UNIFRAC

作品数:4被引量:11H指数:1
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基于拉普拉斯矩阵的流形UniFrac算法
《辽宁大学学报(自然科学版)》2025年第1期79-85,共7页范业田 宋博 
教育部“春晖计划”合作科研项目(HZKY20220439)。
UniFrac距离是衡量微生物群落关系的重要且稳健的算法之一,它可以比较不同环境样本的微生物菌群组成,以分析微生物群落结构和功能多样性.但是现有算法没有考虑微生物菌群在生物流形上的分布,并且因为微生物菌群数据的维度高、系统发生...
关键词:UniFrac距离 流形 拉普拉斯矩阵 微生物组 
Taxonomic and phylogenetic composition show biotic resistance to exotic invasion in acid seep springs
《Ecological Processes》2021年第1期77-88,共12页David F.Barfknecht David J.Gibson 
Background:Few studies have incorporated the evolutionary insights provided by analysis of phylogenetic structure along with community composition to assess the effects of exotic invasion on freshwater wetlands.Here,w...
关键词:Acid seep springs Diversity Community PHYLOGENETICS Exotic invasion Environmental filtering NMDS UNIFRAC Vector analysis 
Bacterial communities in paddy soils changed by milk vetch as green manure: A study conducted across six provinces in South China被引量:11
《Pedosphere》2021年第4期521-530,共10页Songjuan GAO Weidong CAO Guopeng ZHOU Robert M.REES 
supported by the earmarked fund for Modern Agro-industry Technology Research System-Green Manure,China (No.CARS-22);the National Natural Science Foundation of China (No.42007071)。
The use of green manures contributes to sustainable soil and nutrient management in agriculture;however, the responses of soil microbial communities to different fertilization regimes at the regional scale are uncerta...
关键词:alpha diversity bacterial composition functional group operational taxonomic unit soil fertility Weighted UniFrac distance 
东北湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性
《微生物学报》2019年第2期364-373,共10页李想 孙岩 刘俊杰 姚钦 王光华 
国家自然科学基金(41571246)~~
【目的】揭示我国东北典型湿地沉积物中T4型噬菌体g23基因的多样性,明确湿地环境T4型噬菌体群落分布特征,为噬菌体生态学研究提供数据支撑。【方法】采用简并性引物MZIA1bis和MZIA6对采自东北6个地点不同类型湿地沉积物土壤DNA进行PCR扩...
关键词:T4型噬菌体 g23基因 湿地沉积物 系统进化树 Unifrac分析 
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