2023TD35);河南省重点研发专项(221111110700);河南省科技兴林项目(豫财环资[2022]28号)共同资助。
基于蜡梅(Chimonanthus praecox)及相关植物物种的基因组数据,进行基因家族聚类,估算物种分化时间,并开展有关物种的共线性分析,计算不同类别代表性物种内旁系同源及物种间的直系同源同义替换率(synonymous substitution rate,Ks),同时...
关键词：蜡梅 比较基因组 共线性分析 木兰类植物 系统发育 
花卉植物基因组学研究进展与展望
《基因组学与应用生物学》2023年第3期223-232,共10页高敏 陈玲玲 
国家自然科学基金项目(32270712)资助。
花卉是园艺植物的重要组成部分,具有丰富的种质资源。随着高通量测序技术的发展,基因组学研究已成为花卉植物的研究热点之一。高质量的基因组序列为研究花卉植物基因组的结构与功能、起源与进化、基因定位和遗传改良等提供了重要的信息...
关键词：花卉植物 高通量测序 基因组组装 
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