微卫星引物

作品数:66被引量:454H指数:13
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相关机构:中国科学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心沈阳农业大学西北农林科技大学更多>>
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蒙古莸叶绿体基因组微卫星位点分析及引物筛选
《分子植物育种》2024年第11期3646-3653,共8页刘雅璐 叶冬梅 包文泉 林涛 范宇阳 张素毓 
内蒙古自治区科技计划项目(201802109)资助。
本研究旨在为蒙古莸在分子水平上提供理论依据,以便对濒危稀有种制定科学的保护策略。本研究下载GenBank数据库公布的蒙古莸叶绿体基因组信息,利用生物信息学对蒙古莸叶绿体基因组进行cpSSR分析。利用MISA软件全面搜索蒙古莸叶绿体基因...
关键词:植物学 蒙古莸 叶绿体基因组 SSR分子标记 微卫星引物 
使用SPE软件筛选绿尾虹雉微卫星引物及其在亲缘关系鉴定上的应用被引量:1
《四川动物》2022年第4期371-378,共8页王立 李严 岳碧松 陈黎 沈富军 寇洁 王也 侯蓉 张亮 
圈养绿尾虹雉Lophophorus lhuysii多为一雄配多雌,但由于雄鸟更换,雌鸟产蛋期交错,且无特定产蛋位,导致亲子关系难以确认。本研究从绿尾虹雉基因组中广泛筛选微卫星位点,得到13对引物。采用微卫星PCR引物特异性鉴定程序(SPE)对引物序列...
关键词:绿尾虹雉 微卫星 SPE软件 多位点扩增 亲缘关系鉴定 
基于微卫星引物鉴别不同地理种群玉米螟赤眼蜂和螟黄赤眼蜂被引量:1
《环境昆虫学报》2022年第2期414-421,共8页安仕博 陈旭 戴鹏 侯洋旸 臧连生 
国家重点研发计划(2019YFD0300105);国家自然科学基金(31901946)。
不同地理种群的赤眼蜂在遗传、生理和生态适应性等方面均表现出不同程度的分化。为探究不同地理种群的玉米螟赤眼蜂Trichogramma ostriniae和螟黄赤眼蜂Trichogramma chilonis在基因型上的差异并进行准确鉴定,本研究筛选了可用以区分不...
关键词:玉米螟赤眼蜂 螟黄赤眼蜂 微卫星标记 地理种群 引物筛选 
基于高原鼠兔简化基因组数据的微卫星引物开发被引量:1
《野生动物学报》2021年第3期730-736,共7页贺玉姣 胡万军 都玉蓉 王婷 杜雷 胡书立 
青海省科技计划项目青年自然科学基金(2019-ZJ-986Q)。
高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是青藏高原的关键种,对其分子标记的开发有助于高原鼠兔种群生态等问题的研究。基于简化基因组测序技术获得了高原鼠兔简化基因组序列信息,并开发了微卫星分子标记。结果表明:通过MISA软件分析共检测到7064...
关键词:高原鼠兔 简化基因组测序 微卫星引物 
基于简化基因组数据开发岭南青冈微卫星引物被引量:4
《植物研究》2020年第4期629-634,共6页宁馨 姜小龙 邓敏 徐刚标 
国家自然科学基金(31700174);上海市绿化与市容管理局科技攻关项目(G182427)。
微卫星标记(simple sequence repeat,SSR)在基因组中普遍存在,具有共显性、高多态性等特点,在群体空间遗传研究中应用广泛。随着测序技术的发展,SSR的开发方法也更加多样化。岭南青冈(Quercus championii Benth)是中国南方常绿阔叶林的...
关键词:岭南青冈 简化基因组测序 微卫星分子标记开发 遗传多样性 
基于RAD测序技术的黄绿卷毛菇(Floccularia luteovirens)微卫星引物的开发被引量:1
《基因组学与应用生物学》2019年第3期1103-1108,共6页邢睿 王久利 闫慧颖 陈世龙 
青海省自然科学基金青年项目(2015-ZJ-925Q);青海省创新平台建设专项项目-青海省作物分子育种重点实验室(2017-ZJ-Y14);国家自然科学基金青年基金(31600409);科技基础性工作专项(2015FY110100)共同资助
黄绿卷毛菇(Floccularia luteovirens)是广泛分布于青藏高原高寒草甸的一种重要的可食用的菌根真菌。先前的研究利用EST-SSR引物已经对该物种的遗传多样性及群落结构进行了研究,但研究表明EST-SSR位点多态性较低,因此想要进一步探讨形...
关键词:微卫星 黄绿卷毛菇 青藏高原 基株 
基于Illumina测序技术的枸杞微卫星引物的开发被引量:1
《青海师范大学学报(自然科学版)》2017年第3期61-66,共6页赵鑫 李建民 朱雪冰 宗渊 魏乐 刘宝龙 
青海省应用基础研究项目(2015-ZJ-701);中国科学院西部之光项目
目的:分离和鉴定红、黑枸杞基因组中的简单重复序列(SSR)位点.方法:Illumina Hiseq 2000进行红、黑枸杞的高通量转录组测序后,生物信息分析SSR的分布频率和重复基元的类型特征,PCR扩增和聚丙烯酰胺电泳验证SSR位点及引物.结果表明:转录...
关键词:转录组分析 红果枸杞 黑果枸杞 微卫星位点 
基于近缘种微卫星引物的栓皮栎SSR标记开发及群体检测被引量:8
《分子植物育种》2017年第2期633-639,共7页石晓蒙 温强 曹牧 郭鑫 徐立安 
江苏高校优势学科项目(PAPD)资助
SSR标记是研究栓皮栎在天然资源锐减下群体遗传变异与进化的有效工具。为解决栓皮栎未建立DNA序列库而使得现有SSR标记数量相对不足的问题,本研究通过比较无梗花栎、蒙古栎、夏栎、麻栎、辽东栎5个栎属近缘种的62对微卫星引物在栓皮栎...
关键词:栓皮栎 SSR标记 通用性 遗传多样性 
中国特有濒危植物翅果油树的SSR引物开发及特性(英文)被引量:6
《西北植物学报》2016年第2期274-279,共6页叶占洋 王兆山 李云晓 饶国栋 张建国 
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(CAFYBB2016ZX003-1)
翅果油树是中国特有的濒危植物,利用磁珠富集法开发适用于翅果油树的SSR引物,并在2个翅果油树群体进行多态性验证。结果表明,筛选的20对引物中有19对是多态且选择中性的SSR引物,其中引物CGY19表现单态,仅有一个位点显示Hardy-Weinberg...
关键词:翅果油树 微卫星引物 遗传结构 保护和利用 
普兰店古莲被引量:2
《生命世界》2015年第6期20-25,共6页薛建华 徐钢 
大连普湾新区2012年科技计划项目资助
19世纪末,辽宁省普兰店的居民从旧河床中挖取河泥砌泥墙或者找烧材时,常常从河泥中发现莲子,并当作食品。由于雨水的作用,泥墙上有时会出现一些裸露在外的莲芽。这些莲芽可是由河泥中千年甚至万年的莲子发芽而来的,大家称这些莲子为"...
关键词:普兰 中国辽宁 LOTUS 铁路施工 南满 辽宁省普兰店 表皮层 薄壁组织 微卫星引物 切面图 
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