郝柏林

作品数：58被引量：239H指数：7
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基因组时代的计算微生物学被引量：2
《中国科学：生命科学》2017年第2期159-170,共12页左光宏 郝柏林 
国家重大科学研究计划(批准号:2007CB814800,2013CB834100)资助
微生物基因组和RNA序列构成生物学数据的重要部分.从基因组出发而且不用序列联配的CVTree和基于16S rRNA序列联配的LVTree,是两套原始数据和计算过程相互独立的构建原核生物亲缘树和分类系统的途径.这两套途径的自动化,使亲缘关系和分...
关键词：原核生物 亲缘树 分类系统 不用序列联配的基因组比较 CVTree LVTree 
基于全基因组的微生物亲缘关系与分类系统研究工具——CVTree
《生物技术通报》2015年第11期60-67,共8页左光宏 郝柏林 
国家重点基础研究"973"计划(2007CB814800;2013CB834100)
组分矢量构树(CVTree)方法是基于全基因组的、不用序列联配的物种亲缘关系研究方法。CVTree3是我们最新开发的CVTree网络服务器,它基于并行化的核心程序,以适应当前基因组数据的海量增加;它自动对比物种亲缘关系与分类系统,并在网页上...
关键词：CVTree 原核生物 全基因组 亲缘关系树 分类系统 
从完全基因组出发建立原核生物亲缘关系和分类系统时遇到的数学问题被引量：2
《中国科学：物理学、力学、天文学》2014年第12期1301-1310,共10页李强 左光宏 郝柏林 
国家重点基础研究发展计划(编号:2007CB814800;2013CB834100);上海市基础研究计划(编号:B111);复旦大学物理系应用表面物理国家重点实验室资助项目
我们课题组近10年所发展的组分矢量(CVTree)方法,已经成为从完全基因组出发而不使用序列联配来构建细菌亲缘关系的有效手段.在整个生物分类学日益后继乏人的背景下,组分矢量(CVTree)方法伴随着基因组时代的发展,成为人人可以方便使用的...
关键词：无序列比对 全基因组亲缘关系 原核生物 组合学 欧拉圈 可因式化语言 
物理是一种文化被引量：8
《物理通报》2012年第12期2-5,共4页郝柏林 
说明：本文基于作者2011年12月13日在澳门举行的两岸四地物理教学研讨会上的发言．删去了可能涉及版权的图片，内容也略有增减．当19世纪后半叶物理学从西方传人中国时，metaphysics已经被翻译成形而上学，于是有人把physics称为“形而...
关键词：物理学 文化 教学研讨会 形而上学 工作者 中国 翻译 
我的恩师王竹溪
《物理》2012年第7期455-457,共3页郝柏林 
王竹溪先生的许多弟子,可能对本文题目感到诧异.一个最多只能算＂门外弟子＂的后学,怎敢妄呼＂恩师＂! 由于高中毕业就被派往苏联读本科,在那里从矿山经济改学物理,我在国内没有母校和师友.然而,在感情上,北京大学（以下简称北大）是...
关键词：统计物理学 细致平衡 非平衡过程 矿山经济 北京大学 遍历理论 热力学 
基因组测序永无止境的根本原因被引量：2
《科学》2011年第5期5-10,共6页郝柏林 
1869年瑞士青年学者米歇尔（Johann F.Miescher．1844—1895年）在莱茵河鳟鱼的精子里发现了脱氧核糖核酸分子，即现在大家熟知的DNA。他虽然也曾猜想过DNA可能与遗传有关，但还是倾毕生精力去研究鱼精蛋白。毕竟蛋白质与生命过程的关...
关键词：基因组测序际信息论定理 非典型序列集合 生命之树 
布朗运动理论一百年被引量：20
《物理》2011年第1期1-7,共7页郝柏林 
文章基于作者在2005年纪念爱因斯坦奇迹年的香山会议上的综述报告,扼要叙述了从布朗运动到统计涨落场论的发展历程,特别提及了与中国物理学家有关的贡献.
关键词：布朗运动 随机行走 广义朗之万方程 维纳路径积分 涨落场论 随机量子化 
生物领域是数理和计算科学的广阔用武之地被引量：1
《科技导报》2010年第11期3-3,共1页郝柏林 
生物是物,生物有形、生物有数、生物有理。DNA双螺旋结构和遗传密码的发现,开启了分子生物学时代。生物学已经积累了大量事实和数据,而且每日每时产生着海量新数据。2003年完成的人类基因组计划，花费了约30亿美元测定一个人基因组的30...
关键词：生物领域 计算科学 人类基因组计划 DNA双螺旋结构 遗传密码 分子生物 生物学 
生物领域是数理和计算科学的广阔用武之地
《生理通讯》2010年第3期62-63,共2页郝柏林 
生物是物，生物有形、生物有数、生物有理。DNA双螺旋结构和遗传密码的发现，开启了分子生物学时代。生物学已经积累了大量事实和数据，而且每日每时产生着海量新数据。2003年完成的人类基因组计划，花费了约30亿美元测定一个人基因组...
关键词：生物领域 计算科学 人类基因组计划 DNA双螺旋结构 生物学规律 基因组测序 遗传密码 分子生物 
郝柏林：基础研究需“于无声处听惊雷”
《科学新闻》2009年第6期32-32,共1页郝柏林 
中国科学社是当时中国的科学精英。在抗日战争时期，他们仍然没有停刊．艰难地发行了草纸版、战时版。我在抗战期间正读小学，当时即订阅了《科学》杂志战时版。
关键词：基础研究 中国科学社 柏林 抗日战争时期 《科学》杂志 抗战期间 战时 
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