GYPSY

作品数:30被引量:41H指数:6
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四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的分离及序列分析
《分子植物育种》2023年第21期6972-6981,共10页蔡铁城 张冲 刘菁 阳太亿 陈华 蒋菁 贺梁琼 韩柱强 唐荣华 庄伟建 刘俊仙 熊发前 
国家自然科学基金项目(31960409;32072103;31960416);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA281027;2018GXNSFDA294004;2020GXNSFAA297081)共同资助。
本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶(RT)基因序列,分析了其序列特点和差异,为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物,PCR扩增四倍体野生种花生(Arachi...
关键词:花生 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 异质性 四倍体野生种 
AA染色体组野生种花生Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列的多样性被引量:1
《江苏农业科学》2022年第9期43-54,共12页刘俊仙 刘菁 唐荣华 阳太亿 韩柱强 唐秀梅 贺梁琼 钟瑞春 蒋菁 黄志鹏 吴海宁 韦荣昌 熊发前 
国家自然科学基金(编号:31960409、31960416);广西壮族自治区自然科学基金(编号:2018GXNSFDA281027、2018GXNSFDA294004、2020GXNSFAA297081);广西农业科学院科技发展基金(编号:桂农科2018YM06、桂农科2017JZ13、桂农科31960409、桂农科2021YT052)。
以2份AA染色体组野生种花生为试验材料,扩增分离Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列,分析其序列特征、多样性及进化关系。利用根据Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶的保守区设计的简并引物进行PCR扩增,对目的条带进行回收、克隆和测序后,对逆...
关键词:野生种花生 Ty3-gypsy类逆转座子 逆转录酶 多样性 
栽培种花生Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶基因序列的分离与分析
《基因组学与应用生物学》2022年第4期862-876,共15页熊发前 刘俊仙 刘菁 阳太亿 贺梁琼 蒋菁 韩柱强 唐秀梅 钟瑞春 吴海宁 黄志鹏 唐荣华 
国家自然科学基金项目(31960409);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA281027);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2018YM06,桂农科2017JZ13,桂农科31960409)共同资助。
植物长末端重复(long terminal repeat,LTR)逆转座子具有普遍性、高拷贝、高异质性和插入多态性,适合开发成分子标记。本研究从栽培种花生(Arachis hypogaea)基因组中获得Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶基因序列,分析其特点和差异,为基于...
关键词:花生 Ty3-gypsy类逆转座子 逆转录酶 异质性 
基于茶树Ty3-gypsy逆转录转座子序列的IRAP分子标记开发及利用被引量:1
《分子植物育种》2022年第3期902-918,共17页陈立佼 蒋奇呈 李红叶 刘琨毅 张正艳 刘明丽 赵明 王苗 
云南省科技厅应用基础研究青年项目(2018FD022);茶树生物学与资源利用国家重点实验室开放基金项目(SKLTOF20180114);国家自然科学基金项目(31760225)共同资助。
IRAP分子标记被广泛运用于植物物种间的鉴定及遗传多样性研究。为探究IRAP分子标记在茶树种质资源研究中的可行性,本研究采用通用引物成功扩增茶树Ty3-gypsy类型逆转录转座子逆转录酶序列,通过多态性及单倍型分析,评价其适于开发分子标...
关键词:茶树 逆转录转座子 IRAP分子标记 逆转录酶 遗传多样性 
果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的多样性分析
《南方农业学报》2022年第2期287-298,共12页刘俊仙 阳太亿 刘菁 张荣华 卢曼曼 雷敬超 高轶静 丘立杭 李松 熊发前 
国家自然科学基金项目(31960416);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA294004,2020GXNSFAA297081);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科31960416)。
【目的】分析Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶基因(RT)序列特征、多样性、系统进化关系及转录活性,为深入研究果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列、转录转座活性及生物学功能提供理论参考。【方法】以果蔗品种拔地拉为试材,根据Ty3-g...
关键词:果蔗 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 拔地拉 多样性 
甘蔗Ty3-gypsy类逆转座子RT基因的克隆及分析被引量:1
《福建农业学报》2021年第9期989-998,共10页刘俊仙 刘菁 阳太亿 高轶静 段维兴 雷敬超 刘丽敏 刘红坚 张荣华 何为中 李松 熊发前 
国家自然科学基金项目(31960416、31960409);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA294004、2018GXNSFDA281027、2020GXNSFAA297081);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科31960416)。
【目的】从甘蔗基因组中分离Ty3-gypsy类逆转座子的RT基因序列,分析序列的特点、差异及系统进化关系,为研究其转录活性和调控功能奠定基础。【方法】根据Ty3-gypsy类逆转座子RT基因序列的保守区设计简并引物,对甘蔗品种新台糖22的基因组...
关键词:甘蔗 Ty3-gypsy类逆转座子 逆转录酶 新台糖22 异质性 
枇杷LTR类反转录转座子RT序列的克隆及分析被引量:2
《果树学报》2021年第4期471-484,共14页罗昌斌 范付华 尚先文 
贵州省一流学科建设项目(GNYL[2017]007)。
【目的】揭示枇杷LTR类反转录转子座RT序列在枇杷基因组中的异质性,为枇杷转座子进化和多样性研究提供依据。【方法】以普通枇杷野生种质的叶片为材料,通过简并引物从枇杷基因组中扩增得到Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序...
关键词:枇杷 反转录转座子 反转录酶 Ty1-copia Ty3-gypsy 异质性 
Genome Size Evolution Mediated by Gypsy Retrotransposons in Brassicaceae被引量:1
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2020年第3期321-332,共12页Shi-Jian Zhang Lei Liu Ruolin Yang Xiangfeng Wang 
the“Innovation Project for the Postdoctoral Researchers”in China;the“Open Research Fund Program”of Beijing Key Lab of Plant Resource Research and Development,Beijing Technology and Business University。
The dynamic activity of transposable elements(TEs)contributes to the vast diversity of genome size and architecture among plants.Here,we examined the genomic distribution and transposition activity of long terminal re...
关键词:Genome Size Evolution Mediated by Gypsy Retrotransposons in Brassicaceae 
中国樱桃LTR类反转录转座子反转录酶序列的克隆和分析被引量:1
《园艺学报》2020年第2期355-369,共15页刘厚宇 吴敏芳 文晓鹏 
贵州省农业攻关项目(黔科合支撑[2016]2520)。
利用同源序列法根据Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶保守区设计简并引物,从中国樱桃(Prunus pseudocerasus Lindl.)中分别扩增出约260和430 bp的目标片段,并进行克隆、测序、序列分析及转录活性检测。共获得44条Ty1-copia...
关键词:樱桃 中国樱桃 Ty1-copia Ty3-gypsy 反转录酶 序列分析 转录活性 
杂交构树Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列的多样性分析被引量:5
《分子植物育种》2018年第22期7429-7437,共9页白杨 林晓飞 张文波 
国家自然科学基金(31660213;31560065;31160143;31260168;31060106);内蒙古自治区科技创新引导奖励基金;内蒙古自然科学基金(2015MS0354);内蒙古农业大学博士基金(BJ08-27)共同资助
为深入分析杂交构树的遗传多样性,开发可靠的分子标记,采用同源克隆技术分离了Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列,并对其同源性及系统进化关系进行了分析。所分离的40条序列(命名为BpRT1-40)长度为410~420 bp,均富含AT碱基,序列间的同...
关键词:杂交构树 逆转座子 逆转录酶 遗传多样性 
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