原核生物

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海洋沉积物病毒荧光计数法的优化
《海洋与湖沼》2017年第3期516-526,共11页维妙 徐奎栋 
中国科学院战略性先导科技专项项目三"深海海洋环境与生态系统";XDA11030201号;973项目"超深渊生物群落及其与关键环境要素的相互作用机制研究";2015CB755902号
病毒在海洋生态系统的物质循环和能流中起着重要作用,对其进行有效定量是研究其数量变动和生态功能的前提。现行的海洋沉积物病毒定量主要采用荧光染色计数法,但对技术流程中一些处理方法的定量效能尚待验证。本研究利用不同类型海洋沉...
关键词:海洋沉积物 病毒 原核生物 定量效能 荧光计数法 
基于全基因组的微生物亲缘关系与分类系统研究工具——CVTree
《生物技术通报》2015年第11期60-67,共8页左光宏 郝柏林 
国家重点基础研究"973"计划(2007CB814800;2013CB834100)
组分矢量构树(CVTree)方法是基于全基因组的、不用序列联配的物种亲缘关系研究方法。CVTree3是我们最新开发的CVTree网络服务器,它基于并行化的核心程序,以适应当前基因组数据的海量增加;它自动对比物种亲缘关系与分类系统,并在网页上...
关键词:CVTree 原核生物 全基因组 亲缘关系树 分类系统 
从完全基因组出发建立原核生物亲缘关系和分类系统时遇到的数学问题被引量:2
《中国科学:物理学、力学、天文学》2014年第12期1301-1310,共10页李强 左光宏 郝柏林 
国家重点基础研究发展计划(编号:2007CB814800;2013CB834100);上海市基础研究计划(编号:B111);复旦大学物理系应用表面物理国家重点实验室资助项目
我们课题组近10年所发展的组分矢量(CVTree)方法,已经成为从完全基因组出发而不使用序列联配来构建细菌亲缘关系的有效手段.在整个生物分类学日益后继乏人的背景下,组分矢量(CVTree)方法伴随着基因组时代的发展,成为人人可以方便使用的...
关键词:无序列比对 全基因组亲缘关系 原核生物 组合学 欧拉圈 可因式化语言 
原核生物蛋白质基因组学研究进展被引量:3
《生物工程学报》2014年第7期1026-1035,共10页张成普 徐平 朱云平 
国家重点基础研究计划(973计划)(Nos.2011CB910600,2010CB912700,2013CB911200);国家高技术研究发展计划(863计划)(Nos.2012AA020409,2012AA020201);国家自然科学基金(Nos.21105121,21275160);北京市自然科学基金(No.5122013)资助~~
随着基因组测序技术的不断发展,大量微生物基因组序列可以在短时间内得以准确鉴定。为了进一步探究基因组的结构与功能,基于序列特征与同源特征的基因组注释算法广泛应用于新测序物种。然而受基因组测序质量以及算法本身准确性偏低等问...
关键词:蛋白质基因组学 原核生物 基因组注释 质谱 
木薯ftsZ基因分离及在原核生物中功能初步鉴定被引量:2
《中国生物工程杂志》2013年第6期24-29,共6页耿梦婷 姚远 胡新文 郭建春 闵义 
国家"973计划"(2010CB126600);国家自然科学基金(31160061);木薯现代产业科技体系项目;"211工程"热带作物遗传育种与生态保育创新人才培养基金青年教师项目(QNJS-2011-12)资助项目
ftsZ基因是控制细胞分裂的关键基因,其蛋白能够在分裂位点形成一个环状结构而影响细胞分裂。为了研究木薯质体分裂与木薯淀粉品质形成的关系,根据木薯基因组数据库上的预测序列,设计引物,从木薯基因组中分离了与质体分裂相关的ftsZ家族...
关键词:木薯 ftsZ基因家族 大肠杆菌表达 细胞分裂 
核糖体谱技术及其应用被引量:1
《生物化学与生物物理进展》2013年第1期30-32,共3页贾志龙 屈武斌 卢一鸣 骆志刚 张成岗 
国家自然科学基金资助项目(30900830;81172770);国家重点基础研究发展计划(973)(2012CB518200);蛋白质组学国家重点实验室自主研究课题资助项目(SKLP-K201004)
当前,基因组范围内分析细胞内蛋白质翻译事件的研究仍然落后于转录事件的研究.无论原核生物还是真核生物,细胞内的核糖体均是蛋白质翻译的工厂,因此对于核糖体的研究至关重要.早在1963年,Warner等[1]发现了细胞内的多聚核糖体结构.
关键词:核糖体 谱技术 应用 RNASE 细胞内 真核生物 原核生物 蛋白质 
不同生活习性下原核生物基因组大小与GC含量的关系研究被引量:2
《中山大学学报(自然科学版)》2011年第3期90-93,共4页林瀚 黄亚志 张尚宏 
国家自然科学基金资助项目(30270752);广东省自然科学基金资助项目(031616);国家973计划资助项目(2005CB724600);国家人才基金(基地)项目(J0730638)
对原核生物基因组的研究显示,基因组GC含量与基因组大小和氧气偏好性等因素存在着一定的相关性。为了探索基因组大小与GC含量的相关性是否受原核生物生活习性的影响,选取了有代表性的411种原核生物(包括古细菌与真细菌),分别从最适生长...
关键词:原核生物 基因组大小 GC含量 生活习性 相关/回归分析 
原核生物的蛋白质翻译后修饰被引量:10
《生物化学与生物物理进展》2011年第3期197-203,共7页谭永聪 王启军 赵国屏 姚玉峰 
国家自然科学基金(30870100);国家重点基础研究发展计划(973)(2009CB522605)资助项目~~
蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物学功能的关键步骤之一,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础,同时,它也是细胞信号网络调控的重要靶点.目前,蛋白质翻译后修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的热点.在原核生物生命...
关键词:原核生物 蛋白质翻译后修饰 糖基化 磷酸化 脂质化 乙酰化 类泛素化 甲基化 
大肠杆菌肽脱甲酰基酶的表达、纯化及活性检测
《中华微生物学和免疫学杂志》2010年第5期476-476,共1页王兰兰 车绪春 陆融 朱志峰 王松 王冲 李晓蕾 徐琼 王莉 林刚 姚智 
国家重点基础研究发展计划(“973”计划)资助项目(2009CB918903);天津市自然科学基金资助项目(09JCZDJC19700);广东省产学研结合项目(20098090300430)
肽脱甲酰基酶(peptide deformylase,PDF)是原核生物生长、代谢、繁殖必不可少的关键酶,而在人类和其他哺乳动物中不发挥明显作用,因而被视为新一代广谱抗生素药物筛选的理想靶点。最早被发现并进行研究的是大肠杆菌的PDF,但其体...
关键词:肽脱甲酰基酶 大肠杆菌 活性检测 纯化 广谱抗生素 PDF 原核生物 哺乳动物 
表达大豆GMCHI基因能够提高原核生物耐低温性被引量:1
《作物学报》2009年第6期1156-1160,共5页程立宝 李淑艳 景新明 何光源 
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2002CB111302)资助
低温是种子萌发过程中常见的自然灾害,在我国北方经常发生,这导致种子萌发率较差、降低植株活力等后果。利用cDNA-AFLP技术从低温(4℃)吸胀24h的抗低温吸胀大豆品种中黄22(低温吸胀24h对萌发率无影响的品种)中分离出一个基因片段,命名为...
关键词:大豆 GMCHI 菌落 CDNA-AFLP 基因 低温 
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