细菌基因组

作品数：89被引量：295H指数：10
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单链DNA退火蛋白介导细菌基因组同源重组的机制及应用研究进展
《生物技术通报》2025年第1期39-48,共10页尹号 尤留超 韩瑞 高鹏程 付磊 储岳峰 
国家自然科学基金面上项目(32373019);中国农业科学院兰州兽医研究所重点项目(CAAS-ASTIP-JBGS-20210701);中国农业科学院兰州兽医研究所基本业务费-科研业务费项目(110231160042012);甘肃省重点人才项目(2021RCXM047);甘肃省陇原青年创新创业人才(个人)项目(2023LQGR55)。
基因组编辑技术是研究细菌等微生物在基因功能、耐药机制及致病机制等方面的重要工具,而同源重组是细菌基因组编辑的重要方式之一,传统的细菌内源性重组途径存在效率低下的问题,而一种来自噬菌体的单链DNA退火蛋白(SSAP)表现出了远超内...
关键词：细菌 单链DNA退火蛋白 同源重组 机制 应用 
中国福氏志贺菌前噬菌体分布与基因组进化研究
《疾病监测》2023年第5期516-521,共6页梁俊容 金东 杨晶 卢珊 熊衍文 叶长芸 徐建国 
国家重点研发计划项目(No.2021YFC0863400,No.2021YFC2302000);未知细菌发现与功能研究(No.2018RU010)。
目的前噬菌体是细菌基因组中重要可移动原件,在细菌毒力和宿主适应性方面发挥着重要作用。由噬菌体介导的福氏志贺菌血清型转化频繁发生,给志贺菌的监测、诊断和预防工作带来不便。为了探究我国福氏志贺菌基因组进化与其前噬菌体相关的...
关键词：福氏志贺菌 噬菌体 血清型转换 细菌基因组 进化 
改造细菌基因组的双重选择系统的构建
《合肥工业大学学报（自然科学版）》2022年第12期1699-1704,共6页李文静 杨桂霞 周贤轩 陈婷婷 石春红 
国家自然科学基金资助项目(31670120)。
对细菌基因的敲除与回补可以用于基因功能的研究和基因组的改造。传统的Red同源重组敲除系统依赖于抗性标记基因的正向选择,无法实现基因回补菌株的选择。文章通过构建具有独特优势的双重选择系统,将2种选择标记基因tetA和sacB构建到一...
关键词：大肠杆菌 同源重组 双重选择系统 基因敲除 基因回补 
pre-CTX_(φ)噬菌体在霍乱弧菌基因组中的遗传多样性研究被引量：4
《疾病监测》2022年第11期1403-1407,共5页郝彤宇 马嘉嘉 武雅蓉 钱修伟 张湘莉兰 崔玉军 
国家重点研发计划(No.2021YFC2302004)。
溶原性噬菌体CTX_(φ)携带的ctxAB基因是霍乱弧菌产毒株最主要的毒力基因,而pre-CTX_(φ)作为CTX_(φ)的前体,缺失ctxAB基因编码序列。基因组中整合了pre-CTX_(φ)噬菌体的霍乱弧菌非产毒株,可通过其携带的zot和ace基因,引起患者轻度至...
关键词：霍乱弧菌 pre-CTX_(φ) 拷贝数变异 细菌基因组 噬菌体 毒力因子 
美国康奈尔大学:利用工程菌提取稀土元素
《化工新型材料》2022年第10期101-101,共1页新型 
美国康奈尔大学的科学家们正在设计细菌以提取稀土元素,他们认为这一工艺可以取代目前使用的热化学方法。研究人员已经筛选了氧化葡萄糖杆菌,并进行了全基因组测序,以判断其生物浸出能力。这种细菌可以产出一种名为“生物浸出剂”的酸,...
关键词：稀土磷酸盐 全基因组测序 稀土元素 细菌基因组 数独 生物浸出 美国康奈尔大学 工程菌 
酱香型白酒发酵中地衣芽孢杆菌前噬菌体的鉴别
《微生物学通报》2022年第9期3567-3580,共14页傅文博 杜海 徐岩 
国家自然科学基金(32172176);国家重点研发计划(2018YFC1604100);江苏省自然科学基金(BK20201341)。
【背景】噬菌体是微生物群落的重要组成部分,但传统白酒发酵中噬菌体的分类和存在尚不清楚。【目的】通过检测公共数据库和酱香型白酒发酵中地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)基因组中的前噬菌体整合区域,探究传统酱香型白酒发酵中...
关键词：前噬菌体 地衣芽孢杆菌 细菌基因组 水平基因转移 酱香型白酒 
社区获得性致下肢气性坏疽ST660型肺炎克雷伯菌全基因组测序及毒力特征分析被引量：1
《中华检验医学杂志》2021年第9期814-820,共7页刘周 杭修兵 储雯雯 李昕 叶乃芳 周强 
安徽省自然科学基金(1908085QH366)。
目的对1株致下肢气性坏疽肺炎克雷伯菌(KPN)进行全基因组测序及毒力特性分析,为认识致社区获得性重症感染KPN分子毒力特征提供参考。方法患者于2018年3月13日进入急诊科治疗,主要临床症状为高热、左下肢气性坏疽及糖尿病酮症酸中毒。取...
关键词：克雷伯菌 肺炎 气性坏疽 细菌基因组 高通量核苷酸测序 毒力 
CRISPR-Cas9技术在细菌耐药性防控研究进展被引量：2
《微生物学报》2021年第8期2161-2171,共11页李培思 万鹏 李小申 崔世云 曾振灵 
国家自然科学基金(31872524)。
近年来,多种新型耐药基因的出现和全球性流行,严重威胁了全球公众健康。CRISPR-Cas9系统(clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR associated protein 9 system)是细菌的一种适应性免疫系统,可切割耐药基因...
关键词：CRISPR-Cas9系统 细菌耐药性 基因定向编辑 细菌基因组 质粒 
CRISPR系统相关Cas蛋白研究进展
《结核病与胸部肿瘤》2020年第4期328-335,共8页于佳佳 张旭霞 李传友 唐神结 刘毅 
首都卫生发展科研专项(首发2018-1-1041);通州两高人才运河计划(YH201804)。
规律成簇的间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)最早发现于20世纪80年代末到90年代初,研究者在细菌与古细菌基因组中观察到存在CRISPR。Cas(CRISPR-associated proteins)蛋白是在基...
关键词：RNA结合蛋白 规律成簇的间隔短回文重复序列 细菌基因组 DNA结合 模块化 
微滴式数字PCR评价保存时间和冻融对细菌基因组DNA稳定性的影响被引量：1
《生物技术通讯》2020年第5期571-575,579,共6页薛盼盼 张京云 
“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项(2018ZX10712001-014)。
目的:定量分析5个常用的保存温度下,保存时间和反复冻融对沙门菌和志贺菌基因组DNA的影响。方法:将沙门菌和志贺菌基因组DNA分别于室温(20~25℃)、4℃、-20℃、-40℃和-80℃保存10 d,其中3个冻存温度的核酸每天冻融1次;以微滴式数字PCR...
关键词：细菌基因组DNA 冻融 保存 微滴式数字PCR 沙门菌 志贺菌 
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