山东理工大学生命科学学院山东省生物信息工程技术研究中心

作品数:8被引量:42H指数:3
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发文作者:任伟吕巍更多>>
发文领域:理学医药卫生化学工程生物学更多>>
发文主题:描述符化学信息学聚类分析定量构效关系研究定量构效关系更多>>
发文期刊:《生命的化学》《计算机与应用化学》《生命科学仪器》更多>>
所获基金:博士科研启动基金国家自然科学基金更多>>
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化合物成药性的预测方法被引量:3
《计算机与应用化学》2012年第8期999-1003,共5页李晓 孔德信 
国家自然科学基金资助项目(21075046);华中农业大学研究生教育创新工程项目(2010KC07)
为了降低药物开发后期的失败率,指导侯筛化合物库的设计,药物化学家提出了许多基于化学信息学或计算化学的"成药性"理论指标,这些预测方法日益成熟,取得了广泛应用。本文综述了现有的化合物成药性预测方法的研究进展,包括类药性、类先...
关键词:成药性 类药性 类先导性 天然产物类似物 生物相关性 
定量构效关系研究中分子描述符的相关性被引量:21
《计算机与应用化学》2009年第11期1455-1458,共4页任伟 孔德信 
山东理工大学创新团队建设项目的资助
分子描述符的计算是定量构效关系(QSAR)研究的基础,也是化学计量学研究的重要内容,在药物化学、环境科学等领域应用广泛。目前可计算的各种分子描述符已超过4 000种,如何选择合适的分子描述符,成为QSAR研究中首先要做的事。本文首先综...
关键词:分子描述符 定量构效关系 相关分析 聚类分析 
基于配体和受体的药物设计方法的对应性被引量:2
《生命科学仪器》2009年第3期19-22,共4页任伟 孔德信 
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019)
基于配体和基于受体的药物设计,通常在方法设计上存在共同的理论基础。本文通过对基于格点能量计算、特征、类似物、知识以及分子对接等方面的方法进行总结,探讨了基于配体和受体在药物设计中的对应关系,并对今后药物设计的发展提出建议。
关键词:基于受体的药物设计 基于配体的药物设计 对应性 
4种常用化学作图软件功能之比较被引量:1
《计算机与应用化学》2008年第11期1448-1450,共3页吕巍 孔德信 
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助。
随着计算机技术的发展和普及,化学化工工作者应用化学专业软件也越来越普遍。ChemDraw、ChemSkech、ChemWin、I- SIS/Draw是目前最常用的4种化学作图软件。本文从化学作图、辅助化学专业分析、性质预测以及软件运行环境等方面,详细比较...
关键词:化学作图软件 辅助分析 计算机辅助化学教学 
分子相似性与MOLPRINT2D的本地化被引量:6
《计算机与应用化学》2008年第4期505-508,共4页吴萍 孔德信 
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助.
分子相似性是分子多样性、分子聚类分析的基础,在药物、材料设计等领域应用广泛。分子相似性有相似度和分子间距两种方式表示,它的计算以分子描述符的计算为前提,依据所采用的描述符是定量还是定性表示,其算法有所不同。本文首先简述了...
关键词:分子相似性 分子设计 描述符 MOLPRINT 2D 
计算机存储化学结构的格式及其相互转化被引量:4
《计算机与应用化学》2007年第9期1260-1264,共5页孔德信 
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助.
在计算机中存储化学结构是化学信息学首先要解决的问题,由于历史的原因,现在化学结构存储的文件格式多不胜数,给相关研究工作带来了诸多不便。本文首先综述分子结构在计算机中常见的编码方式,介绍化学结构存储的常用文件格式,讨论分子...
关键词:化学信息学 分子模拟 分子的结构 文件格式 BABEL 
生物信息学和化学信息学网络研究平台的构建被引量:3
《计算机与应用化学》2007年第5期693-698,共6页孔德信 张红雨 
山东理工大学博士科研启动基金(4041-405019);山东理工大学生命科学学院特色学科建设项目的资助.
生物信息学和化学信息学均需要利用计算机和网络作为其研究平台,从网络中获取数据,利用远程计算机完成计算分析任务;同时,生物信息学和化学信息学软件分布在Unix、Linux和Windows等不同的操作系统平台上。因此,对从事生物信息与化学信...
关键词:生物信息学 化学信息学 网络研究平台 X—server 跨系统 远程图形登录 
丙型肝炎病毒的非结构蛋白3抑制剂被引量:2
《生命的化学》2007年第1期70-72,共3页吕巍 孔德信 
山东理工大学博士科研启动基金(No.405019);山东理工大学生命科学学院特色学科基金资助
丙型肝炎严重威胁人类健康,非结构蛋白3(NS3)在丙型肝炎病毒(HCV)多聚蛋白水解过程中起重要作用,被公认为治疗丙型肝炎的有效药物靶标。该文介绍目前国内外有关NS3蛋白酶抑制剂(包括寡肽类抑制剂和非肽小分子抑制剂)的研究进展。
关键词:丙型肝炎病毒(HCV) 非结构蛋白3(NS3) 抑制剂 
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