生物合成基因簇

作品数：182被引量：366H指数：9
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泉州湾红树林根际土壤放线菌的分离鉴定及链霉菌W444次级代谢产物的鉴定
《微生物学报》2025年第2期597-613,共17页张文州 陈琳琳 林水森 林阳君 庄月娥 谢志新 江红 连云阳 骆祝华 彭飞 
泉州市科技计划(2023NS082);泉州医学高等专科学校校级课题重点科技项目(XJK2210A);泉州医学高等专科学校研究型教学项目(XJJK2308);自然资源部第三海洋研究所开放基金(HY202304)。
【目的】从泉州湾2种红树林的根际土壤中分离并鉴定放线菌,进行抗真菌活性初筛以获取目标菌株,并对链霉菌属(Streptomyces)W444的次级代谢产物进行分离与鉴定。【方法】从泉州湾洛阳江采集2种不同红树林植物的根际土壤样品,采用稀释涂...
关键词：泉州湾红树林 放线菌 吲哚类化合物 生物合成基因簇 
喷他霉素新生产菌的发现及产量提高被引量：1
《微生物学通报》2024年第8期2888-2904,共17页孙佳宁 王海燕 范可强 何信 廖振翔 王立艳 黄英 任晋玮 孟大利 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32270081)。
【背景】喷他霉素(pentamycin)是一种多烯大环内酯类抗生素,对白色念珠菌(Candida albicans)、阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)和其他几种病原菌有显著的抑制活性,在瑞士已被注册用于治疗阴道念珠菌病、滴虫病和混合感染。【目的】...
关键词：次级代谢产物 喷他霉素 生物合成基因簇 基因工程改造 
链霉菌次级代谢产物生物合成的调控研究进展
《中草药》2024年第14期4917-4929,共13页孟俊华 张少航 鲁曼霞 厉晓 龚婕 王炜 崔培梧 
国家自然科学基金资助项目(81973211/C0033375);湖南中医药大学研究生创新课题(校行研字[2022]20号-87);湖南中医药大学“十四五”重点学科-生物工程学科(校行发规字[2023]2号)。
链霉菌属微生物是生产抗生素的优势菌群,也是一些维生素和酶的重要来源,具有广阔的开发前景;然而,链霉菌代谢网络和调控机制的复杂性,及大量基因簇的沉默限制了其次级代谢产物的高效合成。快速发展的代谢工程技术为人为干预、调控链霉...
关键词：链霉菌 次级代谢产物 代谢调控 生物合成基因簇 非靶向调控 靶向调控 
玉米大斑病菌铁载体合成基因簇鉴定及表达分析被引量：1
《农业生物技术学报》2024年第5期1121-1131,共11页岳浩峰 赵天益 李海笑 闫秋静 徐雅迪 孟亚南 曹志艳 刘宁 董金皋 
国家现代农业产业技术体系(CARS-02);国家自然科学基金(32072370;31901827);河北省自然科学基金(C2020204183);中央引导地方科技发展资金(226Z6502G)。
铁是微生物生长必需的元素,在氧代谢、电子转移以及DNA和RNA合成等过程中发挥重要作用,微生物主要依赖于铁载体吸收环境中的铁离子。铁载体作为微生物分泌的低分子量铁螯合物,协助机体运输铁离子。真菌主要利用非核糖体多肽合成酶编码...
关键词：玉米大斑病菌 铁载体 次级代谢产物生物合成基因簇 基因表达 
一种抗稻曲病菌的摩氏假单胞菌JP2-207及其抗性机制初探被引量：1
《中国稻米》2024年第2期13-17,共5页刘思慧 明珂 陈国庆 冯国忠 
浙江省重点研发计划项目(2021C02006);中央级公益性科研院所基本科研业务费(CPSIBRF-CNRRI-202115)。
从水稻根际表面土壤分离到一株能有效抑制稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)生长的细菌菌株JP2-207。16s r RNA基因片段扩增及系统发育树分析表明,JP2-207属于摩氏假单胞菌(Pseudomonas mosselii)。测序分析显示,JP2-207全基因组为1个大...
关键词：摩氏假单胞菌 水稻 稻曲病 次生代谢产物 生物合成基因簇 生物防治 
植物次生代谢产物生物合成基因簇研究进展被引量：3
《植物学报》2024年第1期134-143,共10页朱璐 袁冲 刘义飞 
国家自然科学基金(No.32270231);湖北省杰出青年基金(No.2019CFA097)。
植物产生的次生代谢产物为人类提供了丰富的药物、香料和工业原料。随着分子生物学和基因组学研究的快速发展,目前已解析了多种植物的次生代谢产物生物合成基因簇(BGCs)。这为我们快速获取目标产物的生物合成通路和发掘新颖的天然产物...
关键词：次生代谢产物 生物合成基因簇 基因簇调控 基因簇特征 
青霉属真菌次级代谢基因挖掘的研究进展被引量：1
《中国海洋药物》2024年第1期74-85,共12页孙园园 于豪冰 翟祥宁 宁哲 何颖 胡波 刘小宇 
国家重点研发计划项目(2018YFC1406702)资助。
青霉属真菌是自然界中最常见的真菌,分布范围非常广泛,是最重要的药源真菌,从青霉属真菌中报道了许多具有抗菌、抗肿瘤、抗病毒等活性的次级代谢产物,是药物先导化合物的重要来源。近年来,随着微生物全基因组测序分析技术的发展以及对...
关键词：青霉属 真菌 基因挖掘 次级代谢产物 生物合成基因簇 
人体肠道4644株代表菌次级代谢产物生物合成基因簇挖掘与耐药及毒力基因分析被引量：2
《生物工程学报》2022年第10期3682-3694,共13页尹业师 陈浒 张美红 曹林艳 陈华海 
湖南省自然科学基金杰出青年基金(2020JJ2016);国家自然科学基金区域创新发展联合基金(U21A20411)。
为了更好地从肠道微生物组中挖掘新的次级代谢产物、了解肠道微生物组编码的抗生素耐药基因和毒力因子情况,本研究基于4644株人体肠道微生物代表菌的基因组序列,对其编码的次级代谢产物基因簇、抗生素耐药基因和毒力因子进行了预测分析...
关键词：肠道菌群 代表性菌株 次级代谢产物 抗生素耐药基因 毒力因子 
后基因组时代微生物天然产物高效发掘体系设计与展望被引量：1
《微生物学杂志》2022年第3期1-14,共14页潘华奇 
国家自然科学基金面上项目(31872036,41576136);中国科学院战略性先导科技专项A类(XDA28090300);中科院青年创新促进会会员项目(2018229);辽宁省兴辽英才计划项目(XLYC1807268)。
微生物天然产物具有丰富的化学结构多样性和诱人的生物活性,持续启迪着创新医药和农药的发现。近年来,随着高通量测序技术的快速发展,巨大的微生物基因组数据揭示了多样生物合成和新颖天然产物的潜能远高于以前的认知。然而,如何高效地...
关键词：潜力菌株 先导化合物 泛生物合成基因簇 沉默基因簇 基因组挖掘 代谢组学 次级代谢产物 合成生物学 
双歧杆菌次级代谢产物生物合成基因簇挖掘与毒力因子分析
《基因组学与应用生物学》2021年第11期3481-3491,共11页陈浒 曹林艳 陈华海 尹业师 
湖南省自然科学基金项目(2020JJ2016,2019JJ50198)共同资助
为系统研究双歧杆菌(Bifidobacteria)次级代谢产物生物合成基因簇和毒力因子分布情况,本研究利用antiSMASH和PathoFact对1230株双歧杆菌全基因组序列进行了次级代谢产物生物合成基因簇和毒力因子预测分析。结果表明,25.77%的双歧杆菌基...
关键词：双歧杆菌 次级代谢产物 生物合成基因簇 基因组挖掘 生物信息学 
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