逆转座子

作品数:66被引量:279H指数:6
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来源于逆转座子RNA的生物学功能被引量:1
《生命的化学》2024年第9期1560-1568,共9页冯煜 孙昊田 王露 
国家自然科学基金面上项目(32270600);上海市浦江人才计划项目(21PJ1414000);上海市科学技术委员会自然科学基金面上项目(22ZR1468800)。
转座子广泛存在于几乎所有的真核生物基因组中,并且人类基因组中近一半的DNA是由转座子构成的。转座子在基因组中的转座可以引起DNA断裂、基因突变甚至基因组不稳定,所以其异常激活不仅会导致动物不育和疾病,还可能加速衰老进程,因此转...
关键词:转座子 胚胎发育 天然免疫 衰老 
苏山猪系谱构建和群体遗传多样性分析
《中国畜牧杂志》2024年第8期168-174,共7页于淼 何佳 周辰宇 李碧侠 宋成义 王宵燕 
江苏省国际联合研究实验室关于国内动物种质资源与遗传改良的开放项目[IJRLD-KF202215];江苏省种业振兴计划[JBGS(2020)028]。
苏山猪是以大白猪和苏钟猪为亲本培育而成的新品种,因疾病流行和转群等因素影响,苏山猪群体存在遗传背景不清的问题,急需重建系谱,为苏山猪持续选种选育和推广提供依据。本研究采用18个基于短散布元件(Short Interspersed Elements,SINE...
关键词:苏山猪 逆转座子插入多态 SINE 遗传多样性 
人类早期胚胎发育过程中组蛋白修饰的调控
《中国科学:生命科学》2024年第1期84-93,共10页徐睿敏 李翀 刘晓雨 高绍荣 
哺乳动物的生命起源于两个终末分化的生殖细胞的结合(受精),随即父母源的染色质发生剧烈且精确的表观遗传重编程,并形成具有全能性的胚胎.研究早期胚胎发育是理解物种延续和进化的重要途径,也为女性生殖健康和再生医学提供了重要理论依...
关键词:人类早期胚胎 表观遗传重编程 组蛋白修饰 合子基因组激活 逆转座子 
AA染色体组野生种花生Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列的多样性被引量:1
《江苏农业科学》2022年第9期43-54,共12页刘俊仙 刘菁 唐荣华 阳太亿 韩柱强 唐秀梅 贺梁琼 钟瑞春 蒋菁 黄志鹏 吴海宁 韦荣昌 熊发前 
国家自然科学基金(编号:31960409、31960416);广西壮族自治区自然科学基金(编号:2018GXNSFDA281027、2018GXNSFDA294004、2020GXNSFAA297081);广西农业科学院科技发展基金(编号:桂农科2018YM06、桂农科2017JZ13、桂农科31960409、桂农科2021YT052)。
以2份AA染色体组野生种花生为试验材料,扩增分离Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶序列,分析其序列特征、多样性及进化关系。利用根据Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶的保守区设计的简并引物进行PCR扩增,对目的条带进行回收、克隆和测序后,对逆...
关键词:野生种花生 Ty3-gypsy类逆转座子 逆转录酶 多样性 
栽培种花生Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶基因序列的分离与分析
《基因组学与应用生物学》2022年第4期862-876,共15页熊发前 刘俊仙 刘菁 阳太亿 贺梁琼 蒋菁 韩柱强 唐秀梅 钟瑞春 吴海宁 黄志鹏 唐荣华 
国家自然科学基金项目(31960409);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA281027);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2018YM06,桂农科2017JZ13,桂农科31960409)共同资助。
植物长末端重复(long terminal repeat,LTR)逆转座子具有普遍性、高拷贝、高异质性和插入多态性,适合开发成分子标记。本研究从栽培种花生(Arachis hypogaea)基因组中获得Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶基因序列,分析其特点和差异,为基于...
关键词:花生 Ty3-gypsy类逆转座子 逆转录酶 异质性 
甘蔗Ty3-gypsy类逆转座子RT基因的克隆及分析被引量:1
《福建农业学报》2021年第9期989-998,共10页刘俊仙 刘菁 阳太亿 高轶静 段维兴 雷敬超 刘丽敏 刘红坚 张荣华 何为中 李松 熊发前 
国家自然科学基金项目(31960416、31960409);广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA294004、2018GXNSFDA281027、2020GXNSFAA297081);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科31960416)。
【目的】从甘蔗基因组中分离Ty3-gypsy类逆转座子的RT基因序列,分析序列的特点、差异及系统进化关系,为研究其转录活性和调控功能奠定基础。【方法】根据Ty3-gypsy类逆转座子RT基因序列的保守区设计简并引物,对甘蔗品种新台糖22的基因组...
关键词:甘蔗 Ty3-gypsy类逆转座子 逆转录酶 新台糖22 异质性 
逆转座子LINE-1在脑胶质瘤中异常活化的临床意义被引量:1
《中国实验诊断学》2020年第8期1308-1310,共3页王春辉 孟繁凯 费邵阳 陈莫 郑林杰 
吉林省科技厅基础处自然科学基金资助(20180101300JC)。
目的检测逆转座子LINE-1在脑胶质瘤中的表达水平,探讨其异常激活与肿瘤病理特征和患者生存预后的关联;方法收集30例脑胶质瘤组织,利用qPCR检测逆转座子LINE-1ORF1的表达水平,并分析LINE-1表达水平与肿瘤病理分类的关系,利用Kaplan-Meire...
关键词:脑胶质瘤 逆转座LINE-1 临床病理特征 预后 
‘元帅’苹果短枝变异逆转座子插入位点临近基因Md RDACO1的表达及功能分析被引量:3
《园艺学报》2020年第8期1429-1437,共9页马福利 穆文磊 周军永 陆丽娟 孙其宝 王海燕 孙俊 
国家自然科学基金项目(31372043,31071776)。
前期研究发现在‘元帅’苹果短枝突变体4号染色体约3768578 bp处存在一个2190 bp的逆转座子Mdsolo-LTR1及其插入位点3’端约50 kb处有一乙烯合成限速酶基因ACO1。以‘元帅’及其短枝突变品种‘奥勒冈矮生’为试材,研究逆转座子Mdsolo-L...
关键词:苹果 短枝突变 逆转座子 基因表达 
SAMHD1参与逆转座子LINE-1调控在白血病发病中的机制研究被引量:2
《中国实验诊断学》2019年第11期1969-1971,共3页魏宇鹏 关宝杰 
LINE-1(long interspersed nuclear elements-1)是现今人体内唯一具有自主转座活性的逆转座子,广泛分布于基因组中[1]。宿主细胞对LINE-1的转座有着严格地控制,在正常分化的细胞中,LINE-1的启动子为高度甲基化状态,造成沉默[2,3]。当机...
关键词:缺陷性疾病 逆转座子 激活状态 白血病 宿主细胞 高度甲基化 肿瘤细胞 控制能力 
逆转座子LINE1在Hela细胞中的表达及转录组分析
《大连海洋大学学报》2019年第2期153-159,共7页储旭 周涛 李文豪 邢虎 陈良标 
国家自然科学基金资助项目(31572611);上海市教委水产高峰学科项目
为研究逆转座子LINE1(简称为L1)在Hela细胞内的作用机制,对转染L1的Hela细胞和正常细胞进行转录组测序,通过对转录组数据进行拼接组装,对差异表达基因进行了生物信息学分析。结果表明:试验共筛选出391个差异表达基因,其中45.6%的差异表...
关键词:LINE1 HELA细胞 转录组测序 逆转座子 
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