密码子使用

作品数:201被引量:716H指数:19
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杆状病毒与昆虫和沙雷氏菌间的几丁质酶基因密码子使用模式分析
《蚕业科学》2018年第2期264-269,共6页石生林 张莹 周敬林 刘彦群 秦利 
国家自然科学基金项目(No.31372372);现代农业产业技术体系建设专项(No.CARS-18)
为阐明杆状病毒几丁质酶基因(v-Chi A)密码子使用在病毒基因组进化的基因水平转移中发生的适应性变化,比较分析了杆状病毒v-Chi A与昆虫几丁质酶基因(Chi-h)、沙雷氏菌几丁质酶基因(Chi A)以及杆状病毒以lef-8、lef-9和polh/gran...
关键词:杆状病毒 几丁质酶基因 基因水平转移 密码子使用模式 
蓖麻蚕核型多角体病毒和柞蚕核型多角体病毒的密码子使用模式分析
《蚕业科学》2017年第1期77-83,共7页石生林 张莹 王国宝 王勇 刘彦群 杨瑞生 秦利 
现代农业产业技术体系建设专项(No.CARS-22);国家自然科学基金项目(No.31372372);辽宁省自然科学基金项目(No.2014027002)
蓖麻蚕核型多角体病毒(Phcy NPV)是柞蚕核型多角体病毒(Anpe NPV)的变种,不能感染柞蚕。通过病毒基因组GC含量、GC3s含量、有效密码子数、相对同义密码子使用度、密码子偏好参数的计算及ENc-plot分析、中性绘图分析、对应分析等,比较Phc...
关键词:蓖麻蚕核型多角体病毒 柞蚕核型多角体病毒 密码子偏好性 密码子使用模式 适应性 
昆虫共生菌沃尔巴克氏体(Wolbachia)的wsp基因密码子使用模式分析
《蚕业科学》2012年第1期109-115,共7页李苗苗 谌苗苗 姜义仁 石生林 刘彦群 秦利 
现代农业产业技术体系专项(No.CARS-22)
沃尔巴克氏体(Wolbachia)主要感染昆虫等节肢动物,是一类革兰阴性共生细菌。为探讨昆虫纲共生菌Wolbachia的系统发育,研究Wolbachia基因组中进化速度较快的外膜蛋白基因wsp的密码子使用模式及影响因素,统计分析该基因的GC含量(GCall、GC...
关键词:昆虫共生细菌 沃尔巴克氏体 外膜蛋白基因 碱基组成 密码子使用模式 
柞蚕核型多角体病毒和家蚕核型多角体病毒的同义密码子使用模式分析被引量:5
《蚕业科学》2011年第2期266-271,共6页李京生 杨瑞生 贾萍 石生林 刘彦群 潘敏慧 秦利 
现代农业产业技术体系建设专项(蚕桑);国家自然科学基金项目(No.30800803)
基因组中的基因和基因密码子组成不同使柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)与家蚕核型多角体病毒(BmNPV)间不能交叉感染。通过计算有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、GC含量、GC3s含量、密码子适应指数(CAI),比较分析ApNPV和BmNP...
关键词:柞蚕核型多角体病毒 家蚕核型多角体病毒 同义密码子 密码子偏好性 
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