生物合成基因簇

作品数:182被引量:366H指数:9
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一株产灵菌红素黏质沙雷氏菌的分离鉴定及其基因组分析
《微生物学报》2024年第11期4290-4307,共18页张雨欣 王美燕 李殿怡 司军 卞小莹 牛国清 刘蓉 
国家重点研发计划(2020YFA0907700)。
【目的】对甘蓝根际微生物进行分离,从中选择具有优良性状的菌株,对其次级代谢产物合成能力进行评估,为甘蓝根际微生物资源的发掘利用奠定基础。【方法】采集重庆市武隆区仙女山镇仙女山村甘蓝根,分离培养根际微生物菌株,从中选择一株...
关键词:甘蓝 黏质沙雷氏菌 灵菌红素 基因组分析 生物合成基因簇 异源表达 
环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2全基因组测序及序列分析被引量:1
《微生物学通报》2024年第8期3085-3102,共18页阮文伟 付建红 崔凤真 铁瑞岚 徐国燕 阿依卡买尔·艾克拜尔 
国家自然科学基金(32260226);新疆维吾尔自治区“天山”创新团队计划(2022D14004);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D01A122)。
【背景】环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2是一株中度嗜盐放线菌,其次级代谢产物具有抑制蘑菇酪氨酸酶活性、抑制小鼠黑色素瘤B16细胞内酪氨酸酶活性及黑色素合成的作用。目前S.anulatus 89-2-2基因组序列分析尚未见报道,这限...
关键词:中度嗜盐链霉菌 酪氨酸酶抑制剂 全基因组测序 生物合成基因簇 
拟无枝酸菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立被引量:1
《微生物学通报》2024年第5期1713-1731,共19页杨英哲 范可强 王海燕 向丽军 张书平 赵燕 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32270080)。
【背景】拟无枝酸菌属作为一类重要的稀有放线菌,是抗菌、抗癌类药物的重要来源,其合成天然产物的潜能尚待系统分析及发掘。【目的】揭示拟无枝酸菌属不同结构类型次级代谢产物合成潜能,并建立两个代表性菌株的遗传操作体系,为结构新颖...
关键词:拟无枝酸菌属 次级代谢 天然产物 生物合成基因簇 基因编辑 
三烷基取代芳香聚酮gombapyrones生物合成基因簇的确认及其生物合成推导
《微生物学报》2023年第12期4671-4685,共15页杨名 李晚露 张文禹 林厚文 周永军 
国家自然科学基金(32070070)。
【目的】本研究旨在确认链霉菌Streptomyces rubellomurinus ATCC 31215来源芳香聚酮化合物(gombapyrones,GOMs)的生物合成基因簇(biosynthetic gene cluster,BGC),并对其生物合成途径进行推导。【方法】对链霉菌S.rubellomurinus ATCC ...
关键词:天然产物生物合成 芳香聚酮 聚酮合酶 P450单氧化酶 
链霉菌启动子及其应用研究进展
《微生物学通报》2023年第8期3588-3605,共18页董冀欣 周群 罗云孜 
国家重点研发计划(2018YFA0903300);国家自然科学基金(32071426)。
链霉菌天然产物因其显著的生物活性一直是新药开发的重要来源,测序技术的发展揭示了链霉菌强大的生物合成潜力。链霉菌中多数次级代谢生物合成基因簇(biosynthetic geneclusters,BGCs)在常规实验条件下表达水平低甚至不表达,这使得相关...
关键词:链霉菌 启动子 天然产物 生物合成基因簇 
微生物组生物合成基因簇发掘方法及应用前景被引量:7
《合成生物学》2023年第3期611-627,共17页赖奇龙 姚帅 查毓国 白虹 宁康 
国家自然科学基金(32071465,31871334,31671374);国家重点研发计划(2021YFA0910500)。
生物合成基因簇(biosynthetic gene cluster,BGC)是一类非常重要的基因集合(gene set)类型。BGC普遍存在于各类生物基因组中,并且发挥着重要的代谢和调控作用。从线性结构上来说,一个BGC中的基因通常在基因组中处于相邻的位置;从基因功...
关键词:生物合成基因簇 人工智能 合成生物学 微生物组 
青藏高原戈壁生境中一株链霉菌新种Streptomyces haixigobicum sp.nov.Qhu-G9的多相分类学鉴定及其次级代谢产物的基因组挖掘
《微生物学通报》2023年第5期1872-1886,共15页向信 殷恒霞 樊嘉凯 邓佳文 朱肇宇 邱庆辉 柳宇睿 张本印 
国家自然科学基金(81760633);生态学世界一流学科科技创新项目(2021-stxy-Y2);生物技术一流专业科技创新项目(2022-stxy-B8,2022-stxy-B9,2022-stxy-B22)。
【背景】青藏高原极端生境具有丰富的微生物资源,同时也是微生物药物的重要来源,但是大量微生物新资源尚待开发利用。【目的】对从青藏高原戈壁土壤中分离得到的一株链霉菌Qhu-G9进行多相分类鉴定及次级代谢产物生物合成潜力分析。【方...
关键词:青藏高原 戈壁 链霉菌 多相分类学 生物合成基因簇 
教酒链霉菌中卡西霉素生物合成基因簇的calU3基因功能分析
《基因组学与应用生物学》2023年第4期418-426,共9页苟丽霞 杨清浅 刘孟欣 汪志军 韩铁生 
国家自然科学基金项目(31700083);河北省自然科学基金项目(H2020209001)共同资助。
卡西霉素(calcimycin)是重要的离子载体抗生素,具有广泛的生物活性,其生物合成基因簇已从教酒链霉菌(Streptomyces chartreusis)NRRL3882的基因组DNA中成功克隆,但其生物合成途径尚未阐明。本研究拟分析卡西霉素生物合成途径中calU3基...
关键词:卡西霉素 生物合成 氧化还原酶 FAD依赖 calU3 
链霉菌沉默基因簇激活在天然产物生物合成中的研究进展被引量:2
《中国计量大学学报》2022年第2期272-280,共9页马正 施越 章金垚 俞晓平 
国家自然科学基金项目(No.31972320);浙江省自然科学基金项目(No.LZ22C140002)。
目的:本文概述了目前激活链霉菌沉默生物合成基因簇的研究进展,并对其应用进行了讨论和展望。方法:基因测序技术揭示链霉菌基因组中蕴含几十个次级代谢产物生物合成基因簇,而这些基因簇在常规培养条件下往往处于“沉默状态”,不表达或...
关键词:链霉菌 沉默生物合成基因簇 异源表达 核糖体工程 报告基因 激活 
后基因组时代微生物天然产物高效发掘体系设计与展望被引量:1
《微生物学杂志》2022年第3期1-14,共14页潘华奇 
国家自然科学基金面上项目(31872036,41576136);中国科学院战略性先导科技专项A类(XDA28090300);中科院青年创新促进会会员项目(2018229);辽宁省兴辽英才计划项目(XLYC1807268)。
微生物天然产物具有丰富的化学结构多样性和诱人的生物活性,持续启迪着创新医药和农药的发现。近年来,随着高通量测序技术的快速发展,巨大的微生物基因组数据揭示了多样生物合成和新颖天然产物的潜能远高于以前的认知。然而,如何高效地...
关键词:潜力菌株 先导化合物 泛生物合成基因簇 沉默基因簇 基因组挖掘 代谢组学 次级代谢产物 合成生物学 
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